Obrazy całych preparatów na komputerze

Przeglądarka do patologii cyfrowej do badań, dydaktyki i przeglądu

SlideScope to desktopowa przeglądarka do patologii cyfrowej na Windows i macOS. Otwieraj obrazy całych preparatów ze skanerów Aperio, Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana i Akoya w pełnej rozdzielczości, mierz w skalibrowanych mikrometrach, zachowuj adnotacje przypisane do preparatu, porównuj preparat H&E z jego ponownym barwieniem IHC obok siebie i wysyłaj współpracownikowi link, który otwiera dokładnie to pole widzenia, które właśnie oglądasz.

SVS, NDPI, MRXS, VSI, SCN, BIF, QPTIFF, DICOM Windows, Apple Silicon i Mac z procesorem Intel Wypróbuj bezpłatnie na przykładach

Co musi robić przeglądarka do patologii cyfrowej

Obraz całego preparatu to nie fotografia. Skaner rejestruje szkiełko w powiększeniu 20x lub 40x jako piramidę kafelków, która może mieć kilka gigabajtów i ponad 100 000 pikseli na bok. Przeglądarka, która próbuje wczytać to jako jeden obraz, zawodzi; przeglądarka, która rozumie piramidę, otwiera go w kilka sekund. Wszystko inne, czego potrzebuje zespół patologów, opiera się na tym.

Odczyt piramidy zapisanej przez skaner

SlideScope odczytuje poziomy rozdzielczości zapisane przez skaner, więc preparat SVS lub NDPI o rozmiarze 3 GB otwiera się na zwykłym laptopie, bez serwera obrazów, bez konwersji i bez wysyłania.

Pomiary w rzeczywistej skali

Wartość mikrometrów na piksel zapisana przez skaner napędza każdą linijkę i pomiar pola powierzchni, więc margines guza zmierzony przy 40x ma tę samą długość przy 5x.

Zachowanie kontekstu przeglądu

Adnotacje, zapisane obszary i notatki pozostają przypisane do preparatu i do Twojego konta, a udostępniony link do widoku otwiera to samo położenie, powiększenie i płaszczyznę na komputerze innej osoby.

Formaty obrazów całych preparatów obsługiwane przez SlideScope

Patologia cyfrowa jest podzielona według producentów skanerów. Każdy producent zapisuje własny kontener, a przeglądarka obsługująca tylko jeden z nich zmusza laboratorium do utrzymywania kolejnego narzędzia dla każdego innego skanera, z którego otrzymuje preparaty. SlideScope odczytuje następujące formaty producentów, większość z nich przez moduł OpenSlide, obok własnych modułów odczytu formatów mikroskopowych.

Skaner lub źródłoFormatUwagi
Aperio i Leica BiosystemsSVS, SVSLIDENajpopularniejszy format obrazów całych preparatów w archiwach badawczych. Otwiera się zarówno na Macu, jak i w Windows.
Hamamatsu NanoZoomerNDPI, NDPIS, VMS, VMUVMS i VMU przechowują piksele w plikach towarzyszących, więc otwierają się tylko z dysku lokalnego. Od wersji 1.10.0 zestawy fluorescencyjne NDPIS otwierają się z rzeczywistymi nazwami i kolorami kanałów, a także otwierają się preparaty NDPI skompresowane w JPEG XR. Od wersji 1.20.0 adnotacje narysowane w NDP.view (.ndpa) pojawiają się na preparacie i można je skopiować do swoich pomiarów.
3DHISTECH PannoramicMRXSWymaga pliku .mrxs i folderu o tej samej nazwie obok niego. Tylko z dysku lokalnego.
Olympus i Evident (cellSens)VSIOtwiera się bezpośrednio od wersji 1.10.0: skany całych preparatów i fluorescencyjne, także preparaty z kilkoma obszarami skanowania, z których każdy jest mierzony we własnym rozmiarze piksela.
Philips Ultra Fast Scanner i seria SGiSyntaxOtwiera się bezpośrednio od wersji 1.20.0, z etykietą preparatu i obrazem makro. SlideScope pokazuje zdekodowane piksele bez własnego wyostrzania i obróbki kolorów firmy Philips, więc preparat może wyglądać nieco inaczej niż w przeglądarce Philips.
KFBio KF-PROKFBPreparaty KFB w jasnym polu otwierają się bezpośrednio od wersji 1.20.0. Preparaty fluorescencyjne KFBF się nie otwierają.
Leica SCN400 i Aperio GTSCNOdczytywane przez moduł OpenSlide; od wersji 1.10.0 otwierają się też preparaty SCN, których OpenSlide nie potrafi odczytać.
Ventana i RocheBIFSkany w jasnym polu ze skanerów z rodziny iScan. Od wersji 1.10.0 otwierają się też preparaty BIF, których OpenSlide nie potrafi odczytać, choć szwy między ich kafelkami nie są jeszcze zszywane.
Akoya, PerkinElmer, VectraQPTIFFMultipleksowa immunofluorescencja z ustawieniami koloru i intensywności dla każdego kanału.
Agilent ARGOSAVSOdczytywane przez moduł OpenSlide.
Eksport z dowolnego skanera lub PACSDICOM, piramidalny TIFF, OME-TIFFEksporty niezależne od producenta, w tym serie DICOM obrazów całych preparatów.
Mikroskopy badawczeCZI, ND2, LIF, IMS, OIB i OIR, LSM, ZVI, LOF i XLEF, DeltaVision, MetaMorph, OME-ZarrPliki Zeiss, Nikon, konfokalne Leica i Imaris z tego samego projektu otwierają się w tym samym oknie. Moduły odczytu Olympus FluoView, Zeiss ZVI i LSM, Leica LOF i XLEF, DeltaVision, MetaMorph i OME-Zarr pojawiły się w wersji 1.10.0; OME-Zarr otwiera się tylko z folderów lokalnych.

Nieobsługiwane: SQRAY SDPC, Motic MDSX, UNIC TMAP i preparaty fluorescencyjne KFBio KFBF. Olympus/Evident VSI otwiera się bezpośrednio od wersji 1.10.0, a Philips iSyntax i KFBio KFB w jasnym polu od wersji 1.20.0. W przypadku formatów innych skanerów porównanie skanerów do patologii cyfrowej wymienia otwarte eksporty DICOM i TIFF, które te skanery potrafią zapisywać. Pełne zestawienie zgodności plików podaje rozszerzenia, wymiary i ograniczenia kodeków.

Narzędzia do przeglądu stworzone z myślą o pracy patologa

Porównanie obok siebie. Otwórz drugi preparat obok pierwszego, a oba panele pozostaną na tym samym obszarze w tym samym powiększeniu. Skala jest dopasowywana w mikrometrach, a nie według współczynnika powiększenia, więc preparat H&E zeskanowany przy 20x i jego ponowne barwienie IHC zeskanowane przy 40x naprawdę sobie odpowiadają. Przesunięcie lub powiększenie jednego panelu przesuwa drugi.

Skalibrowane pomiary i adnotacje. Linijki, pola powierzchni i numerowane znaczniki korzystają z rozmiaru piksela zapisanego przez skaner i pozostają przypisane do preparatu. Obszary i pomiary są eksportowane jako GeoJSON w pełnej rozdzielczości preparatu, który QuPath, ASAP i powiązane z nimi narzędzia w Pythonie odczytują bezpośrednio, oraz jako CSV z tabelami pomiarów.

Udostępniane linki do widoku. Link przenosi preparat razem z położeniem, powiększeniem i płaszczyzną. Zainstalowany SlideScope otwiera go jednym kliknięciem; osoba bez aplikacji najpierw zobaczy na stronie internetowej to, na co wskazuje link. Dzięki temu zdalny przegląd badawczy, dyskusje w stylu konsylium onkologicznego i dydaktyka są praktyczne bez serwera obrazów.

Local Quantification. Segmentuj jądra, komórki lub cząstki na swoim komputerze i otrzymuj skalibrowane liczebności, gęstość na milimetr kwadratowy, morfologię, średnią intensywność w każdym kanale i dodatniość markerów, z eksportem CSV, GeoJSON i masek TIFF. Piksele nigdy nie opuszczają komputera. Co ta funkcja robi, a czego nie, opisuje przewodnik po kwantyfikacji.

AI Analysis. Na Twoje żądanie SlideScope wysyła skompresowany widok bieżącego kadru i zwraca opis tego, co jest widoczne, prostym językiem, w 14 językach. Pyta o zgodę przed pierwszym wysłaniem i poza tym nigdy niczego nie wysyła, co opisano na stronie zaufanie i przetwarzanie danych.

Bezpłatne przeglądarki do patologii cyfrowej i kiedy SlideScope sprawdza się lepiej

Kilka dobrych przeglądarek nic nie kosztuje i ta strona mówi to wprost. Aperio ImageScope jest bezpłatny i dobrze odczytuje SVS, ale działa tylko na Windows, a Leica nie rozwija go już aktywnie. Hamamatsu NDP.view2 jest bezpłatny dla preparatów NDPI; odczyt formatów innych producentów wymaga płatnej edycji Plus. QuPath jest open source, wieloplatformowy i jest właściwym narzędziem do analizy skryptowej, kosztem trudniejszego startu dla osób, które chcą tylko oglądać preparaty. ObjectiveView to bezpłatna przeglądarka niezależna od producenta na Windows i Maca.

SlideScope sprawdza się lepiej, gdy laboratorium otrzymuje preparaty z więcej niż jednego skanera, ma użytkowników Maca, chce pomiarów i adnotacji, które przetrwają przekazanie dalej, musi porównywać dwa preparaty w dopasowanej skali albo chce wysłać współpracownikowi dokładne pole widzenia zamiast zrzutu ekranu. Porównanie ośmiu przeglądarek zestawia platformy, ceny, formaty i stan rozwoju, ze źródłami.

Kto używa SlideScope w patologii cyfrowej

  • Badawcze grupy patologiczne, które przeglądają zeskanowane kohorty, mierzą zmiany i zaznaczają obszary do dalszej analizy w QuPath.
  • Pracownie dydaktyczne prowadzące zajęcia z mikroskopii wirtualnej, na których każdy student otwiera ten sam zestaw preparatów na własnym laptopie z Windows lub Macu.
  • Pracownie aparaturowe (core facilities), które przekazują zeskanowane preparaty badaczom nieposiadającym oprogramowania producenta skanera.
  • Zespoły przedkliniczne i toksykologiczne, które otrzymują preparaty z laboratorium kontraktowego i potrzebują szybkiego drugiego spojrzenia bez systemu zarządzania obrazami.
  • Współpracownicy na Macu, którzy dostali plik SVS lub NDPI i nie mogą uruchomić ImageScope.

Krótkie odpowiedzi o SlideScope jako przeglądarce do patologii cyfrowej

Dla kogo najlepiej: zespoły badawcze, dydaktyczne i zajmujące się przeglądem, które otrzymują obrazy całych preparatów z różnych skanerów i pracują zarówno na Windows, jak i na macOS.

Główne zalety: obsługa obrazów całych preparatów niezależna od producenta, szybka nawigacja po piramidzie, skalibrowane pomiary, eksport GeoJSON do QuPath, porównanie obok siebie, udostępniane linki do widoku, kwantyfikacja na urządzeniu i opcjonalne objaśnienia AI.

Ważne ograniczenie: SlideScope nie jest wyrobem diagnostycznym ani systemem zarządzania obrazami. Nie obsługuje zarządzania przypadkami, raportowania ani skryptowych potoków analizy.

Cena: bezpłatna biblioteka przykładów ze wszystkimi narzędziami; własne obrazy wymagają subskrypcji: indywidualny plan miesięczny kosztuje $35.00 USD miesięcznie, płatne w chwili wykupienia subskrypcji. PayPal lub karta, a subskrypcję możesz anulować w każdej chwili na swoim koncie. Zobacz plany i ceny.

Ostatnia weryfikacja: 26 września 2026.

Pytania zadawane przez zespoły patologów

Czym jest przeglądarka do patologii cyfrowej?

Przeglądarka do patologii cyfrowej to oprogramowanie, które otwiera obrazy całych preparatów, czyli gigapikselowe skany szkiełek wykonane przez skaner preparatów, i pozwala je przesuwać i powiększać tak, jak przesuwa się preparat pod mikroskopem. Dobra przeglądarka odczytuje piramidę obrazu ze skanera, dzięki czemu preparat otwiera się w kilka sekund, podaje pomiary w skalibrowanych mikrometrach i zachowuje adnotacje przypisane do preparatu.

Jakie formaty obrazów całych preparatów otwiera SlideScope?

SlideScope otwiera obrazy całych preparatów Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, NDPIS, VMS i VMU, 3DHISTECH MRXS, Leica SCN, Ventana BIF, Olympus/Evident VSI, Philips iSyntax, KFBio KFB, Aperio SVSLIDE, Akoya i PerkinElmer QPTIFF oraz Agilent ARGOS AVS, a także DICOM, piramidalny TIFF i OME-TIFF. VSI i NDPIS otwierają się od wersji 1.10.0, iSyntax i KFB od wersji 1.20.0. Nie odczytuje SQRAY SDPC, Motic MDSX ani UNIC TMAP.

Czy SlideScope to bezpłatna przeglądarka do patologii cyfrowej?

SlideScope to płatna aplikacja desktopowa. Na wbudowanej bibliotece przykładów możesz zacząć bezpłatnie, ze wszystkimi narzędziami. Własne obrazy wymagają subskrypcji: indywidualny plan miesięczny kosztuje $35.00 USD miesięcznie, płatne w chwili wykupienia subskrypcji; PayPal lub karta. Możesz ją anulować w każdej chwili na swoim koncie. Bezpłatne przeglądarki, takie jak Aperio ImageScope (tylko Windows), Hamamatsu NDP.view2 (bezpłatny dla NDPI) i QuPath (open source), pozostają właściwym wyborem dla niektórych zespołów; porównanie przeglądarek obrazów całych preparatów na tej stronie wyjaśnia, kiedy.

Czy ta przeglądarka do patologii cyfrowej działa na Macu?

Tak. SlideScope ma natywne wersje dla Maców z Apple Silicon i Intel z macOS 14 lub nowszym, a także dla Windows 10 i 11. Aperio ImageScope działa tylko na Windows, dlatego wielu użytkowników Maca, którzy otrzymują pliki SVS, używa zamiast niego SlideScope.

Czy SlideScope można używać do diagnostyki klinicznej?

Nie. SlideScope to przeglądarka do patologii cyfrowej przeznaczona do badań naukowych, dydaktyki i przeglądu. Nie jest wyrobem medycznym i nie jest dopuszczony do diagnostyki podstawowej. Wdrożenie kliniczne powinno być zgodne z wymaganiami walidacyjnymi i regulacyjnymi Twojej instytucji.

Kiedy SlideScope to dobry wybór

Wybierz SlideScope, jeśli chcesz jednej natywnej aplikacji desktopowej na Maca lub komputer z Windows, która otwiera preparaty i pliki mikroskopowe wielu producentów (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM i inne), mierzy w skalibrowanych jednostkach i liczy jądra oraz komórki bez pisania kodu, a każdy plik pozostaje na Twoim komputerze.

To płatna aplikacja z bezpłatną biblioteką przykładów: wszystkie narzędzia działają na wbudowanych przykładach, a własne obrazy wymagają subskrypcji (PayPal lub karta). Jeśli na Windows otwierasz tylko format jednego producenta, darmowa przeglądarka tego producenta może w zupełności wystarczyć; do analizy skryptowej QuPath i Fiji są bezpłatne i open source.

Wypróbuj SlideScope na własnych obrazach całych preparatów

Bezpłatna biblioteka przykładów obejmuje wszystkie narzędzia, a aplikacja bezpłatnie sprawdza, czy Twoje własne pliki się otwierają, więc przed podjęciem decyzji możesz przetestować nawigację po piramidzie, dokładność pomiarów, porównanie obok siebie i przekazywanie danych do QuPath na prawdziwych zeskanowanych preparatach.

Pobierz SlideScope