Celoplošné snímky na desktopu

Prohlížeč pro digitální patologii pro výzkum, výuku a revizi

SlideScope je desktopový prohlížeč pro digitální patologii pro Windows a macOS. Otevírejte celoplošné snímky ze skenerů Aperio, Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana a Akoya v plném rozlišení, měřte v kalibrovaných mikrometrech, mějte anotace trvale připojené k preparátu, porovnávejte H&E s jeho IHC dobarvením vedle sebe a pošlete kolegovi odkaz, který otevře přesně to zorné pole, na které se právě díváte.

SVS, NDPI, MRXS, VSI, SCN, BIF, QPTIFF, DICOM Windows, Mac s Apple Silicon i Intel Vyzkoušejte zdarma na ukázkách

Co musí prohlížeč pro digitální patologii umět

Celoplošný snímek není fotografie. Skener zachytí skleněný preparát při 20x nebo 40x jako pyramidu dlaždic, která může mít několik gigabajtů a přes 100 000 pixelů na stranu. Prohlížeč, který se ho pokusí načíst jako jeden obraz, selže; prohlížeč, který pyramidě rozumí, ho otevře během několika sekund. Na tom stojí vše ostatní, co patologický tým potřebuje.

Čte pyramidu ze skeneru

SlideScope čte úrovně rozlišení, které zapsal skener, takže se 3GB preparát SVS nebo NDPI otevře na běžném notebooku bez obrazového serveru, bez převodu a bez nahrávání.

Měří ve skutečném měřítku

Hodnota mikrometrů na pixel zaznamenaná skenerem řídí každé měření délky i plochy, takže okraj nádoru změřený při 40x ukáže stejnou vzdálenost i při 5x.

Zachovává kontext revize

Anotace, uložené oblasti a poznámky zůstávají připojené k preparátu a k vašemu účtu a sdílený odkaz na zobrazení otevře stejnou pozici, zvětšení a rovinu i na počítači někoho jiného.

Formáty celoplošných snímků, které SlideScope otevírá

Digitální patologie je roztříštěná podle výrobců skenerů. Každý výrobce zapisuje vlastní kontejner a prohlížeč, který čte jen jeden z nich, nutí laboratoř držet další nástroj pro každý další skener, ze kterého dostává preparáty. SlideScope čte následující formáty výrobců, většinu přes backend OpenSlide, vedle svých nativních čteček mikroskopických formátů.

Skener nebo zdrojFormátPoznámky
Aperio a Leica BiosystemsSVS, SVSLIDENejběžnější formát celoplošných snímků ve výzkumných archivech. Otevírá se na Macu i ve Windows.
Hamamatsu NanoZoomerNDPI, NDPIS, VMS, VMUVMS a VMU ukládají pixely v doprovodných souborech, takže se otevírají jen z místního úložiště. Od verze 1.10.0 se fluorescenční sady NDPIS otevírají se skutečnými názvy a barvami kanálů a otevírají se i preparáty NDPI komprimované pomocí JPEG XR. Od verze 1.20.0 se nad preparátem zobrazují anotace nakreslené v NDP.view (.ndpa) a lze je zkopírovat do vašich měření.
3DHISTECH PannoramicMRXSVyžaduje soubor .mrxs a stejnojmennou složku vedle sebe. Pouze z místního úložiště.
Olympus a Evident (cellSens)VSIOtevírá se přímo od verze 1.10.0: celoplošné i fluorescenční skeny, včetně preparátů s několika naskenovanými oblastmi, z nichž každá se měří ve své vlastní velikosti pixelu.
Philips Ultra Fast Scanner a řada SGiSyntaxOtevírá se přímo od verze 1.20.0, se štítkem preparátu a makrosnímkem. SlideScope zobrazuje dekódované pixely bez vlastního doostření a barevného zpracování od Philips, takže preparát může vypadat mírně jinak než v prohlížeči Philips.
KFBio KF-PROKFBPreparáty KFB ve světlém poli se otevírají přímo od verze 1.20.0. Fluorescenční preparáty KFBF se neotevírají.
Leica SCN400 a Aperio GTSCNČte se přes backend OpenSlide; od verze 1.10.0 se otevírají i preparáty SCN, které OpenSlide přečíst nedokáže.
Ventana a RocheBIFSkeny ve světlém poli z řady iScan. Od verze 1.10.0 se otevírají i preparáty BIF, které OpenSlide přečíst nedokáže, jejich švy mezi dlaždicemi ale zatím nejsou sešité.
Akoya, PerkinElmer, VectraQPTIFFMultiplexní imunofluorescence s ovládáním barvy a intenzity pro každý kanál.
Agilent ARGOSAVSČte se přes backend OpenSlide.
Export z libovolného skeneru nebo PACSDICOM, pyramidový TIFF, OME-TIFFExporty nezávislé na výrobci, včetně sérií DICOM pro celoplošné zobrazování.
Výzkumné mikroskopyCZI, ND2, LIF, IMS, OIB a OIR, LSM, ZVI, LOF a XLEF, DeltaVision, MetaMorph, OME-ZarrSoubory ze Zeiss, Nikon, konfokálních mikroskopů Leica a Imaris ze stejného projektu se otevírají ve stejném okně. Čtečky pro Olympus FluoView, Zeiss ZVI a LSM, Leica LOF a XLEF, DeltaVision, MetaMorph a OME-Zarr přibyly ve verzi 1.10.0; OME-Zarr se otevírá jen z místních složek.

Nepodporováno: SQRAY SDPC, Motic MDSX, UNIC TMAP a fluorescenční preparáty KFBio KFBF. Olympus/Evident VSI se otevírá přímo od verze 1.10.0, Philips iSyntax a KFBio KFB ve světlém poli od verze 1.20.0. U formátů jiných skenerů uvádí srovnání skenerů pro digitální patologii otevřené exporty DICOM a TIFF, které tyto skenery umějí zapsat. Úplný přehled kompatibility souborů uvádí přípony, rozměry a omezení kodeků.

Nástroje pro revizi vytvořené pro práci v patologii

Srovnání vedle sebe. Otevřete druhý preparát vedle prvního a oba panely zůstanou na stejné oblasti při stejném zvětšení. Měřítko se sjednocuje v mikrometrech, ne podle faktoru přiblížení, takže H&E naskenované při 20x a jeho IHC dobarvení naskenované při 40x si skutečně odpovídají. Posouvání nebo přibližování v jednom panelu pohne i druhým.

Kalibrované měření a anotace. Měřítka, plochy a číslované značky používají velikost pixelu ze skeneru a zůstávají připojené k preparátu. Oblasti a měření se exportují jako GeoJSON v plném rozlišení preparátu, který QuPath, ASAP a pythonové nástroje kolem nich čtou přímo, a jako CSV pro tabulky měření.

Sdílené odkazy na zobrazení. Odkaz nese preparát spolu s pozicí, zvětšením a rovinou. Nainstalovaný SlideScope ho otevře jedním kliknutím; kdo aplikaci nemá, uvidí nejprve na webu, na co odkaz ukazuje. Díky tomu je vzdálená výzkumná revize, diskuse ve stylu tumor boardu i výuka praktická bez obrazového serveru.

Local Quantification. Segmentujte jádra, buňky nebo částice ve vlastním počítači a získejte kalibrované počty, hustotu na čtvereční milimetr, morfologii, střední intenzitu po kanálech a pozitivitu markerů, s exportem do CSV, GeoJSON a TIFF masky. Pixely nikdy neopustí počítač. Co funkce umí a co ne, popisuje průvodce kvantifikací.

AI Analysis. Na vyžádání SlideScope odešle komprimovaný náhled aktuálního zobrazení a vrátí srozumitelné vysvětlení toho, co je vidět, ve 14 jazycích. Před prvním nahráním se zeptá a jinak nikdy nic neodesílá, jak je popsáno na stránce důvěra a nakládání s daty.

Bezplatné prohlížeče pro digitální patologii a kdy je SlideScope lepší volbou

Několik schopných prohlížečů je zdarma a tento web to otevřeně říká. Aperio ImageScope je zdarma a SVS čte dobře, je ale jen pro Windows a Leica ho už aktivně nevyvíjí. Hamamatsu NDP.view2 je zdarma pro preparáty NDPI; čtení formátů jiných výrobců vyžaduje placenou edici Plus. QuPath je open source, multiplatformní a správný nástroj pro skriptovanou analýzu, za cenu strmější křivky učení pro ty, kdo si preparáty potřebují jen prohlédnout. ObjectiveView je bezplatný prohlížeč nezávislý na výrobci pro Windows a Mac.

SlideScope je lepší volbou, když laboratoř dostává preparáty z více než jednoho skeneru, má uživatele Maců, chce měření a anotace, které přežijí předání, potřebuje porovnat dva preparáty ve stejném měřítku nebo chce spolupracovníkovi poslat přesné zorné pole místo snímku obrazovky. Srovnání osmi prohlížečů uvádí platformu, cenu, formáty a stav údržby, s doloženými zdroji.

Kdo používá SlideScope pro digitální patologii

  • Výzkumné patologické skupiny, které procházejí naskenované kohorty, měří léze a označují oblasti pro navazující analýzu v QuPath.
  • Výukové laboratoře vedoucí kurzy virtuální mikroskopie, kde každý student otevírá stejnou sadu preparátů na vlastním notebooku s Windows nebo na Macu.
  • Servisní pracoviště (core facilities), která předávají naskenované preparáty zpět řešitelům, kteří nemají software výrobce skeneru.
  • Preklinické a toxikologické týmy, které dostávají preparáty ze smluvní laboratoře a potřebují rychlý druhý pohled bez systému pro správu obrazových dat.
  • Spolupracovníci na Macu, kterým někdo poslal soubor SVS nebo NDPI a kteří nemohou spustit ImageScope.

Rychlé odpovědi o SlideScope jako prohlížeči pro digitální patologii

Nejvhodnější pro: výzkumné, výukové a revizní týmy, které dostávají celoplošné snímky z různých skenerů a pracují ve Windows i macOS.

Hlavní přednosti: podpora celoplošných snímků nezávislá na výrobci, rychlá navigace po pyramidě, kalibrované měření, export GeoJSON pro QuPath, srovnání vedle sebe, sdílené odkazy na zobrazení, kvantifikace přímo v zařízení a volitelná vysvětlení pomocí AI.

Důležité omezení: SlideScope není diagnostický prostředek ani systém pro správu obrazových dat. Neprovádí správu případů, tvorbu nálezových zpráv ani skriptované analytické pipeline.

Cena: bezplatná knihovna ukázek se všemi nástroji; pro vlastní snímky potřebujete předplatné: individuální měsíční plán stojí $35.00 USD měsíčně, účtované při předplacení. PayPal nebo karta, a zrušit ho můžete kdykoli ve svém účtu. Viz plány a ceny.

Naposledy zkontrolováno: 26. září 2026.

Otázky, které kladou patologické týmy

Co je prohlížeč pro digitální patologii?

Prohlížeč pro digitální patologii je software, který otevírá celoplošné snímky, tedy gigapixelové skeny, které skener preparátů vytvoří ze skleněného preparátu, a umožňuje je posouvat a přibližovat podobně, jako byste posouvali preparát pod mikroskopem. Dobrý prohlížeč čte obrazovou pyramidu ze skeneru, takže se preparát otevře během několika sekund, uvádí měření v kalibrovaných mikrometrech a udržuje anotace připojené k preparátu.

Které formáty celoplošných snímků SlideScope otevře?

SlideScope otevírá celoplošné snímky Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, NDPIS, VMS a VMU, 3DHISTECH MRXS, Leica SCN, Ventana BIF, Olympus/Evident VSI, Philips iSyntax, KFBio KFB, Aperio SVSLIDE, Akoya a PerkinElmer QPTIFF a Agilent ARGOS AVS, a navíc DICOM, pyramidový TIFF a OME-TIFF. VSI a NDPIS se otevírají od verze 1.10.0, iSyntax a KFB od verze 1.20.0. Nečte SQRAY SDPC, Motic MDSX ani UNIC TMAP.

Je SlideScope bezplatný prohlížeč pro digitální patologii?

SlideScope je placená desktopová aplikace. Začít můžete zdarma na vestavěné knihovně ukázek, se všemi nástroji. Pro vlastní snímky potřebujete předplatné: individuální měsíční plán stojí $35.00 USD měsíčně, účtované při předplacení; PayPal nebo karta. Zrušit ho můžete kdykoli ve svém účtu. Bezplatné prohlížeče jako Aperio ImageScope (jen Windows), Hamamatsu NDP.view2 (zdarma pro NDPI) a QuPath (open source) zůstávají pro některé týmy správnou volbou; kdy to platí, vysvětluje srovnání prohlížečů celoplošných snímků na tomto webu.

Funguje prohlížeč pro digitální patologii na Macu?

Ano. SlideScope nabízí nativní sestavení pro Macy s Apple Silicon i Intel s macOS 14 a novějším a také pro Windows 10 a 11. Aperio ImageScope je jen pro Windows, a proto mnoho uživatelů Maců, kteří dostávají soubory SVS, používá místo něj SlideScope.

Lze SlideScope použít pro klinickou diagnostiku?

Ne. SlideScope je prohlížeč pro digitální patologii určený pro výzkum, vzdělávání a revizi. Není to zdravotnický prostředek a není schválen pro primární diagnostiku. Klinické nasazení by se mělo řídit validačními a regulačními požadavky vaší instituce.

Kdy je SlideScope správná volba

Zvolte SlideScope, pokud chcete jednu nativní desktopovou aplikaci pro Mac nebo počítač s Windows, která otevře preparáty a mikroskopické soubory od mnoha výrobců (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM a další), měří v kalibrovaných jednotkách a počítá jádra a buňky bez psaní kódu, přičemž všechny soubory zůstávají ve vašem počítači.

Jde o placenou aplikaci s bezplatnou knihovnou ukázek: všechny nástroje fungují na vestavěných ukázkách, pro vlastní snímky potřebujete předplatné (PayPal nebo karta). Pokud ve Windows otevíráte jen formát jednoho výrobce, může vám stačit bezplatný prohlížeč tohoto výrobce; pro skriptovanou analýzu jsou QuPath a Fiji zdarma a open source.

Vyzkoušejte SlideScope na vlastních celoplošných snímcích

Bezplatná knihovna ukázek zahrnuje všechny nástroje a aplikace zdarma ověří, zda se vaše vlastní soubory otevřou, takže si navigaci po pyramidě, přesnost měření, srovnání vedle sebe i předání do QuPath můžete vyzkoušet na skutečných naskenovaných preparátech dřív, než se rozhodnete.

Stáhnout SlideScope