הדמיית שקופית מלאה במחשב

מציג פתולוגיה דיגיטלית למחקר, להוראה ולסקירה

SlideScope הוא מציג פתולוגיה דיגיטלית למחשב, ל-Windows ול-macOS. פתחו תמונות שקופית מלאה מסורקים של Aperio,‏ Hamamatsu,‏ 3DHISTECH,‏ Leica,‏ Ventana ו-Akoya ברזולוציה מלאה, מדדו במיקרומטרים מכוילים, שמרו את ההערות מחוברות לשקופית, השוו צביעת H&E לצביעה החוזרת שלה ב-IHC זו לצד זו, ושלחו לעמית קישור שפותח בדיוק את שדה הראייה שאתם מסתכלים בו.

SVS, NDPI, MRXS, VSI, SCN, BIF, QPTIFF, DICOM Windows, ‏Mac עם Apple Silicon ועם Intel נסו בחינם על הדוגמאות

מה מציג פתולוגיה דיגיטלית צריך לעשות

תמונת שקופית מלאה אינה צילום. סורק מצלם שקופית זכוכית ב-20x או ב-40x כפירמידה של אריחים שיכולה להגיע לכמה ג'יגה-בייט וליותר מ-100,000 פיקסלים בכל צלע. מציג שמנסה לטעון אותה כתמונה אחת נכשל; מציג שמבין את הפירמידה פותח אותה בתוך שניות. כל השאר שצוות פתולוגיה צריך נבנה על הבסיס הזה.

קריאת הפירמידה של הסורק

SlideScope קורא את רמות הרזולוציה שהסורק כתב, כך ששקופית SVS או NDPI של 3 GB נפתחת במחשב נייד רגיל, בלי שרת תמונות, בלי שלב המרה ובלי העלאה.

מדידה בקנה מידה אמיתי

ערך המיקרונים לפיקסל שהסורק תיעד קובע כל סרגל וכל מדידת שטח, כך ששוליים של גידול שנמדדו ב-40x מראים את אותו מרחק גם ב-5x.

שמירה על הקשר הסקירה

הערות, אזורים שמורים ורשימות נשארים מחוברים לשקופית ולחשבון שלכם, וקישור תצוגה משותף פותח מחדש את אותו מיקום, זום ומישור במחשב של מישהו אחר.

פורמטים של תמונות שקופית מלאה ש-SlideScope פותח

הפתולוגיה הדיגיטלית מפוצלת לפי יצרני סורקים. כל יצרן כותב מכל משלו, ומציג שקורא רק אחד מהם מחייב את המעבדה להחזיק כלי נוסף לכל סורק אחר שממנו היא מקבלת שקופיות. SlideScope קורא את פורמטי היצרנים הבאים, את רובם דרך מנוע OpenSlide, לצד קוראי המיקרוסקופיה המקוריים שלו.

סורק או מקורפורמטהערות
Aperio ו-Leica BiosystemsSVS, SVSLIDEפורמט השקופית המלאה הנפוץ ביותר בארכיוני מחקר. נפתח ב-Mac וגם ב-Windows.
Hamamatsu NanoZoomerNDPI, NDPIS, VMS, VMUVMS ו-VMU שומרים את הפיקסלים בקבצים נלווים, ולכן הם נפתחים מאחסון מקומי בלבד. מאז 1.10.0, סטים של פלואורסצנציה NDPIS נפתחים עם שמות הערוצים והצבעים האמיתיים שלהם, וגם שקופיות NDPI בדחיסת JPEG XR נפתחות. מאז 1.20.0, הערות שצוירו ב-NDP.view ‏(.ndpa) מופיעות מעל השקופית ואפשר להעתיק אותן למדידות שלכם.
3DHISTECH PannoramicMRXSדורש את קובץ ה-‎.mrxs ואת התיקייה בעלת אותו שם זה לצד זה. אחסון מקומי בלבד.
Olympus ו-Evident ‏(cellSens)VSIנפתח ישירות מאז 1.10.0: סריקות של שקופיות מלאות ושל פלואורסצנציה, כולל שקופיות עם כמה אזורי סריקה, שכל אחד מהם נמדד לפי גודל הפיקסל שלו.
Philips Ultra Fast Scanner וסדרת SGiSyntaxנפתח ישירות מאז 1.20.0, עם תווית השקופית ותמונת המאקרו. SlideScope מציג את הפיקסלים המפוענחים בלי עיבודי החידוד והצבע של Philips עצמה, ולכן שקופית עשויה להיראות מעט שונה מאשר במציג של Philips.
KFBio KF-PROKFBשקופיות KFB בשדה בהיר נפתחות ישירות מאז 1.20.0. שקופיות פלואורסצנציה KFBF לא נפתחות.
Leica SCN400 ו-Aperio GTSCNנקרא דרך מנוע OpenSlide; מאז 1.10.0 נפתחות גם שקופיות SCN ש-OpenSlide לא יכול לקרוא.
Ventana ו-RocheBIFסריקות שדה בהיר ממשפחת iScan. מאז 1.10.0 נפתחות גם שקופיות BIF ש-OpenSlide לא יכול לקרוא, אם כי התפרים בין האריחים שלהן עדיין לא מחוברים.
Akoya,‏ PerkinElmer,‏ VectraQPTIFFאימונופלואורסצנציה מרובת סמנים (multiplex) עם בקרות צבע ועוצמה לכל ערוץ.
Agilent ARGOSAVSנקרא דרך מנוע OpenSlide.
כל ייצוא מסורק או מ-PACSDICOM,‏ TIFF פירמידלי, OME-TIFFייצואים שאינם תלויים ביצרן, כולל סדרות DICOM של הדמיית שקופית מלאה.
מיקרוסקופי מחקרCZI,‏ ND2,‏ LIF,‏ IMS,‏ OIB ו-OIR,‏ LSM,‏ ZVI,‏ LOF ו-XLEF,‏ DeltaVision,‏ MetaMorph,‏ OME-Zarrקובצי Zeiss,‏ Nikon, קונפוקל של Leica ו-Imaris מאותו פרויקט נפתחים באותו חלון. הקוראים של Olympus FluoView,‏ Zeiss ZVI ו-LSM,‏ Leica LOF ו-XLEF,‏ DeltaVision,‏ MetaMorph ו-OME-Zarr נוספו ב-1.10.0; ‏OME-Zarr נפתח מתיקיות מקומיות בלבד.

לא נתמכים: SQRAY SDPC,‏ Motic MDSX,‏ UNIC TMAP ושקופיות פלואורסצנציה KFBio KFBF. ‏Olympus/Evident VSI נפתח ישירות מאז גרסה 1.10.0, ו-Philips iSyntax ו-KFBio KFB בשדה בהיר מאז גרסה 1.20.0. עבור פורמטים של סורקים אחרים, השוואת סורקי הפתולוגיה הדיגיטלית מפרטת את ייצואי ה-DICOM וה-TIFF הפתוחים שהסורקים האלה יכולים לכתוב. מדריך תאימות הקבצים המלא מפרט סיומות, ממדים ומגבלות codec.

כלי סקירה שנבנו לעבודת פתולוגיה

השוואה זו לצד זו. פתחו שקופית שנייה לצד הראשונה, ושתי החלוניות נשארות על אותו אזור באותה הגדלה. קנה המידה מותאם במיקרומטרים ולא לפי מקדם הזום, כך שצביעת H&E שנסרקה ב-20x והצביעה החוזרת שלה ב-IHC שנסרקה ב-40x באמת תואמות זו לזו. הזזה או זום בחלונית אחת מזיזים גם את השנייה.

מדידה והערות מכוילות. סרגלים, שטחים וסמנים ממוספרים משתמשים בגודל הפיקסל של הסורק ונשארים מחוברים לשקופית. אזורים ומדידות מיוצאים כ-GeoJSON ברזולוציית השקופית המלאה, ש-QuPath,‏ ASAP וכלי ה-Python שסביבם קוראים ישירות, וכ-CSV לטבלאות מדידה.

קישורי תצוגה משותפים. קישור נושא את השקופית יחד עם המיקום, הזום והמישור. עותקים מותקנים של SlideScope פותחים אותו בלחיצה אחת; מי שאין לו את האפליקציה רואה קודם באתר את מה שהקישור מפנה אליו. זה מה שהופך סקירה מחקרית מרחוק, דיונים בסגנון ישיבת גידולים (tumour board) והוראה למעשיים, בלי שרת תמונות.

Local Quantification. בצעו סגמנטציה של גרעינים, תאים או חלקיקים במחשב שלכם וקבלו ספירות מכוילות, צפיפות למילימטר רבוע, מורפולוגיה, עוצמה ממוצעת לכל ערוץ וחיוביות לסמנים, עם ייצוא CSV,‏ GeoJSON ו-TIFF של מסכות. הפיקסלים אף פעם לא יוצאים מהמחשב. ראו את מדריך הכימות כדי לדעת מה הוא עושה ומה לא.

AI Analysis. לפי בקשה, SlideScope שולח תצוגה דחוסה של המסגרת הנוכחית ומחזיר הסבר בשפה פשוטה של מה שנראה בה, ב-14 שפות. הוא שואל לפני ההעלאה הראשונה ולא שולח שום דבר אחרת, כפי שמתועד בדף אמון וטיפול בנתונים.

מציגי פתולוגיה דיגיטלית חינמיים, ומתי SlideScope מתאים יותר

כמה מציגים טובים לא עולים כלום, והאתר הזה אומר את זה בפשטות. Aperio ImageScope חינמי וקורא SVS היטב, אבל הוא פועל רק ב-Windows ו-Leica כבר לא מפתחת אותו באופן פעיל. Hamamatsu NDP.view2 חינמי לשקופיות NDPI; קריאת פורמטים של יצרנים אחרים דורשת את מהדורת Plus בתשלום. QuPath הוא קוד פתוח, פועל בכמה פלטפורמות והוא הכלי הנכון לניתוח מבוסס סקריפטים, במחיר עקומת למידה תלולה יותר לאנשים שרק צריכים להסתכל בשקופיות. ObjectiveView הוא מציג חינמי שאינו תלוי ביצרן, ל-Windows ול-Mac.

SlideScope מתאים יותר כשהמעבדה מקבלת שקופיות מיותר מסורק אחד, יש בה משתמשי Mac, היא רוצה מדידות והערות ששורדות העברה הלאה, צריכה להשוות שתי שקופיות בקנה מידה תואם, או רוצה לשלוח לשותף לעבודה שדה ראייה מדויק במקום צילום מסך. ההשוואה בין שמונה מציגים מפרטת פלטפורמה, מחיר, פורמטים ומצב תחזוקה, עם מקורות.

מי משתמש ב-SlideScope לפתולוגיה דיגיטלית

  • קבוצות מחקר בפתולוגיה שסוקרות קוהורטות סרוקות, מודדות נגעים ומסמנות אזורים לניתוח בהמשך ב-QuPath.
  • מעבדות הוראה שמעבירות קורסים של מיקרוסקופיה וירטואלית, שבהם כל סטודנט פותח את אותו סט שקופיות במחשב הנייד שלו, Windows או Mac.
  • יחידות ליבה (core facilities) שמחזירות שקופיות סרוקות לחוקרים שאין להם את התוכנה של יצרן הסורק.
  • צוותים פרה-קליניים וטוקסיקולוגיים שמקבלים שקופיות ממעבדת קבלן וצריכים מבט שני מהיר בלי מערכת לניהול תמונות.
  • שותפים לעבודה ב-Mac שקיבלו קובץ SVS או NDPI ולא יכולים להריץ את ImageScope.

תשובות מהירות על SlideScope כמציג פתולוגיה דיגיטלית

מתאים במיוחד ל: צוותי מחקר, חינוך וסקירה שמקבלים תמונות שקופית מלאה מסורקים שונים ועובדים גם ב-Windows וגם ב-macOS.

חוזקות עיקריות: תמיכה בתמונות שקופית מלאה שאינה תלויה ביצרן, ניווט מהיר בפירמידה, מדידה מכוילת, ייצוא GeoJSON ל-QuPath, השוואה זו לצד זו, קישורי תצוגה משותפים, כימות על המכשיר והסברים אופציונליים בעזרת AI.

מגבלה חשובה: SlideScope אינו מכשיר אבחוני ואינו מערכת לניהול תמונות. הוא לא מבצע ניהול מקרים, כתיבת דוחות או צינורות ניתוח מבוססי סקריפטים.

מחיר: ספריית דוגמאות חינמית עם כל הכלים; התמונות שלכם דורשות מנוי: התוכנית החודשית האישית היא $35.00 USD לחודש, בחיוב ברגע ההרשמה. PayPal או כרטיס, ואפשר לבטל בכל עת מהחשבון. ראו תוכניות ומחירים.

נבדק לאחרונה: 26 בספטמבר 2026.

שאלות שצוותי פתולוגיה שואלים

מהו מציג פתולוגיה דיגיטלית?

מציג פתולוגיה דיגיטלית הוא תוכנה שפותחת תמונות שקופית מלאה, הסריקות של ג'יגה-פיקסלים שסורק שקופיות מפיק משקופית זכוכית, ומאפשרת להזיז ולהתקרב בהן כמו שמזיזים שקופית מתחת למיקרוסקופ. מציג טוב קורא את פירמידת התמונה של הסורק כך שהשקופית נפתחת בתוך שניות, מדווח על מדידות במיקרומטרים מכוילים ושומר את ההערות מחוברות לשקופית.

אילו פורמטים של תמונות שקופית מלאה SlideScope פותח?

SlideScope פותח תמונות שקופית מלאה בפורמטים Aperio SVS,‏ Hamamatsu NDPI,‏ NDPIS,‏ VMS ו-VMU,‏ 3DHISTECH MRXS,‏ Leica SCN,‏ Ventana BIF,‏ Olympus/Evident VSI,‏ Philips iSyntax,‏ KFBio KFB,‏ Aperio SVSLIDE,‏ QPTIFF של Akoya ו-PerkinElmer ו-Agilent ARGOS AVS, וגם DICOM,‏ TIFF פירמידלי ו-OME-TIFF. ‏VSI ו-NDPIS נפתחים מאז גרסה 1.10.0, ו-iSyntax ו-KFB מאז גרסה 1.20.0. הוא אינו קורא SQRAY SDPC,‏ Motic MDSX או UNIC TMAP.

האם SlideScope הוא מציג פתולוגיה דיגיטלית חינמי?

SlideScope היא אפליקציה למחשב בתשלום. היא מתחילה בחינם עם ספריית הדוגמאות המובנית, עם כל הכלים. התמונות שלכם דורשות מנוי: התוכנית החודשית האישית היא $35.00 USD לחודש, בחיוב ברגע ההרשמה; PayPal או כרטיס. אפשר לבטל בכל עת מהחשבון. מציגים חינמיים כמו Aperio ImageScope ‏(Windows בלבד), Hamamatsu NDP.view2 ‏(חינמי ל-NDPI) ו-QuPath ‏(קוד פתוח) נשארים הבחירה הנכונה לחלק מהצוותים; השוואת מציגי תמונות השקופית המלאה באתר הזה מסבירה מתי.

האם מציג הפתולוגיה הדיגיטלית עובד ב-Mac?

כן. SlideScope מספק גרסאות מקוריות למחשבי Mac עם Apple Silicon ועם Intel ב-macOS 14 ואילך, וגם ל-Windows 10 ו-11. ‏Aperio ImageScope פועל רק ב-Windows, ולכן משתמשי Mac רבים שמקבלים קובצי SVS משתמשים ב-SlideScope במקומו.

האם אפשר להשתמש ב-SlideScope לאבחון קליני?

לא. SlideScope הוא מציג פתולוגיה דיגיטלית למחקר, לחינוך ולסקירה. הוא אינו מכשיר רפואי ואינו מאושר לאבחון ראשוני. פריסה קלינית צריכה לעמוד בדרישות התיקוף והרגולציה של המוסד שלכם.

מתי SlideScope הוא הבחירה הנכונה

בחרו ב-SlideScope כשאתם רוצים אפליקציה מקורית אחת למחשב, ב-Mac או ב-PC עם Windows, שפותחת שקופיות וקובצי מיקרוסקופיה מיצרנים רבים (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM ועוד), מודדת ביחידות מכוילות וסופרת גרעינים ותאים בלי לכתוב קוד, כשכל קובץ נשאר במחשב שלכם.

זוהי אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית: כל כלי עובד על הדוגמאות המובנות, והתמונות שלכם דורשות מנוי (PayPal או כרטיס). אם אתם פותחים רק פורמט של יצרן אחד ב-Windows, ייתכן שהמציג החינמי של אותו יצרן הוא כל מה שאתם צריכים; לניתוח מבוסס סקריפטים, QuPath ו-Fiji הם חינמיים וקוד פתוח.

נסו את SlideScope על תמונות השקופית המלאה שלכם

ספריית הדוגמאות החינמית כוללת את כל הכלים, והאפליקציה בודקת בחינם אם הקבצים שלכם נפתחים, כך שאפשר לבדוק ניווט בפירמידה, דיוק מדידה, השוואה זו לצד זו והעברה ל-QuPath על שקופיות סרוקות אמיתיות לפני שמחליטים.

הורדת SlideScope