програма для перегляду мікроскопічних зображень

Як відкрити файли IMS

Відкривайте файли Imaris IMS (Bitplane, тепер Oxford Instruments) у SlideScope на Windows або macOS без перетворення. Канали відкриваються з кольорами й діапазонами відображення, збереженими у файлі, фокальні площини подано в µm, часові точки — у секундах, а стиснені файли IMS теж відкриваються. SlideScope читає рівень файлу з повною роздільною здатністю. Локальний перегляд не завантажує зображення на сервер.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Як відкрити файли IMS

  1. Завантажте версію для свого комп’ютера Windows або Mac і встановіть її. Для безкоштовного попереднього перегляду обліковий запис не потрібен.
  2. Відкрийте SlideScope і перетягніть файл .ims у вікно перегляду.
  3. Виберіть сцену або позицію, якщо вони є, та перегляньте доступні канали, Z-зрізи й часові точки.
  4. Перед вимірюванням перевірте розмір пікселя в метаданих. Зберігайте вихідний файл під час експорту.

Чим відкрити файли IMS

ПрограмаВартістьПлатформиПідходить для
Imaris ViewerБезкоштовно (для завантаження треба заповнити реєстраційну форму)Windows, macOS (Apple silicon та Intel)Власна програма виробника для перегляду IMS у 3D і 4D
Fiji / ImageJ з Bio-FormatsБезкоштовно, відкритий кодWindows, macOS, LinuxАналіз із плагінами та макросами
SlideScopeБезкоштовний попередній перегляд (без картки), безкоштовний пробний період (3 дн.), далі передплата від $25 на місяцьWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon та Intel)Перегляд, вимірювання та анотування файлів IMS поряд із CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM і TIFF; файли залишаються на вашому комп’ютері

Файли Imaris IMS можна відкрити в Imaris Viewer — безкоштовній програмі перегляду від Oxford Instruments для Windows і Mac; у Fiji, який читає IMS через Bio-Formats у Windows, на Mac і в Linux; або в SlideScope — настільній програмі перегляду для Windows і Mac із безкоштовним пробним періодом. У кроках нижче використано SlideScope.

Джерело: Сумісність файлів: що відкриває SlideScope і які є обмеження (англійською).

Коли SlideScope є практичним вибором

  • IMS для багатоканальних зображень Imaris/Bitplane
  • Рецензентам потрібен настільний інтерфейс без скриптів і плагінів.
  • Перемикайтеся між каналами, Z-площинами, часовими точками й сценами, якщо вони є у файлі, перевірте розмір пікселя в Details і вимірюйте в каліброваних одиницях.
  • Вимірювання, нотатки й області лишаються прив’язаними до препарату та експортуються в GeoJSON або CSV.

Вибір за робочим процесом

Оцініть SlideScope, якщо вам потрібна одна настільна програма, яка відкриває різні формати та рахує стандартні об’єкти на вашому власному комп’ютері. Залишайте оригінальний інструмент для керування мікроскопом, програмованої обробки, скриптових конвеєрів аналізу або інституційного керування зображеннями.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Розширювана обробка, макроси, плагіни, скрипти, сегментація, аналіз патології та наукові процеси Python.

OMERO: Централізовані сховища зображень, дозволи, співпраця та інституційне керування даними.

Запитання про файли IMS

Чи може Fiji відкрити файли IMS?

Так. Fiji читає файли Imaris IMS, зокрема версію 5.5 на основі HDF5, через Bio-Formats. Програма Imaris Viewer теж безкоштовна, для Windows і Mac. SlideScope можна завантажити безкоштовно: є безкоштовний режим попереднього перегляду, у якому можна відкривати, вимірювати й анотувати власні зображення (без картки), і безкоштовний пробний період (3 дн.) з усіма функціями (потрібен PayPal або картка); після пробного періоду програма працює за передплатою.

Відкриття IMS на Mac

Використовуйте macOS 14 або новішу. Виберіть версію Apple Silicon або Intel для свого Mac і скопіюйте файл на локальний диск перед відкриттям.

Якщо файл не відкривається

Переконайтеся, що копіювання завершене. Якщо помилка залишається, повідомте підтримці версію застосунку, формат файлу та текст помилки.

Для кого призначено SlideScope?

Для дослідних лабораторій, центрів мікроскопії, викладачів, студентів і команд, які переглядають патологічні зображення.

Документація формату

Прочитайте оригінальну документацію формату.

IMS

Пов’язані пошукові запити українською

Незалежність і торговельні марки

SlideScope є незалежним продуктом і не пов’язаний з Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari або OMERO. Назви використано лише для фактичного порівняння.

Завантажити SlideScope

Досліджуйте цілі препарати, канали флуоресценції та стеки зображень в одному зручному робочому просторі для Windows і macOS.

Завантажити SlideScope

Файл не відкривається або формату немає в списку? Повідомити про файл або формат