IMS-bestanden openen: de mogelijkheden
Je kunt Imaris IMS-bestanden openen met Imaris Viewer, de gratis viewer van Oxford Instruments voor Windows en Mac; met Fiji, dat IMS via Bio-Formats leest op Windows, Mac en Linux; of met SlideScope, een desktopviewer voor Windows en Mac met een gratis proefperiode. In de stappen hieronder wordt SlideScope gebruikt.
Bron: Bestandscompatibiliteit: wat SlideScope opent en wat de beperkingen zijn (in het Engels).
Wanneer SlideScope een praktische keuze is
- IMS voor multichannel-beelden uit Imaris/Bitplane
- Beoordelaars hebben een desktopinterface nodig zonder scripts of plug-inconfiguratie.
- Blader door kanalen, Z-vlakken, tijdpunten en scènes als het bestand die heeft, controleer de pixelgrootte in Details en meet in gekalibreerde eenheden.
- Metingen, notities en regio’s blijven aan de coupe gekoppeld en kunnen als GeoJSON of CSV worden geëxporteerd.
Kies op basis van de workflow
Overweeg SlideScope als u één desktopprogramma nodig hebt dat gemengde microscopieformaten opent en standaardobjecten op uw eigen machine kwantificeert. Gebruik het oorspronkelijke pakket wanneer microscoopbesturing, programmeerbare beeldverwerking, gescripte analysepijplijnen of institutioneel beeldbeheer nodig is.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Uitbreidbare verwerking, macro’s, plug-ins, scripts, segmentatie, pathologieanalyse en wetenschappelijke Python-workflows.
OMERO: Centrale beeldopslag, toegangsrechten, samenwerking en institutioneel gegevensbeheer.
Onafhankelijkheid en merken
SlideScope is onafhankelijk en niet verbonden met Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari of OMERO. Productnamen worden alleen voor feitelijke vergelijking gebruikt.