viewer voor microscopiebeelden

Zo opent u IMS-bestanden

Open Imaris IMS-bestanden (Bitplane, nu Oxford Instruments) in SlideScope op Windows of macOS zonder ze te converteren. Kanalen openen met de kleuren en weergavebereiken die in het bestand zijn opgeslagen, focusvlakken staan in µm en tijdpunten in seconden, en gecomprimeerde IMS-bestanden openen ook. SlideScope leest het niveau met volledige resolutie van het bestand. Lokaal bekijken uploadt de afbeelding niet.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Zo opent u IMS-bestanden

  1. Download de juiste Windows- of Mac-versie en installeer deze. Voor de gratis preview is geen account nodig.
  2. Open SlideScope en sleep uw .ims-bestand naar de viewer.
  3. Selecteer een scène of positie indien aanwezig en bekijk beschikbare kanalen, Z-vlakken en tijdpunten.
  4. Controleer vóór het meten de pixelgrootte in de metadata. Bewaar het oorspronkelijke bestand bij het exporteren.

IMS-bestanden openen: de mogelijkheden

ToolKostenPlatformsGeschikt voor
Imaris ViewerGratis (registratieformulier invullen om te downloaden)Windows, macOS (Apple silicon en Intel)De eigen 3D- en 4D-viewer van de fabrikant voor IMS
Fiji / ImageJ met Bio-FormatsGratis, open sourceWindows, macOS, LinuxAnalyse met plug-ins en macro’s
SlideScopeGratis preview (geen creditcard), gratis proefperiode van 3 dagen, daarna een abonnement vanaf $25/maandWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon en Intel)IMS bekijken, meten en annoteren naast CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM en TIFF, terwijl je bestanden op je eigen computer blijven

Je kunt Imaris IMS-bestanden openen met Imaris Viewer, de gratis viewer van Oxford Instruments voor Windows en Mac; met Fiji, dat IMS via Bio-Formats leest op Windows, Mac en Linux; of met SlideScope, een desktopviewer voor Windows en Mac met een gratis proefperiode. In de stappen hieronder wordt SlideScope gebruikt.

Bron: Bestandscompatibiliteit: wat SlideScope opent en wat de beperkingen zijn (in het Engels).

Wanneer SlideScope een praktische keuze is

  • IMS voor multichannel-beelden uit Imaris/Bitplane
  • Beoordelaars hebben een desktopinterface nodig zonder scripts of plug-inconfiguratie.
  • Blader door kanalen, Z-vlakken, tijdpunten en scènes als het bestand die heeft, controleer de pixelgrootte in Details en meet in gekalibreerde eenheden.
  • Metingen, notities en regio’s blijven aan de coupe gekoppeld en kunnen als GeoJSON of CSV worden geëxporteerd.

Kies op basis van de workflow

Overweeg SlideScope als u één desktopprogramma nodig hebt dat gemengde microscopieformaten opent en standaardobjecten op uw eigen machine kwantificeert. Gebruik het oorspronkelijke pakket wanneer microscoopbesturing, programmeerbare beeldverwerking, gescripte analysepijplijnen of institutioneel beeldbeheer nodig is.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Uitbreidbare verwerking, macro’s, plug-ins, scripts, segmentatie, pathologieanalyse en wetenschappelijke Python-workflows.

OMERO: Centrale beeldopslag, toegangsrechten, samenwerking en institutioneel gegevensbeheer.

Vragen over IMS-bestanden

Kan Fiji IMS-bestanden openen?

Ja. Fiji leest Imaris IMS-bestanden, ook de op HDF5 gebaseerde versie 5.5, via Bio-Formats. Imaris Viewer is ook gratis, op Windows en Mac. SlideScope is gratis te downloaden, met een gratis preview waarmee je je eigen beelden opent, meet en annoteert (geen creditcard nodig) en een gratis proefperiode van 3 dagen met alle functies (PayPal of creditcard vereist); na de proefperiode werkt het met een abonnement.

IMS openen op een Mac

Gebruik macOS 14 of nieuwer. Kies de Apple Silicon- of Intel-download voor uw Mac en kopieer het bestand vóór het openen naar lokale opslag.

Als het bestand niet opent

Controleer of het kopiëren is voltooid. Blijft het probleem bestaan, geef dan de appversie, het bestandsformaat en de foutmelding door aan support.

Voor wie is het bedoeld?

Voor onderzoekslabs, microscopiefaciliteiten, docenten, studenten en pathologiereviewteams.

Documentatie van het formaat

Lees de oorspronkelijke documentatie van het formaat.

IMS

Gerelateerde zoekopdrachten in het Nederlands

Onafhankelijkheid en merken

SlideScope is onafhankelijk en niet verbonden met Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari of OMERO. Productnamen worden alleen voor feitelijke vergelijking gebruikt.

Download SlideScope

Verken volledige preparaten, fluorescentiekanalen en beeldstapels in één overzichtelijke werkruimte voor Windows en macOS.

Download SlideScope

Opent een bestand niet, of staat een formaat niet in de lijst? Bestand of formaat melden