在 Mac 或 Windows 上将多场景 CZI 文件转换为 OME-TIFF(无需 ZEN)

1:41 · 发布于 2026-09-27 · 在 YouTube 上观看 · 阅读文字稿

本视频内容

一个 ZEISS .czi 文件可以包含多个场景:孔板的各个孔、拼接区域或切片的扫描区域。本演示在 SlideScope 中打开一个包含两个场景的 CZI,逐一浏览每个场景,并用 XY Overview 显示每个场景的采集位置。

随后检查通道和像素尺寸,将单个场景或全部场景导出为 OME-TIFF,并重新打开结果。导出的文件保留了像素尺寸和通道名称,因此 Fiji、QuPath 和其他 Bio-Formats 读取器都能正确打开。

更喜欢阅读?请参阅如何打开 CZI 文件(包括多场景文件)。

章节

  1. 0:00什么是多场景 CZI
  2. 0:12直接打开 CZI,无需转换
  3. 0:17逐一浏览各个场景
  4. 0:25XY Overview:每个场景的采集位置
  5. 0:33通道与校准比例尺
  6. 0:42Details:像素尺寸、通道、采集设置
  7. 0:47将当前场景导出为 OME-TIFF
  8. 1:00将所有场景导出到一个 OME-TIFF
  9. 1:11重新打开结果:场景、像素尺寸和通道名称
  10. 1:21免费账户、试用和限制

文字稿

录制后已有更新。关于旁白中提到的导出试用:旁白中的试用已不再向新注册用户提供,所提及的价格也已变更:内置示例库免费且可使用所有工具,打开您自己的图像需要订阅,订阅时通过 PayPal 或银行卡扣费。当前价格请见价格页面。请参阅价格。

一个 CZI 文件可以包含多个场景:孔板的各个孔、拼接区域或扫描区域。

下面介绍如何查看每个场景,并将它们导出为 OME-TIFF。

一个包含两个场景的 CZI,直接打开。无需转换。

Scene 控件可以从一个场景切换到下一个场景。

场景 2 是 D7 孔。场景 1 是 D6 孔。

XY Overview 将每个场景放在其采集位置上。

这两个孔相距 9 mm。

将通道混合为一个视图(Blend channels into one view)。

关闭某个通道,看看它贡献了什么。

放大。比例尺始终保持校准。

Details 列出像素尺寸、通道和采集设置。

要导出,请选择 File,然后选择 Export Current Image as TIFF。

当您查看某一个场景时,只会导出该场景。

开始导出前,您会看到将要写入的像素尺寸、通道和压缩方式。

要导出所有场景,请先打开 XY Overview。

所有场景都写入一个 OME-TIFF 文件,每个场景在其中都是一幅独立的图像。

打开结果。两个场景都在,分别是图像 1 和图像 2。

像素尺寸和通道名称都已保留。

免费账户可让您在任何试用之前打开和查看本地图像。

导出需要 3 天试用或订阅。

大型拼接扫描会以其概览分辨率导出,而不是完整扫描分辨率。

macOS 和 Windows 上是同一款应用。本视频画面在 Windows 上录制。

在您自己的文件上试用

下载 Windows 或 Mac 版 SlideScope。免费探索内置示例库,可使用所有工具。打开您自己的图像需要订阅。订阅时扣费,支持 PayPal 或银行卡。可随时在账户中取消。

下载 SlideScope