在荧光图像中计数细胞核
6 分钟- 打开图像并框选要计数的区域。对区域而不是整张切片做定量,既能保持运行速度,也让结果落在你真正关心的组织上。
- 在定量面板中选择「细胞核」,引擎选 InstanSeg,分割通道设为你的 DAPI 或核染色通道。第一次运行时不要动高级设置。
- 运行后先看叠加层,再看数字。点击任何看起来不对的对象把它剔除,然后把 CSV 和方法摘要一起导出。
大约十分钟,只需一次。按顺序做完,这个页面上其余内容就都说得通了。
下载 Windows 或 macOS 的签名版本,用你开通试用或订阅时的账号登录。激活绑定到本机,一份订阅覆盖两台设备,所以笔记本和工作站可以同时保持登录。
把 CZI、ND2、SVS、NDPI、DICOM 或 TIFF 文件拖到窗口上。没有导入步骤,也不需要转换:SlideScope 直接读取扫描仪金字塔,因此千兆像素切片在普通笔记本上就能打开。
滚动缩放,拖动平移,用总览导航器在切片上跳转而不丢失当前位置。尽早看一眼元数据面板:那里记录的像素尺寸,正是让后续每一次测量成为校准值而非估计值的关键。
挑一个和你今天要做的事对得上的。
按顺序走完三个入门步骤,然后做测量那份指南。这四件事覆盖了新用户第一周所需的大部分内容。接下来值得做计数指南,即使你觉得暂时用不上定量——那是理解 SlideScope 如何处理校准的最快途径。
不需要。这个页面上的任何内容都不要求脚本、宏、插件或 Python 环境。定量由保存的配方驱动而非代码:这是取舍——不如可编程平台灵活,但拿到结果快得多。
把一个指向你自己工作中真实切片的共享视图链接,连同这个页面一起发给他们。打开熟悉的东西比人造教学文件有效,而链接能保证他们看到的是和你相同的视野,而不是扫描图的另一个角落。
14 天试用为完整功能。用你实验室真正在处理的切片走一遍这些指南,而不是示例文件。