Digitální patologie

Srovnání skenerů pro digitální patologii: modely, kapacita a formáty souborů

Každá značka skenerů celých preparátů zapisuje vlastní formát souborů: Leica Aperio zapisuje SVS, Hamamatsu NDPI, 3DHISTECH MRXS, Philips iSyntax, Roche VENTANA BIF, ZEISS CZI a Evident VSI. To, jaký skener laboratoř koupila, rozhoduje o tom, jaký software otevře její preparáty, a proto toto srovnání uvádí aktuální modely, jejich kapacitu, formáty, které zapisují, jejich možnosti DICOM a to, zda se každý formát otevře i mimo vlastní prohlížeč výrobce. Údaje pocházejí ze stránek jednotlivých výrobců a byly ověřeny 8. října 2026.

Zobrazit srovnání Stáhnout SlideScope

12 výrobců skenerůFormáty a výstup DICOMS odkazy na zdroje výrobců

Skenery celých preparátů a soubory, které zapisují

Výrobce	Aktuální modely	Kapacita preparátů	Nativní formát	Další výstup	Otevře se ve SlideScope
Leica Biosystems (Aperio) ^zdroj	GT 450 DX, GT 450, GT 180 DX, CS5 DX	GT 450: 450 preparátů; GT 180: 180; CS5: 5	SVS	Volitelně DICOM	Ano
Hamamatsu (NanoZoomer) ^zdroj	S360MD, S540MD, S20MD, S60v2	S540: až 540; S360: 360; S60v2: 60	NDPI	Neuvedeno	Ano
3DHISTECH (PANNORAMIC) ^zdroj	1000 DX, 480, 250 FLASH III	1000 DX: až 1 200; 480: 480; 250 FLASH III: 300	MRXS	DICOM	Ano
Philips ^zdroj	SG300, SG60, SG20 (dříve Ultra Fast Scanner)	SG300: 300; SG60: 60	iSyntax	DICOM (JPEG nebo JPEG XL) u modelů SGi	iSyntax: ano, od verze 1.20.0. DICOM: podporován, výstup SGi netestován
Roche (VENTANA) ^zdroj	DP 600, DP 200	DP 600: 240; DP 200: 6	BIF	TIF, DICOM	Ano
ZEISS ^zdroj	Axioscan 7	12 nebo 100	CZI	DICOM, export do OME-TIFF	Ano
Evident (Olympus) ^zdroj	SLIDEVIEW VS200	Až 210	VSI	TIFF, DICOM	VSI: ano, od verze 1.10.0, včetně preparátů s více oblastmi, kde má každá oblast vlastní velikost pixelu. TIFF a DICOM: ano
Grundium ^zdroj	Ocus 20, Ocus 40, Ocus M20/M40, Ocus R	1 až 600	SVS, TIFF, SZI	Export do DICOM	SVS a TIFF: ano. SZI: ne
Huron Technologies ^zdroj	TissueScope iQ, VX504, HT540	iQ: 400; VX504: 504; HT540: 540	Pyramidový BigTIFF	Kompatibilní s DICOM	Ano
KFBio ^zdroj	KF-PRO 005 až 400	5 až 400	KFB (světlé pole), KFBF (fluorescence)	SVS, TIFF, DICOM; QPTIFF pro fluorescenci	KFB: ano, od verze 1.20.0. KFBF: ne. SVS, TIFF, DICOM, QPTIFF: ano
Motic ^zdroj	EasyScan, FlexScan	Liší se podle modelu	Neuvedeno	DICOM, SVS, JPG	SVS a DICOM: ano
Quanterix (dříve Akoya) ^zdroj	PhenoImager HT	80	QPTIFF, IM3	TIFF, JPEG	QPTIFF: ano. IM3: ne

„Otevře se ve SlideScope“ se uvádí podle formátu. Testovací korpus našeho benchmarku formátů obsahuje mimo jiné Aperio SVS, Hamamatsu NDPI a 3DHISTECH MRXS ve světlém poli; soubory SVS a TIFF zapsané jinými skenery testovány nejsou a MRXS se čte jako 2D obraz RGB, což se hodí spíše pro skeny ve světlém poli než pro fluorescenční. Kapacita je maximum výrobce pro standardní preparáty 1×3". 3DHISTECH uvádí u PANNORAMIC 1000 DX na svém hlavním webu „až 1 200“ a na webu pro partnery 840. „Neuvedeno“ znamená, že to stránky výrobce neuváděly, ne že taková možnost neexistuje.

Skenery schválené pro klinické použití

Výzkumné a klinické skenery jsou často stejný hardware prodávaný s jiným zamýšleným účelem. Tato schválení uvádějí výrobci nebo FDA; vždy si ověřte přesný zamýšlený účel pro svůj region.

Skener	Stav
Leica Aperio GT 450 DX	FDA 510(k) K232202, schváleno 16. dubna 2024, pro primární diagnostiku (zdroj)
Hamamatsu NanoZoomer S360MD, S20MD, S540MD	Schváleno FDA 510(k); S20MD a S540MD oznámeny 2. září 2026 (zdroj)
Roche VENTANA DP 200 a DP 600	Schváleno jako součást Roche Digital Pathology Dx: DP 200 v červnu 2024, DP 600 přidán v lednu 2025 (zdroj)
3DHISTECH PANNORAMIC 1000 DX	V souladu s EU IVDR (kategorie A); v USA podle 3DHISTECH pouze pro výzkum a výuku (zdroj)
ZEISS Axioscan 7, Evident SLIDEVIEW DX VS200, Grundium Ocus	Varianty IVDR / CE-IVD v EU; v ostatních regionech pro výzkumné použití (zdroj)

Vlastní prohlížeč každého výrobce

Prohlížeč	Výrobce	Platformy	Poznámky
Aperio ImageScope	Leica	Pouze Windows; zdarma	Podle Leica se již aktivně nevyvíjí
NDP.view2	Hamamatsu	Windows 10/11, macOS 13 až 26	Zdarma s preparáty Hamamatsu; NDP.view2 Plus (placený) otevře také SVS, SCN, MRXS, CZI a VSI
SlideViewer	3DHISTECH	Windows 10/11; zdarma	CaseViewer pro Mac zobrazuje jen preparáty ze serveru CaseCenter nebo SlideCenter
ZEN lite	ZEISS	Zdarma	Bezplatný prohlížeč CZI od ZEISS
OlyVIA	Evident	Windows 10/11	Čte VSI a TIFF
IntelliSite Pathology Solution	Philips	Klinický systém	Správa a prohlížení snímků pro iSyntax
navify Digital Pathology	Roche	Web	Klinická správa a prohlížení snímků od Roche

Většina prohlížečů výrobců běží jen ve Windows. Na Macu nebo s preparáty od několika značek skenerů je obvykle jednodušší prohlížeč nezávislý na výrobci: QuPath (zdarma) nebo SlideScope, který ve Windows i na Macu otevře SVS, NDPI, NDPIS, MRXS, SCN, BIF, VMS, SVSLIDE, QPTIFF, AVS, VSI, DICOM, TIFF a CZI. Možnosti pokrývá srovnání prohlížečů celoplošných snímků preparátů.

Když se formát vašeho skeneru neotevře

Philips iSyntax: SlideScope otevírá iSyntax přímo od verze 1.20.0. OpenSlide čte jen export do TIFF od Philips, ne iSyntax (OpenSlide). Skenery SGi umějí nativně zapisovat DICOM (Philips).
Evident VSI: SlideScope otevírá VSI přímo od verze 1.10.0, včetně preparátů s více oblastmi. Pro prohlížeče, které VSI nečtou, umí VS200 místo toho ukládat TIFF nebo DICOM (Evident).
KFBio KFB: SlideScope otevírá KFB ve světlém poli přímo od verze 1.20.0; fluorescenční preparáty KFBF se neotevřou. Řada KF-PRO umí také ukládat SVS, TIFF nebo DICOM pro světlé pole a QPTIFF pro fluorescenci (KFBio).
Grundium SZI: tytéž skenery zapisují SVS a TIFF (Grundium).
3DHISTECH MRXS, který se neotevře: soubor .mrxs je jen index; zkopírujte s ním i stejnojmennou složku. Viz otevírání souborů MRXS.

Náš benchmark formátů otevřel 792 skutečných souborů v těchto formátech a zveřejňuje každé selhání, včetně několika preparátů SCN a BIF, které nebylo možné přečíst.

Otevření preparátu podle formátu

SVS · NDPI · MRXS · CZI · QPTIFF · DICOM · TIFF a OME-TIFF · SVS v Pythonu

Otázky ke skenerům

Jaký formát souborů používá který skener preparátů?

Leica Aperio zapisuje SVS, Hamamatsu NanoZoomer NDPI, 3DHISTECH PANNORAMIC MRXS, Philips iSyntax, Roche VENTANA BIF, ZEISS Axioscan CZI, Evident VS200 VSI, KFBio KFB a Huron pyramidový BigTIFF. Mnoho současných skenerů umí ukládat i DICOM a několik ukládá jako alternativu SVS nebo TIFF.

Které skenery celých preparátů jsou schváleny FDA pro primární diagnostiku?

Ze skenerů na této stránce podle výrobců a databáze FDA: Leica Aperio GT 450 DX (510(k) K232202, 2024), Hamamatsu NanoZoomer S360MD, S20MD a S540MD a Roche VENTANA DP 200 a DP 600 jako součást Roche Digital Pathology Dx. Přesný zamýšlený účel pro váš region si ověřte u výrobce.

Podporují skenery pro digitální patologii DICOM?

Stále častěji ano. Leica Aperio, 3DHISTECH, Roche VENTANA, Evident VS200, KFBio, Motic a Grundium uvádějí výstup DICOM, ZEISS exportuje DICOM přes převodník a skenery Philips SGi zapisují DICOM nativně s kompresí JPEG nebo JPEG XL. Hamamatsu na stránkách, které jsme kontrolovali, výstup DICOM neuvádí.

Mohu otevřít soubory Philips iSyntax nebo Olympus VSI bez softwaru výrobce?

VSI ano: SlideScope otevírá soubory Olympus/Evident VSI přímo od verze 1.10.0, včetně preparátů s více oblastmi, kde se každá naskenovaná oblast měří ve vlastní velikosti pixelu. iSyntax ano, od verze 1.20.0: OpenSlide iSyntax nečte, ale SlideScope otevírá preparáty Philips iSyntax přímo a zobrazuje dekódované pixely bez vlastního doostření od Philips. U jiných prohlížečů je praktickou cestou otevřený export skeneru: skenery Philips SGi umějí zapisovat DICOM a software Philips umí exportovat TIFF, který QuPath a další prohlížeče otevřou. Pro prohlížeče, které VSI nečtou, umí Evident VS200 také ukládat TIFF nebo DICOM.

Jaký je rozdíl mezi SVS, NDPI a MRXS?

Všechny tři jsou pyramidové celoplošné snímky preparátů od různých výrobců. SVS (Leica Aperio) a NDPI (Hamamatsu) jsou jednotlivé soubory založené na TIFF. MRXS (3DHISTECH) je malý indexový soubor a k němu stejnojmenná složka s pixely, takže soubor a složku je nutné vždy kopírovat společně.

Zdroje a prohlášení

Každý model, kapacita, formát a schválení výše pocházejí z vlastních produktových stránek, brožur nebo tiskových zpráv výrobců nebo z databáze FDA, byly ověřeny 8. října 2026 a jsou odkázány v tabulkách. Výrobci svou nabídku často mění; opravy uvítáme na support@slidescope.science. SlideScope vyvíjí desktopový prohlížeč a skenery neprodává; není spojen s žádným zde jmenovaným výrobcem.

Otevřete preparáty z kteréhokoli z těchto skenerů

SlideScope otevře SVS, NDPI, MRXS, BIF, SCN, VSI, CZI, QPTIFF, DICOM a TIFF ve Windows i na Macu, aniž by se cokoli nahrávalo. Vestavěná knihovna ukázek je zdarma se všemi nástroji; pro vlastní snímky potřebujete předplatné (PayPal nebo karta).

Stáhnout SlideScope