14 mikroskopi biçiminde 792 gerçek slayt dosyasını açtık: neler başarısız oldu?

9:08 · Yayın tarihi 2026-09-19 · YouTube’da izleyin · Dökümü okuyun

Bu videoda neler var?

Biçim desteği listeleri yetenek iddia eder; bu video ise onları ölçer. 14 biçim ailesinden, toplam 44 GB tutan 792 gerçek dosyanın her biri, görüntüleyicinin kullandığı yükleyicinin aynısını oluşturan, bir düzlemi çözen ve onu işleyen yalıtılmış bir süreçte açıldı. 767’si açıldı, 9’u okunamadı, 16’sı hiç görüntü içermiyordu ve hiçbiri çökmeye yol açmadı.

Video; tam slayt biçimlerini (SVS, NDPI, MIRAX, SCN, BIF, VMS, QPTIFF, AVS), mikroskopi biçimlerini (CZI, ND2, LIF, OME-TIFF) ve DICOM’u ele alır, 16 "başarısızlığın" neden içinde piksel olmayan dosyalar olduğunu açıklar ve gerçekten okunamayan 9 dosyanın adını verir. Başarısızlıklar dahil her sonuç, biçim karşılaştırma testi sayfasında yayımlanmıştır.

Okumayı mı tercih edersiniz? Biçim karşılaştırma testi: her dosya ve sonuç.

Bölümler

  1. 0:00Önce sonuç
  2. 0:22Biçim desteği listeleri neden genellikle yanlıştır?
  3. 0:48Test gerçekte nasıl yürütüldü?
  4. 1:14Tam slayt biçimleri: SVS, NDPI, MIRAX, SCN, BIF, VMS, QPTIFF, AVS
  5. 4:12Microscopy formats: CZI, ND2, LIF, OME-TIFF
  6. 5:47Tam slayt DICOM dahil DICOM
  7. 6:19Başarısızlıklardan 16’sı neden başarısızlık değil?
  8. 6:47Gerçekten okuyamadığımız 9 dosya
  9. 7:19Açılan ama yanlış şeyi gösteren dosya
  10. 7:53Temiz biçimde reddedilen 93 biçim
  11. 8:17Bu karşılaştırma testinin kanıtlamadıkları
  12. 8:43Kendi dosyalarınızda deneyin

Döküm

Kayıttan sonra güncellendi. Bu video kaydedildikten sonra anlatılan çoklu QPTIFF sorunu düzeltildi: çoklu Akoya QPTIFF dosyaları artık tek bir RGB görüntü yerine floresan kanallarıyla açılıyor. Güncel sonuçlar karşılaştırma testi sayfasındadır.

Yedi yüz doksan iki dosya. On dört biçim ailesi. Kırk dört gigabayt.

Yedi yüz altmış yedisi açıldı. Dokuzu okunamadı.

On altısı hiç görüntü içermiyordu. Hiçbiri görüntüleyicinin çökmesine yol açmadı.

Bizi kötü gösterenler dahil her sonuç yayımlandı.

Neredeyse her görüntüleyici, birinin yazdığı bir uzantı listesi yayımlar.

O liste bir yetenek iddia eder. Onu ölçmez.

Gerçek bir tarayıcıdan gelen gerçek bir dosyanın açılıp açılmadığı

ya da açılmadığında ne olduğu hakkında size hiçbir şey söylemez.

Bu yüzden elimizdeki her dosyayı test ettik ve başarısızlıkları başarıların yanında yayımladık.

Her dosya, gözden çıkarılabilir bir alt sürece verilir.

Bu süreç, uygulamanın oluşturduğu yükleyicinin aynısını oluşturur, boyutları okur,

bir düzlemi çözer ve onu görüntüleyicinin kullandığı yolun aynısından geçirerek işler.

Yerel bir codec’i durduran bozuk bir dosya yalnızca o alt süreci sonlandırır.

Bu tablonun “çöktü” sütununu dürüstçe sıfır olarak raporlayabilmesinin nedeni budur.

Birinci bölüm. Tam slayt biçimleri.

Tarayıcıdan çıkan ve sıklıkla birkaç gigabayta ulaşan dosyalar.

İkinci bölüm. Mikroskopi biçimleri.

Burada soru dosya boyutu değil, kaç kanalın, odak düzleminin ve zaman noktasının sağlam kaldığıdır.

Üçüncü bölüm. Tam slayt DICOM dahil DICOM.

Üç yüz yetmiş sekiz dosya test edildi. Üç yüz altmış ikisi açıldı.

DICOM bir görüntü biçimi olduğu kadar bir belge biçimidir de.

Bir DICOMDIR dosyası, bir diskin dizinidir.

Bir sunum durumu, birinin bir çalışmayı zamanında nasıl pencerelediğini kaydeder.

Diğerleri raporları veya ölçümleri tutar. Hiçbiri piksel içermez.

Dolayısıyla onları reddetmek doğru yanıttır ve başarısızlık olarak saymak bizi olduğumuzdan iyi gösterirdi.

Bu çalıştırmanın dürüst başarısızlık sayısı yirmi beş değil, dokuzdur.

Gerçekten açamadığımız dokuz dosya.

İki Leica SCN slaytı. Birinin tanımlanabilir bir ana görüntüsü yok.

Diğerinin ana görüntüleri birbirinden farklı.

Beklenmeyen bir yön özniteliğine sahip bir Ventana BIF.

Ve biçim HDF5’e geçmeden önceki döneme ait altı eski Imaris Classic kapsayıcısı.

Her biri bozulmamış. Sağlama toplamları yayıncınınkiyle eşleşiyor.

Bunlar kod çözücü ve üretici düzeni sınırlarıdır ve gerileme testi kapsamı olarak derlemde kalırlar.

En önemli başarısızlık budur ve biçim tablolarının asla kabul etmediği başarısızlıktır.

Çoklu bir Akoya QPTIFF hiçbir hata vermeden açılıyor.

Dosya, otuz dört bin piksel genişliğinde beş tam çözünürlüklü floresan kanalı içeriyor.

DAPI, FITC, Cy3, Texas Red ve Cy5.

Onu bir parlak alan okuyucusuna yönlendiriyoruz; bu yüzden tek kanal bildiriyor ve bir RGB dilimi döndürüyor.

Floresan kanallarına ulaşılamıyor ve hiçbir şey sizi uyarmıyor.

Aynı biçimdeki parlak alan taramaları kusursuz açılıyor; bunun fark edilmemesinin nedeni de tam olarak bu.

Dördüncü bölüm. Genel bir yedek okuyucu yok.

Referans derlemdeki desteklenmeyen her uzantının en küçük gerçek dosyasını aldık.

Toplam doksan üç dosya; her biri yayımlanan yükleyiciden geçirildi.

Doksan üçünün hepsi net bir mesajla reddedildi. Hiçbiri çökmeye yol açmadı.

Hiçbiri, görüntüye benzeyen ama görüntü olmayan bir şeye yarım açılmadı.

İki biçim için hiç gerçek dosya kapsamı yok.

İkisinin de herkese açık örneği mevcut değil; bu yüzden bunlar için test edilmiş destek iddia etmiyoruz.

Bu bir hız testi değil ve klinik bir doğrulama da değil.

Ve bu bir üretici testi. Yazılımı biz yazdık ve testi biz yürüttük.

Bağımsızlık yerine sunduğumuz şey doğrulanabilirlik.

Bizim derlemimiz sizin slayt çekmeceniz değil.

Dosya bazında ham sonuçlar JSON olarak yayımlandı.

Derlemler herkese açık olarak indirilebilir ve çalıştırıcı depomuzda.

Size gerçekten sorun çıkaran dosyaları açın.

Ve biri başarısız olursa bize gönderin.

Bu videodaki başarısızlıklar, biri bunu yaptığı için burada.

Kendi dosyalarınızda deneyin

SlideScope’u Windows veya Mac için indirin. Yerleşik örnek kitaplığını tüm araçlarla ücretsiz keşfedin. Kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Abonelik, abone olduğunuzda PayPal veya kartla faturalandırılır. Hesabınızdan istediğiniz zaman iptal edin.

SlideScope’u indirin