SlideScope'u öğrenin

Kurulumdan gerçek sonuçlara

Aşağıdaki her rehber, birinin gerçekten bitirmesi gereken bir iştir; dürüst bir süre tahmini ve üç adımla. SlideScope sizin için yeniyse başlangıç yolundan başlayın, ya da doğrudan önünüzdeki işe geçin.

Denemeyi başlatİndirme ve deneme
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Buradan başlayın

Yaklaşık on dakika, bir kez. Sırayla yapın, sayfadaki geri kalan her şey yerine oturacak.

  1. Kurun ve etkinleştirin

    Windows veya macOS için imzalı sürümü indirin ve deneme ya da abonelik için kullandığınız hesapla oturum açın. Etkinleştirme makineye bağlanır ve bir abonelik iki cihazı kapsar; dizüstü bilgisayarınız ile iş istasyonunuz aynı anda oturumda kalabilir.

  2. İlk preparatınızı açın

    Bir CZI, ND2, SVS, NDPI, DICOM veya TIFF dosyasını pencerenin üzerine sürükleyin. İçe aktarma adımı ya da dönüştürme yok: SlideScope tarayıcı piramidini doğrudan okur, böylece gigapiksellik bir preparat sıradan bir dizüstü bilgisayarda açılır.

  3. Yolunuzu bulun

    Yakınlaştırmak için kaydırın, gezinmek için sürükleyin, yerinizi kaybetmeden preparat boyunca atlamak için genel görünüm gezginini kullanın. Üst veri paneline erken bakın: orada kayıtlı piksel boyutu, sonraki her ölçümü yaklaşık değil kalibre yapan şeydir.

Göreve göre rehberler

Bugün yapmaya çalıştığınız işle eşleşeni seçin.

Floresan görüntüde çekirdek saymak

6 dk
  1. Görüntüyü açın ve saydırmak istediğiniz bölgeyi seçin. Tüm preparat yerine bir bölgeyi ölçümlemek çalışmayı hızlı tutar ve sonucu önemsediğiniz dokuda bırakır.
  2. Ölçümleme panelinde Çekirdek seçin, motor olarak InstanSeg belirleyin ve bölütleme kanalını DAPI ya da çekirdek boyamanıza ayarlayın. İlk çalıştırmada gelişmiş ayarlara dokunmayın.
  3. Çalıştırın, sonra sayıyı okumadan önce katmanı okuyun. Yanlış görünen her nesneye tıklayıp çıkarın, ardından CSV ile yöntem özetini birlikte dışa aktarın.

Bir yapıyı mikrometre cinsinden ölçmek

4 dk
  1. Üst veri panelinin bir piksel boyutu gösterdiğini doğrulayın. Tarayıcı kaydettiyse ölçümler gerçek mikrometre olarak çıkar; kaydetmediyse bir şey ölçmeden önce elle kalibre edin.
  2. Ölçüm aracını seçip yapının üzerinden çizin. Uzunluklar ve alanlar, o an baktığınız yakınlaştırma düzeyinde değil, preparatın tam çözünürlüğünde hesaplanır.
  3. Ölçümü kaydedin ki preparata bağlı kalsın; başka yerde gerektiğinde tabloyu CSV, bölgeleri GeoJSON olarak dışa aktarın.

HE ile karşılığı olan IHC’yi karşılaştırmak

5 dk
  1. Önce ilk preparatı, sonra yanına ikincisini açın. İki bölme de dokunun aynı yerinde, aynı büyütmede kilitli kalır.
  2. Ölçek yakınlaştırma katsayısıyla değil mikrometre cinsinden eşleştirilir; farklı çözünürlükte sayısallaştırılmış iki tarama gerçekten karşılık gelir. Bir bölmeyi kaydırın ya da yakınlaştırın, diğeri izler.
  3. Hangisinde mantıklıysa orada işaretleme yapın. Notlar kendi preparatına ve hesabınıza bağlı kalır, böylece sonraki inceleyen görür.

Bütün bir klasörü tek çalıştırmada ölçümlemek

8 dk
  1. Önce tek bir görüntüyü doğru hale getirin. Nesne türünü, motoru, kanalı ve alan sınırlarını temsili tek bir görüntüde katman doğru görünene kadar ayarlayın.
  2. O ayarları tarif olarak kaydedin ve üç ay sonra tanıyacağınız bir ad verin.
  3. Klasör toplu işini seçin, dizini gösterin ve çalışmasına izin verin. Görüntü başına dışa aktarımların yanında birleşik bir toplu özet CSV alırsınız; her görüntü aynı ayarlarla çözümlenmiş olur.

Tam olarak baktığınız görünümü paylaşmak

3 dk
  1. Karşı tarafın görmesini istediğiniz görüş alanına, istediğiniz büyütme ve düzlemde gidin.
  2. Paylaşılan görünüm bağlantısı oluşturun. Preparatı konum, büyütme ve düzlemle birlikte taşır; kimse gigapiksellik bir taramada arama yapmak zorunda kalmaz.
  3. Gönderin. SlideScope kurulu olan slidescope:// şeması üzerinden tek tıkla açar; olmayan önce web sitesinde bağlantının neyi gösterdiğini görür.

Başvuru

Çalışırken bunları bir sekmede açık tutun.

Ölçümledesteklenen dosya biçimleriGüven ve veri işlemeİletişimSürüm Notları

Sık sorulan sorular

Bu işte tamamen yeniyim. Nereden başlamalıyım?

Üç başlangıç adımını sırayla yapın, sonra ölçüm rehberini uygulayın. Bu dört şey, yeni bir kullanıcının ilk haftada ihtiyaç duyduğunun çoğunu karşılar. Sayma rehberi, henüz ölçümlemeye ihtiyacınız olduğunu düşünmeseniz bile hemen ardından yapmaya değer; çünkü SlideScope’un kalibrasyonu nasıl ele aldığını anlamanın en hızlı yolu odur.

Programlama öğrenmem gerekiyor mu?

Hayır. Bu sayfadaki hiçbir şey betik, makro, eklenti veya Python ortamı gerektirmez. Ölçümleme koddan değil kayıtlı tariflerden yürür: programlanabilir bir platformdan daha esnek değil, ama sonuca çok daha hızlı ulaştırır.

Laboratuvardaki diğer kişileri nasıl eğitirim?

Kendi çalışmanızdan gerçek bir preparatı gösteren bir paylaşılan görünüm bağlantısını bu sayfayla birlikte gönderin. Tanıdık bir şeyi açmak yapay bir eğitim dosyasından iyidir ve bağlantı, taramanın başka bir köşesini değil sizinle aynı görüş alanını görmelerini sağlar.

Kendi görüntülerinizle öğrenin

14 günlük deneme tam erişimlidir. Bu rehberleri örnek dosyayla değil, laboratuvarınızın gerçekten uğraştığı preparatlarla uygulayın.

Denemeyi başlat
desteklenen dosya biçimleriSürüm NotlarıAlternatiflerGüven ve veri işleme