על מה הסרטון
רשימות תמיכה בפורמטים טוענות ליכולות; הסרטון הזה מודד אותן. 792 קבצים אמיתיים ב-14 משפחות פורמטים, 44 GB בסך הכול, נפתחו כל אחד בתהליך מבודד שבונה את אותו טוען שהמציג משתמש בו, מפענח מישור ומציג אותו. 767 נפתחו, 9 לא היה אפשר לקרוא, ב-16 לא הייתה תמונה כלל, ואף אחד לא קרס.
הסרטון עובר על פורמטים של שקופיות מלאות (SVS, NDPI, MIRAX, SCN, BIF, VMS, QPTIFF, AVS), פורמטים של מיקרוסקופיה (CZI, ND2, LIF, OME-TIFF) ו-DICOM, מסביר למה 16 "כשלים" הם קבצים שאין בהם פיקסלים, ומפרט בשמם את 9 הקבצים שבאמת אי אפשר לקרוא. כל תוצאה, כולל הכשלים, מפורסמת בדף מבחן הפורמטים.
מעדיפים לקרוא? מבחן הפורמטים: כל קובץ וכל תוצאה.
תמליל
עודכן מאז ההקלטה. מאז שהסרטון הוקלט, בעיית ה-QPTIFF מרובה הסמנים שהוא מתאר תוקנה: קובצי QPTIFF מרובי סמנים של Akoya נפתחים עכשיו עם ערוצי הפלואורסצנציה שלהם במקום כתמונת RGB אחת. דף מבחן הפורמטים מציג את התוצאות העדכניות.
792 קבצים. 14 משפחות פורמטים. 44 ג'יגה-בייט.
767 נפתחו. 9 לא היה אפשר לקרוא.
ב-16 לא הייתה תמונה כלל. אף אחד לא גרם לקריסת המציג.
כל תוצאה מפורסמת, כולל אלה שלא מחמיאות לנו.
כמעט כל מציג מפרסם רשימת סיומות שמישהו הקליד.
הרשימה הזו טוענת ליכולת. היא לא מודדת אותה.
היא לא אומרת לכם דבר על כך שקובץ אמיתי מסורק אמיתי נפתח,
או מה קורה כשהוא לא נפתח.
אז בדקנו כל קובץ שיש לנו, ופרסמנו את הכשלים לצד ההצלחות.
כל קובץ מועבר לתהליך-בן חד-פעמי.
התהליך הזה בונה את אותו טוען שהאפליקציה בונה, קורא את הממדים,
מפענח מישור ומציג אותו דרך אותו מסלול שהמציג משתמש בו.
קובץ פגום שמפיל codec מקורי הורג רק את התהליך-הבן הזה.
זו הסיבה שהטבלה יכולה לדווח ביושר על אפס בעמודה "קרס".
פרק ראשון. פורמטים של שקופיות מלאות.
הקבצים שיוצאים מסורק ושגודלם מגיע בשגרה לכמה ג'יגה-בייט.
פרק שני. פורמטים של מיקרוסקופיה.
כאן השאלה אינה גודל הקובץ, אלא כמה ערוצים, מישורי מוקד ונקודות זמן שורדים.
פרק שלישי. DICOM, כולל DICOM של שקופיות מלאות.
378 קבצים נבדקו. 362 נפתחו.
DICOM הוא פורמט של מסמכים לא פחות משהוא פורמט של תמונות.
קובץ DICOMDIR הוא אינדקס של דיסק.
presentation state מתעד איך מישהו פעם הגדיר את חלון התצוגה של בדיקה.
אחרים מכילים דוחות או מדידות. באף אחד מהם אין פיקסלים.
לכן סירוב הוא התשובה הנכונה, ולספור אותם ככשלים היה מחמיא לנו.
מספר הכשלים הכן בהרצה הזו הוא תשעה, לא עשרים וחמישה.
תשעה קבצים שאנחנו באמת לא מצליחים לפתוח.
שתי שקופיות Leica SCN. באחת אין תמונה ראשית שאפשר לזהות.
בשנייה יש תמונות ראשיות שאינן דומות זו לזו.
קובץ Ventana BIF אחד עם מאפיין כיוון לא צפוי.
ושישה מכלים ישנים של Imaris Classic, מלפני שהפורמט עבר ל-HDF5.
כל אחד מהם תקין לחלוטין. סכומי הביקורת תואמים למפרסם.
אלה מגבלות של המפענח ושל מבנה היצרן, והם נשארים באוסף ככיסוי לבדיקות רגרסיה.
זה הכשל החשוב ביותר, וזה שטבלאות פורמטים אף פעם לא מודות בו.
קובץ QPTIFF מרובה סמנים של Akoya נפתח בלי שום שגיאה.
הקובץ מכיל חמישה ערוצי פלואורסצנציה ברזולוציה מלאה, ברוחב של 34 אלף פיקסלים.
DAPI, FITC, Cy3, Texas Red ו-Cy5.
אנחנו מנתבים אותו לקורא לשדה בהיר, ולכן הוא מדווח על ערוץ אחד ומחזיר פרוסת RGB.
ערוצי הפלואורסצנציה אינם נגישים, ושום דבר לא מזהיר אתכם.
סריקות בשדה בהיר באותו פורמט נפתחות בצורה מושלמת, וזו בדיוק הסיבה שהבעיה לא התגלתה.
פרק רביעי. אין קורא גיבוי כללי.
לקחנו את הקובץ האמיתי הקטן ביותר מכל סיומת לא נתמכת באוסף הייחוס.
93 כאלה, וכל אחד מהם הועבר דרך הטוען של הגרסה המופצת.
כל ה-93 נדחו עם הודעה ברורה. אף אחד לא קרס.
אף אחד לא נפתח חלקית למשהו שנראה כמו תמונה אבל לא היה כזה.
לשני פורמטים אין כיסוי בקבצים אמיתיים בכלל.
אין דוגמה ציבורית של אף אחד מהם, ולכן איננו טוענים לתמיכה שנבדקה בהם.
זה אינו מבחן מהירות, וזה אינו תיקוף קליני.
וזה מבחן של יצרן. אנחנו כתבנו את התוכנה ואנחנו הרצנו את המבחן.
מה שאנחנו מציעים במקום עצמאות הוא יכולת בדיקה.
האוסף שלנו אינו מגירת השקופיות שלכם.
התוצאות הגולמיות לכל קובץ מפורסמות כ-JSON.
אוספי הקבצים זמינים להורדה ציבורית, וסקריפט ההרצה נמצא במאגר הקוד שלנו.
פתחו את הקבצים שבאמת עושים לכם בעיות.
ואם אחד מהם נכשל, שלחו אותו אלינו.
הכשלים בסרטון הזה הגיעו לכאן כי מישהו עשה בדיוק את זה.