Что он открывает
Перетаскивайте для перемещения, прокручивайте или сводите пальцы для масштабирования, дважды щёлкните для увеличения; клавиши + и − тоже работают. Если в файле есть размер пикселя, масштабная линейка следует за масштабом. «Сохранить вид как PNG» сохраняет то, что на экране.
Почему большинство онлайн-просмотрщиков показывают 16-битный TIFF чёрным
Камеры микроскопов записывают 12, 14 или 16 бит на пиксель, а экран показывает 8. Просмотрщик, который напрямую отображает 0–65 535 на 0–255, сжимает типичное флуоресцентное изображение, сигнал которого лежит в пределах от нескольких сотен до нескольких тысяч, в несколько самых нижних уровней серого — получается чёрный кадр. Этот просмотрщик задаёт диапазон отображения каждого канала по 0,1-му и 99,9-му процентилям его данных (та же идея, что у кнопки Auto в Fiji), а вы можете ввести точные минимум и максимум или вернуться к полному диапазону. Это меняет только то, что вы видите, но никогда не сам файл.
Что он не открывает
- SVS с JPEG 2000 (сжатие Aperio 33003/33005), JPEG XR и JPEG XL невозможно декодировать в браузере без WebAssembly, а эта страница его не загружает.
- Форматы не на основе TIFF: для CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR и DICOM нужна настольная программа. NDPI похож на TIFF, но хранит каждый уровень как один огромный JPEG, слишком большой для вкладки браузера.
- OME-TIFF с несколькими сериями: показывается первая серия.
- Никаких измерений, аннотаций и анализа: это только просмотрщик.
Для этих форматов, а также для измерений, аннотаций и подсчёта клеток на собственных изображениях SlideScope открывает 34 формата микроскопов и сканеров слайдов в Windows и на Mac. SlideScope — настольное приложение для микроскопии от той же команды — платное, с бесплатной библиотекой образцов (все инструменты) и подпиской для ваших собственных изображений. Бесплатные альтернативы: Fiji (Bio-Formats) и QuPath.
Как он открывает файл, не загружая его на сервер
Когда вы выбираете файл, браузер передаёт этой странице доступ к нему на вашем диске. Страница читает только нужные ей байты: сначала каталог TIFF, затем тайлы для видимой на экране части изображения, и декодирует их прямо на странице с помощью TIFF-ридера с открытым исходным кодом (geotiff). Ничего не отправляется на сервер, поэтому неопубликованные данные и слайды с этикетками пациентов остаются на вашем компьютере, а слайды размером в несколько гигабайт открываются за секунды, потому что никуда не копируются. Закройте вкладку — и файла на странице больше нет.
Страница загружает собственные скрипты со slidescope.science и счётчик просмотров страниц сайта, уважающий конфиденциальность; ни один из них никогда не видит ваше изображение. Лицензии открытого ПО: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Вопросы
Как посмотреть файл TIFF онлайн, не загружая его на сервер?
Откройте его на этой странице: браузер читает файл с вашего диска и отображает его на странице, и ничего не отправляется на сервер. Большинство других онлайн-просмотрщиков TIFF сначала загружают файл на сервер.
Почему мой TIFF выглядит чёрным или полностью белым?
Почти всегда это 16-битное изображение, значения которого занимают лишь малую часть диапазона 0–65 535. «Автоконтраст» растягивает фактический диапазон данных на экран; для сравнимых изображений задайте минимум и максимум вручную.
Может ли он открывать очень большие файлы TIFF?
Да, если файл разбит на тайлы и имеет пирамиду (полнослайдовые изображения, пирамидальный OME-TIFF, BigTIFF): считываются только тайлы на экране, поэтому слайды размером в несколько гигабайт открываются быстро. Большое изображение без пирамиды можно изучать, масштабируя и перемещая его, но нельзя показать целиком.
Открывает ли он многостраничные TIFF и Z-стеки?
Да. Для страниц, Z-плоскостей и временных точек появляются ползунки; гиперстеки OME-TIFF и ImageJ читаются как каналы, Z и время.
Работает ли он на Mac или iPhone?
Он работает в любом современном браузере, включая Safari в macOS и iOS. Safari сам умеет показывать простые TIFF, но не 16-битные, многоканальные или пирамидальные.
Этот просмотрщик TIFF бесплатный?
Да, он бесплатный и не требует учётной записи. SlideScope — настольное приложение для микроскопии от той же команды — платное, с бесплатной библиотекой образцов (все инструменты) и подпиской для ваших собственных изображений.
Нужно больше, чем умеет браузер?
SlideScope открывает 34 формата микроскопов и сканеров слайдов в Windows и на Mac, в том числе CZI, ND2, LIF, MRXS и SVS с JPEG 2000, с измерениями, аннотациями, подсчётом клеток и экспортом в OME-TIFF в полном разрешении. Попробуйте все инструменты бесплатно на встроенных образцах; чтобы открывать собственные изображения, нужна подписка. Уже решили? Оформите подписку.