Darum geht es in diesem Video
Eine ZEISS-.czi-Datei lässt sich auf dem Mac nicht per Doppelklick öffnen, und ZEISS ZEN lite, der kostenlose Viewer des Herstellers, läuft nur unter Windows. Fiji öffnet CZI über Bio-Formats auf jeder Plattform, ist aber eine Analyseplattform. Dieses Video vergleicht die Möglichkeiten und öffnet dann eine echte CZI-Datei in SlideScope.
Sie sehen, wie die Bildpyramide ohne Konvertierung der Datei geladen wird, die Kanäle einzeln und als farbiges Komposit, einen Z-Stapel Ebene für Ebene, die Aufnahme-Metadaten und eine Messung in kalibrierten Mikrometern.
Lieber lesen? So öffnen Sie CZI-Dateien: alle Möglichkeiten im Vergleich.
Transkript
Seit der Aufnahme aktualisiert. Wo das Video sagt, dass SlideScope keine Segmentierung und keine Batch-Quantifizierung bietet, ist das nicht richtig: Seit v1.8.5 segmentiert und zählt Lokale Quantifizierung Zellkerne, Zellen oder Partikel auf Ihrem eigenen Computer und kann ein gespeichertes Rezept auf einen ganzen Ordner anwenden. Eine Skript- oder Makrosprache gibt es weiterhin nicht. Die im Video erwähnte Testversion wird neuen Anmeldungen nicht mehr angeboten, und die genannten Preise haben sich geändert: Die mitgelieferte Beispielbibliothek ist mit allen Werkzeugen kostenlos, und zum Öffnen Ihrer eigenen Bilder benötigen Sie ein Abonnement, abgerechnet bei Abschluss per PayPal oder Karte. Die aktuellen Preise stehen auf der Preisseite. Siehe Preise.
Das ist eine CZI-Datei von einem Zeiss-Mikroskop. Doppelklicken Sie sie auf einem Mac, und nichts passiert.
ZEN lite ist das kostenlose Werkzeug des Herstellers, läuft aber nur unter Windows.
Fiji liest CZI auf dem Mac über Bio-Formats, ist aber eine Analyseplattform für jeweils ein Bild.
Öffnen Sie die .czi-Datei direkt. Kein Importschritt, keine Konvertierung.
Die Bildpyramide wird gelesen, daher lässt sich zoomen, ohne die ganze Datei zu laden.
Verschieben Sie das Bild in voller Auflösung. Der Maßstabsbalken bleibt kalibriert.
Die Kanäle stehen links. Composite überlagert sie farbig.
Schalten Sie jeden Kanal einzeln ein und aus, um zu sehen, was er beiträgt.
Diese Datei ist ein Z-Stapel. Der Schieberegler geht die Fokusebenen durch.
Die Metadaten stehen neben dem Bild: Objektiv, Pixelgröße, Aufnahmeeinstellungen.
Weil die Pixelgröße gelesen wurde, werden Messungen in Mikrometern ausgegeben.
Um den Einsatzbereich klar zu sagen: Dies ist ein Viewer. Keine Segmentierung, keine Batch-Quantifizierung, keine Skripte.
Es exportiert TIFF, sodass sich der Bildausschnitt sauber weitergeben lässt.
Für Forschung, Lehre und Begutachtung. Nicht für die klinische Diagnose.
Dieselbe App unter Windows 10 oder neuer und macOS 14 oder neuer, Apple Silicon oder Intel.
Die Windows-Versionen sind über SSL.com codesigniert.
3 Tage Testversion mit vollem Zugriff, danach $25.00 pro Monat. Der Link steht in der Beschreibung.