O que este vídeo aborda
Um ficheiro ZEISS .czi não abre num Mac com um duplo clique, e o ZEISS ZEN lite, o visualizador gratuito do fabricante, só funciona no Windows. O Fiji abre CZI através do Bio-Formats em qualquer plataforma, mas é uma plataforma de análise. Este vídeo compara as opções e depois abre um CZI real no SlideScope.
Vê a pirâmide da imagem a carregar sem converter o ficheiro, os canais mostrados em separado e como compósito a cores, uma pilha Z percorrida plano a plano, os metadados de aquisição e uma medição em micrómetros calibrados.
Prefere ler? Como abrir ficheiros CZI: todas as opções comparadas.
Transcrição
Atualizado desde a gravação. Onde a narração diz que o SlideScope não faz segmentação nem quantificação em lote, isso não está correto: desde a v1.8.5, a quantificação local segmenta e conta núcleos, células ou partículas no seu próprio computador e pode executar uma receita guardada numa pasta inteira. Continua a não haver scripts nem linguagem de macros. A avaliação referida na narração já não é oferecida a novos registos e os preços indicados mudaram: a biblioteca de amostras incluída é gratuita com todas as ferramentas, e para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição, cobrada no momento em que subscreve, com PayPal ou cartão. Os preços atuais estão na página de preços. Consulte os preços.
Isto é um ficheiro CZI de um microscópio Zeiss. Faça duplo clique nele num Mac e nada acontece.
O ZEN lite é a ferramenta gratuita do fabricante, mas só funciona no Windows.
O Fiji lê CZI através do Bio-Formats no Mac, mas é uma plataforma de análise para uma imagem.
Abra o .czi diretamente. Sem passo de importação, sem conversão.
Lê a pirâmide da imagem, por isso faz zoom sem carregar o ficheiro inteiro.
Desloque-se pela imagem em resolução total. A barra de escala mantém-se calibrada.
Os canais estão listados à esquerda. O Composite combina-os a cores.
Ligue e desligue cada canal de forma independente para ver o que ele acrescenta.
Este ficheiro é uma pilha Z. O cursor percorre os planos focais.
Os metadados ficam ao lado da imagem: objetiva, tamanho de píxel, definições de aquisição.
Como leu o tamanho de píxel, as medições aparecem em micrómetros.
Para ser claro quanto ao âmbito: isto é um visualizador. Sem segmentação, quantificação em lote nem scripts.
Exporta TIFF, por isso entregar a região a outra pessoa é simples.
Para investigação, ensino e revisão. Não para diagnóstico clínico.
A mesma aplicação no Windows 10 ou posterior e no macOS 14 ou posterior, Apple Silicon ou Intel.
As versões para Windows têm assinatura de código através da SSL.com.
Uma avaliação de 3 dias com acesso total e depois $25.00 por mês. A ligação está na descrição.