Qué cubre este video
Un archivo .czi de ZEISS no se abre en una Mac con doble clic, y ZEISS ZEN lite, el visor gratuito del fabricante, solo funciona en Windows. Fiji abre CZI mediante Bio-Formats en cualquier plataforma, pero es una plataforma de análisis. Este video compara las opciones y luego abre un CZI real en SlideScope.
Verás cómo se carga la pirámide de imagen sin convertir el archivo, los canales mostrados por separado y como composición en color, una pila Z recorrida plano por plano, los metadatos de adquisición y una medición en micrómetros calibrados.
¿Prefieres leer? Cómo abrir archivos CZI: todas las opciones comparadas.
Transcripción
Actualizado después de la grabación. Donde la narración dice que SlideScope no hace segmentación ni cuantificación por lotes, eso no es correcto: desde la v1.8.5, Local Quantification segmenta y cuenta núcleos, células o partículas en tu propia computadora y puede ejecutar una receta guardada sobre una carpeta. Sigue sin haber un lenguaje de scripts ni de macros. La prueba que menciona la narración ya no se ofrece a quienes se registran por primera vez, y los precios citados cambiaron: la biblioteca de muestras incluida es gratuita con todas las herramientas, y abrir tus propias imágenes requiere una suscripción, que se cobra al suscribirte con PayPal o tarjeta. Los precios actuales están en la página de precios. Consulta los precios.
Este es un archivo CZI de un microscopio Zeiss. Haz doble clic en él en una Mac y no pasa nada.
ZEN lite es la herramienta gratuita del fabricante, pero solo funciona en Windows.
Fiji lee CZI mediante Bio-Formats en Mac, pero es una plataforma de análisis para una imagen.
Abre el .czi directamente. Sin paso de importación, sin conversión.
Lee la pirámide de imagen, así que hace zoom sin cargar el archivo completo.
Desplázate a resolución completa. La barra de escala se mantiene calibrada.
Los canales aparecen a la izquierda. Composite los combina en color.
Activa o desactiva cada canal por separado para ver lo que aporta.
Este archivo es una pila Z. El control deslizante recorre los planos focales.
Los metadatos están junto a la imagen: objetivo, tamaño de píxel, parámetros de adquisición.
Como leyó el tamaño de píxel, las mediciones salen en micrómetros.
Para ser claros sobre el alcance: esto es un visor. Sin segmentación, cuantificación por lotes ni scripts.
Exporta TIFF, así que entregar la región es sencillo.
Para investigación, docencia y revisión. No para diagnóstico clínico.
La misma app en Windows 10 o posterior y macOS 14 o posterior, Apple Silicon o Intel.
Las versiones para Windows están firmadas con código a través de SSL.com.
Una prueba de 3 días con acceso completo y luego $25.00 al mes. El enlace está en la descripción.