Di cosa parla questo video
Su un Mac un file ZEISS .czi non si apre con un doppio clic, e ZEISS ZEN lite, il visualizzatore gratuito del produttore, funziona solo su Windows. Fiji apre i CZI tramite Bio-Formats su qualsiasi piattaforma, ma è una piattaforma di analisi. Questo video confronta le opzioni, poi apre un vero file CZI in SlideScope.
Vedrai la piramide dell’immagine caricarsi senza convertire il file, i canali mostrati separatamente e come composito a colori, uno Z-stack scorso piano per piano, i metadati di acquisizione e una misura in micrometri calibrati.
Preferisci leggere? Come aprire file CZI: tutte le opzioni a confronto.
Trascrizione
Aggiornato dopo la registrazione. Dove la narrazione dice che SlideScope non fa segmentazione né quantificazione in batch, non è corretto: dalla v1.8.5, Local Quantification segmenta e conta nuclei, cellule o particelle sul tuo computer e può applicare una ricetta salvata a un’intera cartella. Non c’è ancora un linguaggio di scripting o di macro. La prova citata nella narrazione non è più offerta ai nuovi iscritti e i prezzi indicati sono cambiati: la libreria di campioni inclusa è gratuita con tutti gli strumenti, mentre per aprire le tue immagini serve un abbonamento, addebitato al momento della sottoscrizione con PayPal o carta. I prezzi attuali sono nella pagina dei prezzi. Vedi prezzi.
Questo è un file CZI di un microscopio Zeiss. Fai doppio clic su un Mac e non succede nulla.
ZEN lite è lo strumento gratuito del produttore, ma funziona solo su Windows.
Fiji legge i CZI tramite Bio-Formats su Mac, ma è una piattaforma di analisi per una singola immagine.
Apri direttamente il file .czi. Nessun passaggio di importazione, nessuna conversione.
Legge la piramide dell’immagine, quindi ingrandisce senza caricare l’intero file.
Spostati nell’immagine a piena risoluzione. La barra di scala resta calibrata.
I canali sono elencati a sinistra. La vista composita li fonde a colori.
Attiva e disattiva ogni canale separatamente per vedere che cosa apporta.
Questo file è uno Z-stack. Il cursore scorre i piani focali.
I metadati stanno accanto all’immagine: obiettivo, dimensione del pixel, impostazioni di acquisizione.
Avendo letto la dimensione del pixel, le misure risultano in micrometri.
Per essere chiari sull’ambito: questo è un visualizzatore. Niente segmentazione, quantificazione in batch o scripting.
Esporta in TIFF, così il passaggio della regione ad altri è pulito.
Per ricerca, didattica e revisione. Non per la diagnosi clinica.
La stessa app su Windows 10 o successivi e macOS 14 o successivi, Apple Silicon o Intel.
Le versioni per Windows sono firmate digitalmente tramite SSL.com.
Una prova di 3 giorni con accesso completo, poi $25.00 al mese. Il link è nella descrizione.