SlideScope abre archivos CZI de Zeiss de forma nativa en macOS 14 o posterior, en Mac con Apple Silicon e Intel: todas las escenas, canales, planos Z y puntos de tiempo, con el tamaño de píxel que registra el archivo. Exporta la escena que estás viendo, o todas las escenas, a un solo archivo OME-TIFF. ZEN lite, el visor gratuito de ZEISS, solo funciona en Windows. ¿Usas Windows? Consulta cómo abrir archivos CZI en Windows y Mac.
Escenas, canales, Z y tiempoExportación a OME-TIFFApple Silicon e Intel
Instala SlideScope en tu Mac
Descarga la versión para macOS que corresponde a tu Mac: Apple Silicon (serie M) o Intel. La página de descarga te recomienda la correcta.
Abre el DMG y arrastra SlideScope a Aplicaciones. La guía de instalación en macOS muestra cada paso con capturas de pantalla, incluido qué hacer si macOS te pide confirmar la primera apertura.
Abre una muestra de la biblioteca incluida, o tu propia lámina. Explora gratis la biblioteca de muestras incluida, con todas las herramientas. Abrir tus propias imágenes requiere una suscripción. La suscripción solo empieza cuando la eliges al pagar.
Archivos CZI multiescena: ve todas las escenas y exporta a OME-TIFF
Un CZI puede contener varias escenas: los pocillos de una placa, regiones de mosaico o las regiones de escaneo de una lámina. SlideScope muestra cada escena por separado o todas juntas, y exporta a OME-TIFF la escena que estás viendo o todas las escenas. El video y los pasos siguientes usan un archivo de muestra público de dos escenas.
Mira el flujo de trabajo completo (1 min 41 s)
Abrir un CZI de dos escenas, cambiar de escena, XY Overview, canales, Details, exportar una escena y todas las escenas, y volver a abrir el OME-TIFF. Narración en inglés; subtítulos en todos los idiomas del sitio. Grabado con SlideScope 1.8.56 en Windows; la versión para macOS tiene los mismos controles. Actualizado después de la grabación: abrir y exportar tus propias imágenes ahora requiere una suscripción. Las muestras incluidas siguen siendo gratuitas con todas las herramientas.Transcripción
Un archivo CZI puede contener varias escenas: pocillos de una placa, regiones de mosaico o regiones de escaneo. Así puedes ver cada una y exportarlas como OME-TIFF.
Un CZI con dos escenas, abierto directamente. Sin conversión. El control Scene pasa de una escena a la siguiente. La escena 2 es el pocillo D7. La escena 1 es el pocillo D6. XY Overview ubica cada escena donde se registró. Estos dos pocillos están a 9 mm de distancia.
Combina los canales en una sola vista. Apaga un canal para ver lo que aporta. Acerca el zoom. La barra de escala sigue calibrada. Details muestra el tamaño de píxel, los canales y los parámetros de adquisición.
Para exportar, elige File y luego Export Current Image as TIFF. Mientras ves una escena, solo se exporta esa escena. Antes de empezar, ves el tamaño de píxel, los canales y la compresión que se escribirán. Para exportar todas las escenas, primero activa XY Overview. Todas las escenas van a un solo archivo OME-TIFF. Cada escena es una imagen propia dentro de él.
Abre el resultado. Ambas escenas están ahí, como imagen 1 e imagen 2. El tamaño de píxel y los nombres de los canales se conservaron.
Una cuenta gratuita te permite abrir y ver imágenes locales antes de cualquier prueba. Exportar requiere la prueba de 3 días o una suscripción. Un escaneo grande en mosaico se exporta a su resolución de vista general, no al escaneo completo. Es la misma aplicación en macOS y Windows. Estas imágenes se grabaron en Windows.
Paso 1
Abre el archivo CZI
Elige File › Open File… (Ctrl+O en Windows, ⌘O en una Mac) o arrastra el archivo .czi a la ventana. La primera escena aparece de inmediato. No se convierte nada y el archivo no se sube.
Paso 2
Recorre las escenas
Un archivo con varias escenas muestra un control Scene debajo de la imagen. Usa − y + o escribe un número. Cada escena conserva su propio tamaño y su nombre del archivo, como un pocillo (D6, D7) o una región de mosaico.
Paso 3
Ve todas las escenas en XY Overview
Haz clic en XY Overview junto al control Scene, o elige View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Cada escena se dibuja donde se registró, con los espacios incluidos. Haz clic en una escena para seleccionarla y doble clic para abrirla. Las escenas que están muy separadas, como pocillos a 9 mm de distancia, aparecen primero como mosaicos pequeños: acerca el zoom para verlas.
Paso 4
Revisa los canales, el tamaño de píxel y los metadatos
En Display, marca Blend channels into one view para obtener una composición a color, o apaga canales individuales. Details muestra el tamaño de píxel, las dimensiones, la escena actual y su tamaño. El brillo, el contraste y los colores solo cambian lo que ves, nunca los píxeles almacenados.
Paso 5
Elige File › Export Current Image as TIFF
Elige File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Selecciona una carpeta y un nombre; SlideScope sugiere uno que termina en .ome.tif.
Paso 6
Exporta una escena o todas las escenas
Mientras hay una sola escena en pantalla, solo se exporta esa escena, con un nombre como sample_scene-2.ome.tif. Para exportar todas las escenas, primero activa XY Overview: todas las escenas van a un solo archivo OME-TIFF, cada una como una imagen propia con su propio tamaño. Antes de escribir nada, una confirmación muestra el tamaño, el tamaño de píxel, los canales y la compresión.
Paso 7
Abre el resultado
Haz clic en Open Exported TIFF cuando termine la exportación. SlideScope muestra cada escena exportada como una imagen; recórrelas con el control Image. Los lectores de OME-TIFF que admiten varias imágenes por archivo, como Bio-Formats en Fiji, las muestran como series separadas.
Qué contiene el OME-TIFF exportado
Un solo archivo. Exportar la escena en pantalla escribe una imagen; exportar desde XY Overview escribe cada escena como una imagen separada dentro del mismo archivo, cada una con su propio tamaño. No crea un archivo por escena.
Los píxeles se escriben sin cambios, con compresión sin pérdida (Deflate). El brillo, el contraste y la gamma son ajustes de visualización y no se aplican a la exportación.
El tamaño de píxel en micrómetros, el paso Z cuando hay una pila Z, los nombres de los canales registrados en el CZI y los colores de canal configurados en ese momento en el visor. Un archivo sin tamaño de píxel registrado se exporta sin él; SlideScope no inventa una calibración.
Resolución: las escenas que caben en la memoria se exportan a resolución completa. Un escaneo grande en mosaico, como una región de un escáner de láminas, se exporta a su resolución de vista general. La confirmación indica la proporción, por ejemplo 1:8, y el tamaño de píxel registrado se ajusta en consecuencia. El escaneo a resolución completa se puede seguir viendo región por región en SlideScope.
Una sola imagen exportada de más de 4,096 píxeles de ancho o de alto también recibe niveles piramidales de resolución reducida. Un archivo con varias imágenes no. Los archivos de más de 2 GiB se escriben como BigTIFF.
No se copian: el resto de los metadatos de adquisición del CZI, ni las posiciones de las escenas como coordenadas de la platina. Conserva el CZI original como archivo de respaldo.
Qué necesitas
Windows 10 u 11, o macOS 14 o posterior en Apple Silicon o Intel. Explora gratis la biblioteca de muestras incluida, con todas las herramientas. Abrir tus propias imágenes requiere una suscripción. La suscripción cuesta $35.00 al mes e incluye la exportación.
Si algo no se ve bien
Solo aparece una escena
Las escenas se pueden recorrer cuando comparten el tipo de píxel y los mismos canales, planos Z y puntos de tiempo. Si no es así, SlideScope muestra la primera escena y explica el motivo en Details. Si eso no es lo que esperas, envíanos el archivo.
Los colores son distintos a los de ZEN
Los colores de los canales provienen del archivo cuando este los registra. Cámbialos en Display › Channel colour…; la exportación registra los colores que configures.
La exportación es más pequeña que el escaneo
Un escaneo grande en mosaico se exporta a su resolución de vista general, y la confirmación lo indica antes de escribir nada. El escaneo a resolución completa se puede seguir viendo en SlideScope.
La exportación te pide suscribirte
Con las muestras incluidas, todas las herramientas funcionan gratis, incluida la exportación. Exportar tus propias imágenes requiere una suscripción.
Muestra usada en el video y las capturas de pantalla: S2_3x3_CH2.czi de los datos de muestra de czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), dos escenas de un mosaico de 3 × 3 con DAPI y EGFP. Sin datos de clientes.
Qué tan probada está la compatibilidad con CZI
En nuestra prueba de formatos publicada, realizada el 2026-09-18, se abrieron los 48 de 48 archivos CZI, con hasta 8 canales, 56 planos Z y 10 puntos de tiempo; el más grande pesaba 4.5 GB. Es nuestra propia prueba de los lectores que distribuimos, publicada con sus datos sin procesar, no una certificación independiente, y los archivos de muestra no cubren todas las variantes de CZI en uso. Los archivos de prueba públicos incluyen placas de pocillos multiescena y regiones de mosaico, pero ningún CZI multiescena de escáner de láminas, así que ese caso tiene menos cobertura. Consulta el benchmark de formatos y la referencia de compatibilidad.
Otras formas de abrir CZI en una Mac
Herramienta
Útil para
Ten en cuenta
SlideScope
Abrir, revisar, medir y exportar archivos CZI en una Mac, junto con ND2, SVS y otros formatos.
Un visor y una herramienta de revisión. Sin scripts ni pipelines de análisis personalizados.
Fiji / ImageJ con Bio-Formats
Análisis gratuito y de código abierto con plugins y macros; lee CZI en macOS.
Una plataforma de análisis; cada escena se importa como una serie mediante un diálogo de importación.
QuPath
Análisis gratuito de láminas completas; lee CZI mediante Bio-Formats.
Diseñado en torno a proyectos de análisis de láminas más que a la revisión rápida de pilas multidimensionales.
ZEISS ZEN lite
El visor gratuito del fabricante, el más cercano al software de adquisición.
Solo para Windows, así que no es una opción en una Mac sin Windows.
Preguntas
¿Puedo abrir archivos CZI en una Mac?
Sí. SlideScope abre archivos CZI de forma nativa en macOS 14 o posterior, en Mac con Apple Silicon e Intel, incluidos archivos con varias escenas, canales, planos Z y puntos de tiempo. Fiji con Bio-Formats también abre CZI en una Mac. ZEN lite, el visor gratuito de ZEISS, es una aplicación para Windows.
¿Cómo veo todas las escenas de un archivo CZI?
Usa el control Scene debajo de la imagen para pasar de una escena a otra, o activa XY Overview para ver todas las escenas en su posición registrada. Cada escena conserva su propio tamaño y nombre.
¿Puedo exportar una escena de CZI a OME-TIFF?
Sí. File › Export Current Image as TIFF exporta la escena en pantalla, o todas las escenas cuando XY Overview está activado. Cada escena se convierte en una imagen propia dentro de un solo archivo OME-TIFF, con compresión sin pérdida, tamaño de píxel y nombres de canales. Exportar tus propios archivos requiere una suscripción; las muestras incluidas se exportan gratis.
¿SlideScope está afiliado a ZEISS?
No. SlideScope es independiente y no está afiliado a ZEISS. Los nombres de productos solo describen el formato de archivo y la intención de comparación.
SlideScope no está afiliado a ZEISS. ZEISS, ZEN y CZI se mencionan para describir la compatibilidad de archivos. SlideScope es para investigación, educación y revisión, no para diagnóstico.
Cuándo SlideScope es la opción correcta
Elige SlideScope si quieres una sola aplicación de escritorio nativa, en una Mac o en una PC con Windows, que abra láminas y archivos de microscopía de muchos fabricantes (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM y más), mida en unidades calibradas y cuente núcleos y células sin escribir código, con todos los archivos guardados en tu propia computadora.
Es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita: todas las herramientas funcionan con las muestras incluidas, y abrir tus propias imágenes requiere una suscripción (PayPal o tarjeta). Si solo abres el formato de un fabricante en Windows, el visor gratuito de ese fabricante puede ser todo lo que necesitas; para análisis mediante scripts, QuPath y Fiji son gratuitos y de código abierto.
Pruébalo con tu propio archivo CZI
Explora gratis la biblioteca de muestras incluida, con todas las herramientas. Abrir tus propias imágenes requiere una suscripción. La suscripción cuesta $35.00 al mes y se cobra al suscribirte (PayPal o tarjeta). Cancela cuando quieras desde tu cuenta.
