Aprende SlideScope

De la instalación a resultados reales

Cada guía de abajo es una tarea que alguien necesita terminar de verdad, con un estimado de tiempo honesto y tres pasos. Empieza por la ruta inicial si SlideScope es nuevo para ti, o anda directo al trabajo que tienes delante.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Empieza aquí

Unos diez minutos, una sola vez. Hazlos en orden y todo lo demás de esta página va a tener sentido.

  1. Instala y activa

    Descarga la compilación firmada para Windows o macOS e inicia sesión con la cuenta que usaste para la prueba o la suscripción. La activación se vincula a la computadora, y una suscripción cubre dos dispositivos, así que tu laptop y tu estación de trabajo pueden estar conectadas a la vez.

  2. Abre tu primera lámina

    Arrastra un archivo CZI, ND2, SVS, NDPI, DICOM o TIFF sobre la ventana. No hay paso de importación ni conversión: SlideScope lee directamente la pirámide del escáner, así que una lámina de gigapíxeles se abre en una laptop corriente.

  3. Ubícate

    Desplaza para acercar, arrastra para moverte y usa el navegador de vista general para saltar por la lámina sin perder el punto. Revisa pronto el panel de metadatos: el tamaño de píxel que aparece ahí es lo que hace que cada medición posterior sea calibrada y no aproximada.

Guías por tarea

Elige la que coincida con lo que intentas hacer hoy.

Contar núcleos en una imagen de fluorescencia

6 min
  1. Abre la imagen y selecciona la región que quieres contar. Cuantificar una región en vez de toda la lámina mantiene rápida la corrida y deja el resultado sobre el tejido que te importa.
  2. En el panel de cuantificación elige Núcleos, selecciona InstanSeg como motor y fija el canal de segmentación en tu DAPI o tinción nuclear. Deja los ajustes avanzados como están en la primera corrida.
  3. Córrelo y lee la superposición antes que la cifra. Haz clic en cualquier objeto que se vea mal y exclúyelo; después exporta juntos el CSV y el resumen de métodos.

Medir una estructura en micrómetros

4 min
  1. Confirma que el panel de metadatos muestre un tamaño de píxel. Si el escáner lo registró, las mediciones salen en micrómetros reales; si no, calibra manualmente antes de medir nada.
  2. Elige la herramienta de medición y traza sobre la estructura. Distancias y áreas se calculan a resolución completa de la lámina, no al nivel de zoom en el que estés mirando.
  3. Guarda la medición para que quede unida a la lámina y exporta después la tabla como CSV o las regiones como GeoJSON cuando las necesites fuera.

Comparar H&E con su recorte de IHQ

5 min
  1. Abre la primera lámina y luego la segunda al lado. Ambos paneles quedan fijados a la misma zona del tejido con el mismo aumento.
  2. La escala se iguala en micrómetros y no por factor de zoom, así que dos digitalizaciones con distinta resolución se corresponden de verdad. Mueve o acerca cualquiera de los paneles y el otro lo sigue.
  3. Anota en el panel que tenga sentido. Las notas quedan unidas a su propia lámina y a tu cuenta, así que el siguiente revisor las verá.

Cuantificar una carpeta entera de una vez

8 min
  1. Primero acierta con una imagen. Ajusta tipo de objeto, motor, canal y límites de área en una sola imagen representativa hasta que la superposición se vea correcta.
  2. Guarda esos ajustes como receta y ponle un nombre que reconozcas dentro de tres meses.
  3. Elige el lote por carpeta, apúntalo al directorio y déjalo correr. Obtienes exportaciones por imagen más un CSV resumen del lote, con todas las imágenes analizadas con ajustes idénticos.

Compartir la vista exacta que estás mirando

3 min
  1. Colócate en el campo de visión que quieres que vea la otra persona, con el zoom y el plano que quieres que vea.
  2. Crea un enlace de vista compartida. Lleva la lámina junto con la posición, el zoom y el plano, así que no tendrá que buscar por una digitalización de gigapíxeles.
  3. Envíalo. Quien tenga SlideScope instalado lo abre con un clic mediante el esquema slidescope://; quien no lo tenga ve primero en la web a qué apunta el enlace.

Referencia

Ten esto abierto en una pestaña mientras trabajas.

Preguntas frecuentes

Soy totalmente nuevo. ¿Por dónde empiezo?

Haz los tres pasos iniciales en orden y después la guía de medición. Esas cuatro cosas cubren casi todo lo que necesita un usuario nuevo en la primera semana. La guía de conteo vale la pena a continuación aunque todavía no creas necesitar cuantificación, porque es la forma más rápida de entender cómo trata SlideScope la calibración.

¿Necesito aprender a programar?

No. Nada de esta página requiere un script, una macro, un complemento ni un entorno de Python. La cuantificación se maneja con recetas guardadas en lugar de código: menos flexible que una plataforma programable, mucho más rápido para obtener un resultado.

¿Cómo capacito al resto de mi laboratorio?

Mándales un enlace de vista compartida que apunte a una lámina real de tu propio trabajo, junto con esta página. Abrir algo familiar funciona mejor que un archivo de tutorial artificial, y el enlace hace que vean el mismo campo de visión que tú y no otra esquina de la digitalización.

Apréndelo con tus propias imágenes

La prueba de 14 días es de acceso completo. Recorre estas guías con las láminas que tu laboratorio maneja de verdad, no con un archivo de ejemplo.

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