O SlideScope abre ficheiros Zeiss CZI de forma nativa no macOS 14 ou posterior, em Macs Apple Silicon e Intel: todas as cenas, canais, planos Z e pontos temporais, com o tamanho de píxel que o ficheiro regista. Exporta a cena que está a ver, ou todas as cenas, para um único ficheiro OME-TIFF. O ZEN lite, o visualizador gratuito da ZEISS, só funciona no Windows. Usa Windows? Veja como abrir ficheiros CZI no Windows e no Mac.
Cenas, canais, Z e tempoExportação para OME-TIFFApple Silicon e Intel
Instale o SlideScope no seu Mac
Transfira a versão para macOS adequada ao seu Mac: Apple Silicon (série M) ou Intel. A página de transferência recomenda a versão certa.
Abra o DMG e arraste o SlideScope para Aplicações. O guia de instalação para macOS mostra todos os passos com capturas de ecrã, incluindo o que fazer se o macOS lhe pedir para confirmar a primeira abertura.
Abra uma amostra da biblioteca incluída, ou a sua própria lâmina. Explore gratuitamente a biblioteca de amostras incluída, com todas as ferramentas. Para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição. A subscrição só começa quando a escolher no checkout.
Ficheiros CZI com várias cenas: ver todas as cenas e exportar OME-TIFF
Um CZI pode conter várias cenas: os poços de uma placa, regiões de mosaico ou as regiões digitalizadas de uma lâmina. O SlideScope mostra cada cena isoladamente ou todas em conjunto, e exporta a cena que está a ver ou todas as cenas para OME-TIFF. O vídeo e os passos abaixo usam um ficheiro de amostra público com duas cenas.
Veja todo o processo (1 min 41 s)
Abrir um CZI com duas cenas, mudar de cena, XY Overview, canais, Details, exportar uma cena e todas as cenas e reabrir o OME-TIFF. Narração em inglês; legendas em todos os idiomas do site. Gerado a partir do SlideScope 1.8.56 no Windows; a versão para macOS tem os mesmos controlos. Atualizado desde a gravação: abrir e exportar as suas próprias imagens requer agora uma subscrição. As amostras incluídas continuam gratuitas, com todas as ferramentas.Transcrição
Um ficheiro CZI pode conter várias cenas: poços de uma placa, regiões de mosaico ou regiões digitalizadas. Veja como visualizar cada uma e exportá-las como OME-TIFF.
Um CZI com duas cenas, aberto diretamente. Sem conversão. O controlo Scene passa de uma cena para a seguinte. A cena 2 é o poço D7. A cena 1 é o poço D6. O XY Overview coloca cada cena no sítio onde foi registada. Estes dois poços estão a 9 mm um do outro.
Combine os canais numa única vista (Blend channels into one view). Desligue um canal para ver o que ele acrescenta. Faça zoom. A barra de escala mantém-se calibrada. O painel Details indica o tamanho de píxel, os canais e as definições de aquisição.
Para exportar, escolha File e depois Export Current Image as TIFF. Enquanto visualiza uma cena, só essa cena é exportada. Antes de começar, vê o tamanho de píxel, os canais e a compressão que serão gravados. Para exportar todas as cenas, ative primeiro o XY Overview. Todas as cenas vão para um único ficheiro OME-TIFF. Cada cena é uma imagem própria dentro dele.
Abra o resultado. As duas cenas estão lá, como imagem 1 e imagem 2. O tamanho de píxel e os nomes dos canais foram preservados.
Uma conta gratuita permite abrir e visualizar imagens locais antes de qualquer avaliação. A exportação precisa da avaliação de 3 dias ou de uma subscrição. Uma digitalização em mosaico grande é exportada na resolução da vista geral, não na digitalização completa. É a mesma aplicação no macOS e no Windows. Estas imagens foram geradas no Windows.
Passo 1
Abra o ficheiro CZI
Escolha File › Open File… (Ctrl+O no Windows, ⌘O num Mac) ou arraste o ficheiro .czi para a janela. A primeira cena aparece de imediato. Nada é convertido e o ficheiro não é carregado.
Passo 2
Percorra as cenas
Um ficheiro com várias cenas mostra um controlo Scene por baixo da imagem. Use − e + ou escreva um número. Cada cena mantém o seu próprio tamanho e o nome que tem no ficheiro, como um poço (D6, D7) ou uma região de mosaico.
Passo 3
Veja todas as cenas no XY Overview
Clique em XY Overview ao lado do controlo Scene, ou escolha View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Cada cena é desenhada onde foi registada, incluindo os espaços entre elas. Clique numa cena para a selecionar e faça duplo clique para a abrir. As cenas muito afastadas, como poços a 9 mm uns dos outros, começam como pequenos mosaicos: faça zoom para as ver.
Passo 4
Verifique os canais, o tamanho de píxel e os metadados
Em Display, assinale Blend channels into one view para obter um compósito a cores, ou desligue canais individuais. Details indica o tamanho de píxel, as dimensões, a cena atual e o respetivo tamanho. O brilho, o contraste e as cores só alteram o que vê, nunca os píxeis guardados.
Passo 5
Escolha File › Export Current Image as TIFF
Escolha File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Escolha uma pasta e um nome; o SlideScope sugere um que termina em .ome.tif.
Passo 6
Exporte uma cena, ou todas as cenas
Enquanto estiver uma única cena no ecrã, só essa cena é exportada, com um nome como sample_scene-2.ome.tif. Para exportar todas as cenas, ative primeiro o XY Overview: todas as cenas vão para um único ficheiro OME-TIFF, cada uma como imagem própria, com o seu próprio tamanho. Antes de qualquer gravação, uma confirmação mostra o tamanho, o tamanho de píxel, os canais e a compressão.
Passo 7
Abra o resultado
Clique em Open Exported TIFF quando a exportação terminar. O SlideScope mostra cada cena exportada como uma imagem; percorra-as com o controlo Image. Os leitores de OME-TIFF que suportam várias imagens por ficheiro, como o Bio-Formats no Fiji, apresentam-nas como séries separadas.
O que contém o OME-TIFF exportado
Um único ficheiro. Exportar a cena que está no ecrã grava uma imagem; exportar a partir do XY Overview grava cada cena como uma imagem separada dentro do mesmo ficheiro, cada uma com o seu próprio tamanho. Não cria um ficheiro por cena.
Os píxeis são gravados sem alterações, com compressão sem perdas (Deflate). O brilho, o contraste e a gama são definições de visualização e não são aplicados à exportação.
Tamanho de píxel em micrómetros, o passo Z quando há uma pilha Z, os nomes dos canais registados no CZI e as cores dos canais definidas nesse momento no visualizador. Um ficheiro sem tamanho de píxel registado é exportado sem ele; o SlideScope não inventa uma calibração.
Resolução: as cenas que cabem na memória são exportadas em resolução completa. Uma digitalização em mosaico grande, como uma região de um digitalizador de lâminas, é exportada na resolução da vista geral. A confirmação indica a proporção, por exemplo 1:8, e o tamanho de píxel registado é ajustado em conformidade. A digitalização em resolução completa continua visível região a região no SlideScope.
Uma única imagem exportada com mais de 4096 píxeis de largura ou de altura recebe também níveis de pirâmide de resolução reduzida. Um ficheiro com várias imagens não os recebe. Os ficheiros com mais de 2 GiB são gravados como BigTIFF.
Não é copiado: o resto dos metadados de aquisição do CZI e as posições das cenas como coordenadas da platina. Guarde o CZI original como ficheiro de arquivo.
O que precisa
Windows 10 ou 11, ou macOS 14 ou posterior em Apple Silicon ou Intel. Explore gratuitamente a biblioteca de amostras incluída, com todas as ferramentas. Para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição. A subscrição custa $35.00 por mês e inclui a exportação.
Se algo parecer errado
Só aparece uma cena
As cenas passam a poder ser percorridas quando partilham o tipo de píxel e os mesmos canais, planos Z e pontos temporais. Se não for o caso, o SlideScope mostra a primeira cena e explica porquê em Details. Se não for isso que espera, envie-nos o ficheiro.
As cores são diferentes das do ZEN
As cores dos canais vêm do ficheiro, quando este as regista. Altere-as em Display › Channel colour…; a exportação regista as cores que definir.
A exportação é mais pequena do que a digitalização
Uma digitalização em mosaico grande é exportada na resolução da vista geral, e a confirmação indica-o antes de qualquer gravação. A digitalização em resolução completa continua visível no SlideScope.
A exportação pede-lhe que subscreva
Nas amostras incluídas, todas as ferramentas funcionam gratuitamente, incluindo a exportação. Exportar as suas próprias imagens requer uma subscrição.
Amostra usada no vídeo e nas capturas de ecrã: S2_3x3_CH2.czi dos dados de amostra do czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), duas cenas de um mosaico 3 × 3 com DAPI e EGFP. Nenhum dado de clientes.
Como é testado o suporte de CZI
No nosso teste de formatos publicado, realizado a 2026-09-18, abriram-se todos os 48 de 48 ficheiros CZI, com até 8 canais, 56 planos Z e 10 pontos temporais; o maior tinha 4,5 GB. É um teste nosso aos leitores incluídos na versão distribuída, publicado com os dados em bruto, não uma certificação independente, e os ficheiros de amostra não abrangem todas as variantes de CZI em uso. Os ficheiros de teste públicos incluem placas de poços e regiões de mosaico com várias cenas, mas nenhum CZI de digitalizador de lâminas com várias cenas, por isso esse caso tem menos cobertura. Consulte o benchmark de formatos e a referência de compatibilidade.
Outras formas de abrir CZI num Mac
Ferramenta
Indicado para
A ter em conta
SlideScope
Abrir, rever, medir e exportar ficheiros CZI num Mac, a par de ND2, SVS e outros formatos.
Uma ferramenta de visualização e revisão. Sem scripts nem pipelines de análise personalizados.
Fiji / ImageJ com Bio-Formats
Análise gratuita e de código aberto com plugins e macros; lê CZI no macOS.
Uma plataforma de análise; cada cena é importada como uma série através de uma caixa de diálogo de importação.
QuPath
Análise gratuita de lâminas inteiras; lê CZI através do Bio-Formats.
Concebido em torno de projetos de análise de lâminas e não da revisão rápida de pilhas multidimensionais.
ZEISS ZEN lite
O visualizador gratuito do fabricante, o mais próximo do software de aquisição.
Só para Windows, por isso não é opção num Mac sem Windows.
Perguntas
Posso abrir ficheiros CZI num Mac?
Sim. O SlideScope abre ficheiros CZI de forma nativa no macOS 14 ou posterior, em Macs Apple Silicon e Intel, incluindo ficheiros com várias cenas, canais, planos Z e pontos temporais. O Fiji com Bio-Formats também abre CZI num Mac. O ZEN lite, o visualizador gratuito da ZEISS, é uma aplicação para Windows.
Como vejo todas as cenas de um ficheiro CZI?
Use o controlo Scene por baixo da imagem para passar de cena em cena, ou ative o XY Overview para ver todas as cenas na posição em que foram registadas. Cada cena mantém o seu próprio tamanho e nome.
Posso exportar uma cena CZI para OME-TIFF?
Sim. File › Export Current Image as TIFF exporta a cena que está no ecrã, ou todas as cenas quando o XY Overview está ativo. Cada cena torna-se uma imagem própria dentro de um único ficheiro OME-TIFF, com compressão sem perdas, tamanho de píxel e nomes dos canais. Exportar os seus próprios ficheiros requer uma subscrição; as amostras incluídas exportam gratuitamente.
O SlideScope está afiliado à ZEISS?
Não. O SlideScope é independente e não está afiliado à ZEISS. Os nomes dos produtos servem apenas para descrever pesquisas sobre formatos de ficheiro e comparações.
O SlideScope não está afiliado à ZEISS. ZEISS, ZEN e CZI são mencionados para descrever a compatibilidade de ficheiros. O SlideScope destina-se a investigação, educação e revisão, não a diagnóstico.
Quando o SlideScope é a escolha certa
Escolha o SlideScope quando quiser uma única aplicação nativa para computador, num Mac ou num PC Windows, que abra lâminas e ficheiros de microscopia de vários fabricantes (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM e outros), meça em unidades calibradas e conte núcleos e células sem escrever código, mantendo todos os ficheiros no seu próprio computador.
É uma aplicação paga com uma biblioteca de amostras gratuita: todas as ferramentas funcionam nas amostras incluídas e as suas próprias imagens precisam de uma subscrição (PayPal ou cartão). Se só abre o formato de um fabricante no Windows, o visualizador gratuito desse fabricante pode ser tudo o que precisa; para análise com scripts, o QuPath e o Fiji são gratuitos e de código aberto.
Experimente com o seu próprio ficheiro CZI
Explore gratuitamente a biblioteca de amostras incluída, com todas as ferramentas. Para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição. A subscrição custa $35.00 por mês, cobrada no momento em que subscreve (PayPal ou cartão). Cancele quando quiser a partir da sua conta.
