De-Identifizierung

So entfernen Sie Etiketten und Patientendaten aus Präparatbildern

Ein Whole-Slide-Bild enthält mehr als das Gewebe: ein Foto des Präparatetiketts, ein Übersichtsfoto, das oft ebenfalls das Etikett zeigt, einen Dateinamen, der die Fallnummer enthalten kann, und Metadaten wie Barcodes, Datumsangaben und Scannerdetails. Bevor Sie ein Präparat weitergeben, entfernen Sie all das, ohne die Pixel anzutasten, die Sie teilen möchten. Hier steht, was zu entfernen ist und welche Tools das erledigen.

SlideScope herunterladenTools im Vergleich
Etikett, Übersicht, Dateiname, MetadatenPixel unverändertErledigt auf Ihrem Computer

Was eine Präparatdatei identifizierbar macht

  • Das Etikettbild: Scanner speichern ein Foto des Präparatetiketts, oft mit Name, Fallnummer oder Barcode.
  • Das Übersichtsfoto (Makrobild): ein Bild des ganzen Glasobjektträgers, das meist auch das Etikett zeigt. Bei manchen NDPI- und Ventana-Dateien sind Etikett und Übersicht ein einziges Bild.
  • Der Dateiname: oft die Fall- oder Eingangsnummer.
  • Metadaten: dekodierte Barcodes, vom Scanner gelesener Etikettentext, Aufnahmedatum und -uhrzeit, die Seriennummer des Scanners und Benutzernamen des Betriebssystems.
  • Das Bild selbst: Ein Etikett oder eine Handschrift innerhalb des gescannten Bereichs ist Teil der Pixel, und kein Tool entfernt sie, ohne das Bild zu bearbeiten.

Quelle: die wsi-anon-Publikation (PMC10185865); OpenSlide: zugehörige Bilder und Eigenschaften.

Tools zur De-Identifizierung von Präparaten

WerkzeugKostenFormatsWas sie leistet
SlideScope “Save a Safe Copy”Kostenpflichtig; erfordert ein AbonnementSVS, NDPI, BIF, QPTIFF, AVS, OME-TIFF und gekacheltes TIFF, CZI, DICOM als EinzeldateiEntfernt Etikett- und Übersichtsfotos sowie identifizierende Felder, lässt den Dateinamen weg, lässt die Pixel Byte für Byte unverändert und prüft dann die Kopie; lehnt MRXS, SCN, VMS/VMU und VSI ab
svs-deidentifierKostenlos (MIT)Aperio SVSEntfernt die Etikett- und Makrobilder; Kopier- oder Änderungsmodus; Desktop-App für Windows, Mac und Linux
wsi-anon (EMPAIA)Kostenlos (MIT)MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIFC-Bibliothek mit Python- und JavaScript-Bindings; für Pipelines
anonymize-slideKostenlos (GPL-2)SVS (nur Etikett), NDPI (Makrobild), MRXS (Barcode)Bearbeitet die Datei direkt; Python 2; zuletzt 2015 geändert
DICOM-Profil zur De-IdentifizierungStandardDICOM WSIBasic Profile plus die Option Clean Pixel Data für eingebrannten Text

Tools, die das Original direkt bearbeiten, lassen Ihnen keine unberührte Kopie, falls etwas schiefgeht: Arbeiten Sie mit einer Kopie und bewahren Sie das Original unter seinen Zugriffskontrollen auf.

So speichern Sie in SlideScope eine de-identifizierte Kopie

  1. Öffnen Sie das Präparat in SlideScope unter Windows oder auf dem Mac.
  2. Wählen Sie File › Save a Safe Copy… und einen Speicherort.
  3. SlideScope schreibt eine Kopie ohne die Etikett- und Übersichtsfotos und ohne die in der Datei gespeicherten identifizierenden Felder, unter einem neuen Namen, wobei die Bilddaten Byte für Byte so bleiben, wie sie waren. Anschließend prüft es die Kopie unabhängig; schlägt die Prüfung fehl, wird die Kopie gelöscht und nichts als sicher bezeichnet.
  4. Prüfen Sie die Kopie auf alles innerhalb des gescannten Bereichs, etwa Handschrift auf dem Glas, die kein Tool erkennen kann.

File › Remove Identifying Details from Exports hält außerdem den ursprünglichen Dateinamen aus exportierten Bildern heraus, und Freigabelinks können dieselbe bereinigte Kopie verwenden. Sichere Kopien sind im Abonnement enthalten.

Checkliste, bevor Sie ein Präparat weitergeben

  1. Arbeiten Sie mit einer Kopie, nie mit dem Original.
  2. Entfernen Sie das Etikettbild und das Übersichtsfoto.
  3. Entfernen Sie identifizierende Metadaten: Barcode, Etikettentext, Datumsangaben, Scanner- und Benutzerdaten.
  4. Benennen Sie die Datei um, sodass sie keine Fallnummer trägt.
  5. Prüfen Sie den gescannten Bereich selbst auf Beschriftungen.
  6. Klären Sie, was Ihre Einrichtung und Ihr Ethikvotum Ihnen zu teilen erlauben.

Fragen zur De-Identifizierung

Macht das Entfernen des Etikettbildes ein Präparat anonym?

Nicht für sich allein. Das Übersichtsfoto (Makrobild) zeigt oft ebenfalls das Etikett, der Dateiname kann die Fallnummer tragen, und die Metadaten der Datei können Barcode, Etikettentext, Datumsangaben, die Seriennummer des Scanners und Benutzernamen enthalten. Beschriftungen innerhalb des gescannten Bereichs sind Teil des Bildes und bleiben erhalten.

Kann ich das Etikett aus einem MRXS- oder VSI-Präparat entfernen?

Einige Tools können mit MRXS umgehen (wsi-anon entfernt die Barcode-Ebene des Präparats), aber diese aus mehreren Dateien bestehenden Formate lassen sich schwerer sicher bereinigen. SlideScope weigert sich, eine Kopie von MRXS, SCN, VMS/VMU oder VSI als sicher zu bezeichnen, statt zu raten.

Verändert die De-Identifizierung die Bildpixel?

Das sollte sie nicht. Die sichere Kopie von SlideScope lässt die Bilddaten Byte für Byte so, wie sie waren (nichts wird neu kodiert), sodass Annotationen und Messungen weiterhin passen, und sie prüft die Kopie, bevor sie sie als sicher bezeichnet.

Reicht die De-Identifizierung, um Patientenpräparate zu teilen?

Sie ist ein Schritt. Was Sie mit wem teilen dürfen, legen Ihre Einrichtung, Ihr Ethikvotum und die Datenschutzvorschriften fest; klären Sie das mit den Zuständigen. Diese Seite bietet praktische Hinweise, keine Rechtsberatung.

Ist SlideScope kostenlos?

SlideScope ist eine kostenpflichtige App mit kostenloser Beispielbibliothek (alle Werkzeuge); für Ihre eigenen Bilder benötigen Sie ein Abonnement ab $35/Monat.

Erkunden Sie die mitgelieferte Beispielbibliothek kostenlos und mit allen Werkzeugen. Zum Öffnen Ihrer eigenen Bilder benötigen Sie ein Abonnement: $35/Monat, abgerechnet bei Abschluss (PayPal oder Karte) und jederzeit in Ihrem Konto kündbar. Bei jährlicher Abrechnung kostet es $349.99/Jahr, das entspricht etwa zwei Gratismonaten.

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