Знеособлення

Як видалити етикетки й дані пацієнтів із зображень слайдів

Повнослайдове зображення містить більше, ніж тканину: фото етикетки слайда, оглядове фото, на якому часто теж видно етикетку, назву файлу, яка може містити номер випадку, і метадані, як-от штрихкоди, дати й відомості про сканер. Перш ніж ділитися слайдом, видаліть усе це, не торкаючись пікселів, якими ви хочете поділитися. Ось що потрібно видалити й які інструменти це роблять.

Завантажити SlideScopeПорівняти інструменти
Етикетка, огляд, назва файлу, метаданіПікселі без змінВиконується на вашому комп’ютері

Що дає змогу ідентифікувати файл слайда

  • Зображення етикетки: сканери зберігають фото етикетки слайда, часто з ім’ям, номером випадку чи штрихкодом.
  • Оглядове (макро) фото: знімок усього скляного слайда, на якому зазвичай також видно етикетку. У деяких файлах NDPI і Ventana етикетка й огляд — одне зображення.
  • Назва файлу: часто це номер випадку або реєстраційний номер.
  • Метадані: декодовані штрихкоди, текст етикетки, розпізнаний сканером, дати й час отримання, серійний номер сканера та імена користувачів операційної системи.
  • Саме зображення: етикетка чи рукописний текст, що потрапили в скановану ділянку, є частиною пікселів, і жоден інструмент не видалить їх без редагування зображення.

Джерело: стаття про wsi-anon (PMC10185865); пов’язані зображення й властивості в OpenSlide.

Інструменти для знеособлення слайдів

ІнструментВартістьFormatsЩо робить
SlideScope “Save a Safe Copy”Платний; потрібна передплатаSVS, NDPI, BIF, QPTIFF, AVS, OME-TIFF і тайловий TIFF, CZI, однофайловий DICOMВидаляє фото етикетки й огляду та ідентифікувальні поля, відкидає назву файлу, залишає пікселі байт у байт, потім перевіряє копію; відмовляється працювати з MRXS, SCN, VMS/VMU, VSI
svs-deidentifierБезкоштовно (MIT)Aperio SVSВидаляє зображення етикетки й макро; режим копіювання або змінення; настільна програма для Windows, Mac і Linux
wsi-anon (EMPAIA)Безкоштовно (MIT)MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIFБібліотека C з прив’язками для Python і JavaScript; для конвеєрів
anonymize-slideБезкоштовно (GPL-2)SVS (лише етикетка), NDPI (макро), MRXS (штрихкод)Редагує файл на місці; Python 2; востаннє змінювався у 2015 р.
Профіль знеособлення DICOMСтандартDICOM WSIBasic Profile плюс опція Clean Pixel Data для вбудованого в зображення тексту

Інструменти, що редагують оригінал на місці, не залишають вам незміненої копії, якщо щось піде не так: працюйте з копією, а оригінал зберігайте під його засобами контролю доступу.

Як зберегти знеособлену копію в SlideScope

  1. Відкрийте слайд у SlideScope у Windows або на Mac.
  2. Виберіть File › Save a Safe Copy… і вкажіть, куди зберегти.
  3. SlideScope записує копію без фото етикетки слайда й огляду та без ідентифікувальних полів, що зберігаються у файлі, під новою назвою, залишаючи дані зображення байт у байт такими, як були. Потім він незалежно перевіряє копію; якщо перевірка не вдається, копію видаляють, і нічого не позначається як безпечне.
  4. Перегляньте копію на наявність будь-чого всередині сканованої ділянки, як-от рукописного тексту на склі, якого не бачить жоден інструмент.

File › Remove Identifying Details from Exports також не допускає оригінальну назву файлу в експортовані зображення, а посилання для спільного доступу можуть використовувати ту саму очищену копію. Безпечні копії доступні з передплатою.

Контрольний список перед тим, як ділитися слайдом

  1. Працюйте з копією, ніколи з оригіналом.
  2. Видаліть зображення етикетки й оглядове фото.
  3. Видаліть ідентифікувальні метадані: штрихкод, текст етикетки, дати, відомості про сканер і користувача.
  4. Перейменуйте файл, щоб у назві не було номера випадку.
  5. Перевірте саму скановану ділянку на наявність написів.
  6. Уточніть, чим вам дозволяють ділитися ваша установа й етичне схвалення.

Запитання про знеособлення

Чи робить видалення зображення етикетки слайд анонімним?

Саме по собі — ні. На оглядовому (макро) фото часто теж видно етикетку, назва файлу може містити номер випадку, а метадані файлу можуть містити штрихкод, текст етикетки, дати, серійний номер сканера й імена користувачів. Написи, що потрапили в скановану ділянку, є частиною зображення й залишаються.

Чи можна видалити етикетку зі слайда MRXS або VSI?

Деякі інструменти працюють з MRXS (wsi-anon видаляє рівень зі штрихкодом слайда), але ці багатофайлові формати складніше безпечно очистити. SlideScope відмовляється позначати копію MRXS, SCN, VMS/VMU чи VSI як безпечну, замість того щоб гадати.

Чи змінює знеособлення пікселі зображення?

Не повинно. Безпечна копія SlideScope залишає дані зображення байт у байт такими, як були (нічого не перекодовується), тож анотації й вимірювання й далі збігаються, а перш ніж позначити копію як безпечну, програма її перевіряє.

Чи достатньо знеособлення, щоб ділитися слайдами пацієнтів?

Це лише один крок. Чим і з ким ви можете ділитися, визначають ваша установа, етичне схвалення й правила захисту даних; уточніть у них. Ця сторінка — практичні рекомендації, а не юридична консультація.

Чи SlideScope безкоштовний?

SlideScope — платна програма з безкоштовною бібліотекою зразків (усі інструменти); для ваших власних зображень потрібна передплата від $35/місяць.

Досліджуйте вбудовану бібліотеку зразків безкоштовно, з усіма інструментами. Щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата: $35/місяць, оплата під час оформлення передплати (PayPal або картка), скасувати можна будь-коли у своєму обліковому записі. Доступна річна оплата — $349.99/рік, що виходить приблизно як два місяці безкоштовно.

Діліться слайдами без етикетки

Спробуйте безкоштовно на вбудованих зразках, а потім зберігайте безпечні копії власних слайдів за передплатою. Уже вирішили? Оформити передплату зараз.

Завантажити SlideScope