切片文件中哪些内容可识别身份
- 标签图像:扫描仪会保存一张切片标签的照片,上面往往有姓名、病例号或条形码。
- 概览(宏观)照片:整张玻片的照片,通常也会拍到标签。在某些 NDPI 和 Ventana 文件中,标签和概览是同一幅图像。
- 文件名:往往就是病例号或登记号。
- 元数据:解码后的条形码、扫描仪读取的标签文字、采集日期和时间、扫描仪序列号以及操作系统用户名。
- 图像本身:落在扫描区域内的标签或手写字迹属于像素的一部分,任何工具都无法在不编辑图像的情况下将其移除。
全切片图像包含的不只是组织:还有切片标签的照片、往往也拍到标签的概览照片、可能含有病例号的文件名,以及条形码、日期和扫描仪信息等元数据。在分享切片之前,请将它们全部移除,同时不改动您想分享的像素。下面介绍需要移除哪些内容,以及能完成这项工作的工具。
| 工具 | 费用 | Formats | 作用 |
|---|---|---|---|
| SlideScope “Save a Safe Copy” | 付费;需要订阅 | SVS、NDPI、BIF、QPTIFF、AVS、OME-TIFF 和分块 TIFF、CZI、单文件 DICOM | 移除标签和概览照片以及身份识别字段,去掉文件名,像素逐字节保持不变,然后检查副本;拒绝处理 MRXS、SCN、VMS/VMU、VSI |
| svs-deidentifier | 免费(MIT) | Aperio SVS | 去除标签图和宏观图;支持复制或修改模式;提供 Windows、Mac 和 Linux 桌面应用 |
| wsi-anon(EMPAIA) | 免费(MIT) | MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIF | C 语言库,带 Python 和 JavaScript 绑定;适用于处理流程 |
| anonymize-slide | 免费(GPL-2) | SVS(仅标签)、NDPI(宏观图)、MRXS(条形码) | 直接修改原文件;Python 2;最后更新于 2015 年 |
| DICOM 去标识化配置文件 | 标准 | DICOM WSI | Basic Profile 加上用于处理烧录文字的 Clean Pixel Data 选项 |
直接修改原文件的工具一旦出错,您就没有未改动的副本可用:请在副本上操作,并将原文件保存在其访问控制之下。
File › Remove Identifying Details from Exports 还能让导出的图像不带原始文件名,分享链接也可以使用同一个干净的副本。安全副本功能包含在订阅中。
仅此一项还不够。概览(宏观)照片往往也会拍到标签,文件名可能含有病例号,文件的元数据中也可能包含条形码、标签文字、日期、扫描仪序列号和用户名。落在扫描区域内的字迹属于图像的一部分,会保留下来。
有些工具可以处理 MRXS(wsi-anon 会移除切片条形码层级),但这类多文件格式更难安全地清理。SlideScope 不会靠猜测行事,而是拒绝将 MRXS、SCN、VMS/VMU 或 VSI 的副本标为安全。
不应该改变。SlideScope 的安全副本让图像数据逐字节保持原样(不重新编码),因此标注和测量仍能对齐;在将副本标为安全之前,它还会对副本进行验证。
它只是其中一步。您可以分享哪些内容、与谁分享,由您所在机构、伦理审批和数据保护规定决定;请向他们确认。本页面是实用指导,不构成法律建议。
SlideScope 是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具);打开您自己的图像需要订阅,$35/月起。
免费探索内置示例库,可使用所有工具。打开您自己的图像需要订阅:$35/月,订阅时扣费(PayPal 或银行卡),可随时在账户中取消。也可选择按年付费,$349.99/年,相当于约免费两个月。
先在内置示例上免费试用,然后订阅即可为您自己的切片保存安全副本。已经决定了?立即订阅。