Khử định danh

Cách xóa nhãn và dữ liệu bệnh nhân khỏi ảnh tiêu bản

Một ảnh toàn tiêu bản chứa nhiều thứ hơn là mô: ảnh chụp nhãn tiêu bản, ảnh tổng quan thường cũng chụp cả nhãn, tên tệp có thể chứa số ca, và siêu dữ liệu như mã vạch, ngày tháng và thông tin máy quét. Trước khi chia sẻ một tiêu bản, hãy xóa tất cả những thứ đó mà không đụng đến các điểm ảnh bạn muốn chia sẻ. Dưới đây là những gì cần xóa và các công cụ làm việc đó.

Tải xuống SlideScopeSo sánh các công cụ
Nhãn, ảnh tổng quan, tên tệp, siêu dữ liệuĐiểm ảnh không thay đổiThực hiện trên máy tính của bạn

Những gì trong tệp tiêu bản có thể nhận diện

  • Ảnh nhãn: máy quét lưu ảnh chụp nhãn tiêu bản, thường có tên, số ca hoặc mã vạch.
  • Ảnh tổng quan (macro): ảnh chụp toàn bộ lam kính, thường cũng cho thấy cả nhãn. Ở một số tệp NDPI và Ventana, nhãn và ảnh tổng quan là cùng một ảnh.
  • Tên tệp: thường là số ca hoặc số tiếp nhận mẫu.
  • Siêu dữ liệu: mã vạch đã giải mã, văn bản nhãn do máy quét đọc, ngày giờ thu nhận, số sê-ri máy quét và tên người dùng hệ điều hành.
  • Bản thân ảnh: nhãn hoặc chữ viết tay lọt vào vùng quét là một phần của điểm ảnh, và không công cụ nào xóa được nó mà không chỉnh sửa ảnh.

Nguồn: bài báo về wsi-anon (PMC10185865); ảnh liên kết và thuộc tính trong OpenSlide.

Các công cụ khử định danh tiêu bản

Công cụChi phíFormatsChức năng
SlideScope “Save a Safe Copy”Trả phí; cần gói thuê baoSVS, NDPI, BIF, QPTIFF, AVS, OME-TIFF và TIFF dạng ô, CZI, DICOM một tệpXóa ảnh nhãn, ảnh tổng quan và các trường nhận diện, bỏ tên tệp, giữ nguyên điểm ảnh đến từng byte, rồi kiểm tra bản sao; từ chối MRXS, SCN, VMS/VMU, VSI
svs-deidentifierMiễn phí (MIT)Aperio SVSGỡ bỏ ảnh nhãn và ảnh macro; chế độ sao chép hoặc sửa trực tiếp; ứng dụng máy tính cho Windows, Mac và Linux
wsi-anon (EMPAIA)Miễn phí (MIT)MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIFThư viện C có binding cho Python và JavaScript; dành cho các pipeline xử lý
anonymize-slideMiễn phí (GPL-2)SVS (chỉ nhãn), NDPI (ảnh macro), MRXS (mã vạch)Sửa trực tiếp trên tệp; Python 2; thay đổi lần cuối năm 2015
Hồ sơ khử định danh DICOMTiêu chuẩnDICOM WSIBasic Profile cùng tùy chọn Clean Pixel Data cho chữ in cứng vào ảnh

Các công cụ sửa trực tiếp trên tệp gốc không để lại cho bạn bản sao nguyên vẹn nào nếu có sự cố: hãy làm việc trên một bản sao, và giữ bản gốc trong vùng có kiểm soát truy cập.

Cách lưu bản sao đã khử định danh trong SlideScope

  1. Mở tiêu bản trong SlideScope trên Windows hoặc Mac.
  2. Chọn File › Save a Safe Copy… và chọn nơi lưu.
  3. SlideScope ghi một bản sao không có ảnh nhãn tiêu bản, ảnh tổng quan và các trường nhận diện lưu trong tệp, dưới một tên mới, với dữ liệu ảnh giữ nguyên đến từng byte. Sau đó ứng dụng kiểm tra bản sao một cách độc lập; nếu kiểm tra thất bại, bản sao bị xóa và không có gì được coi là an toàn.
  4. Xem lại bản sao để tìm bất cứ thứ gì nằm trong vùng quét, chẳng hạn chữ viết tay trên lam kính, thứ mà không công cụ nào nhìn thấy được.

File › Remove Identifying Details from Exports cũng loại tên tệp gốc khỏi các ảnh xuất ra, và liên kết chia sẻ có thể dùng chính bản sao sạch đó. Bản sao an toàn đi kèm gói thuê bao.

Danh sách kiểm tra trước khi chia sẻ tiêu bản

  1. Làm việc trên bản sao, không bao giờ trên bản gốc.
  2. Xóa ảnh nhãn và ảnh tổng quan.
  3. Xóa siêu dữ liệu nhận diện: mã vạch, văn bản nhãn, ngày tháng, thông tin máy quét và người dùng.
  4. Đổi tên tệp để tên không chứa số ca.
  5. Kiểm tra chính vùng quét xem có chữ viết không.
  6. Xác nhận những gì cơ sở của bạn và phê duyệt đạo đức cho phép bạn chia sẻ.

Câu hỏi về khử định danh

Xóa ảnh nhãn có làm tiêu bản trở nên ẩn danh không?

Chỉ riêng việc đó thì không. Ảnh tổng quan (macro) thường cũng cho thấy nhãn, tên tệp có thể chứa số ca, và siêu dữ liệu của tệp có thể chứa mã vạch, văn bản nhãn, ngày tháng, số sê-ri máy quét và tên người dùng. Chữ viết lọt vào vùng quét là một phần của ảnh và vẫn còn đó.

Tôi có xóa được nhãn khỏi tiêu bản MRXS hoặc VSI không?

Một số công cụ xử lý được MRXS (wsi-anon xóa mức mã vạch của tiêu bản), nhưng các định dạng nhiều tệp này khó làm sạch an toàn hơn. SlideScope từ chối coi một bản sao MRXS, SCN, VMS/VMU hoặc VSI là an toàn thay vì phỏng đoán.

Khử định danh có làm thay đổi điểm ảnh không?

Không nên như vậy. Bản sao an toàn của SlideScope giữ dữ liệu ảnh nguyên vẹn đến từng byte (không mã hóa lại gì cả), nên chú thích và phép đo vẫn khớp đúng vị trí, và ứng dụng xác minh bản sao trước khi coi nó là an toàn.

Khử định danh có đủ để chia sẻ tiêu bản của bệnh nhân không?

Đó là một bước. Bạn được chia sẻ những gì, và với ai, là do cơ sở của bạn, phê duyệt đạo đức và các quy định bảo vệ dữ liệu quyết định; hãy hỏi lại họ. Trang này là hướng dẫn thực hành, không phải tư vấn pháp lý.

SlideScope có miễn phí không?

SlideScope là ứng dụng trả phí có thư viện mẫu miễn phí (với mọi công cụ); ảnh của riêng bạn cần gói thuê bao từ $35/tháng.

Khám phá miễn phí thư viện mẫu tích hợp với mọi công cụ. Để mở ảnh của riêng bạn, bạn cần một gói thuê bao: $35/tháng, thanh toán khi đăng ký (PayPal hoặc thẻ), và bạn có thể hủy bất cứ lúc nào trong tài khoản. Có gói thanh toán theo năm với giá $349.99/năm, tương đương được miễn phí khoảng hai tháng.

Chia sẻ tiêu bản không kèm nhãn

Dùng thử miễn phí trên các mẫu tích hợp sẵn, sau đó lưu bản sao an toàn cho tiêu bản của riêng bạn với gói thuê bao. Đã quyết định? Đăng ký ngay.

Tải xuống SlideScope