Desidentificación

Cómo eliminar etiquetas y datos de pacientes de las imágenes de portaobjetos

Una imagen de portaobjetos completo contiene algo más que el tejido: una foto de la etiqueta del portaobjetos, una foto de vista general que a menudo también muestra la etiqueta, un nombre de archivo que puede incluir el número de caso y metadatos como códigos de barras, fechas y datos del escáner. Antes de compartir un portaobjetos, elimínalos todos sin tocar los píxeles que quieres compartir. Esto es lo que hay que eliminar y las herramientas que lo hacen.

Etiqueta, vista general, nombre de archivo, metadatosPíxeles sin cambiosTodo en tu ordenador

Qué identifica un archivo de portaobjetos

  • La imagen de la etiqueta: los escáneres guardan una foto de la etiqueta del portaobjetos, a menudo con un nombre, un número de caso o un código de barras.
  • La foto de vista general (macro): una imagen de todo el portaobjetos de vidrio, que normalmente también muestra la etiqueta. En algunos archivos NDPI y Ventana, la etiqueta y la vista general son una sola imagen.
  • El nombre de archivo: a menudo es el número de caso o de registro.
  • Metadatos: códigos de barras decodificados, texto de la etiqueta leído por el escáner, fechas y horas de adquisición, el número de serie del escáner y nombres de usuario del sistema operativo.
  • La propia imagen: una etiqueta o un texto manuscrito que quede dentro del área escaneada forma parte de los píxeles, y ninguna herramienta lo elimina sin editar la imagen.

Fuente: el artículo de wsi-anon (PMC10185865); imágenes asociadas y propiedades de OpenSlide.

Herramientas que desidentifican portaobjetos

HerramientaCosteFormatsQué hace
SlideScope “Save a Safe Copy”De pago; requiere una suscripciónSVS, NDPI, BIF, QPTIFF, AVS, OME-TIFF y TIFF en teselas, CZI, DICOM de un solo archivoElimina las fotos de la etiqueta y de vista general y los campos identificativos, descarta el nombre de archivo, deja los píxeles idénticos byte a byte y después comprueba la copia; rechaza MRXS, SCN, VMS/VMU y VSI
svs-deidentifierGratuito (MIT)Aperio SVSElimina las imágenes de etiqueta y macro; modo de copia o de modificación; aplicación de escritorio para Windows, Mac y Linux
wsi-anon (EMPAIA)Gratuito (MIT)MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIFBiblioteca en C con enlaces para Python y JavaScript; para flujos de procesamiento
anonymize-slideGratuito (GPL-2)SVS (solo la etiqueta), NDPI (macro), MRXS (código de barras)Modifica el archivo original; Python 2; última modificación en 2015
Perfil de desidentificación DICOMEstándarDICOM WSIPerfil básico más la opción Clean Pixel Data para el texto incrustado en la imagen

Las herramientas que modifican el original no te dejan ninguna copia intacta si algo sale mal: trabaja sobre una copia y guarda el original bajo sus controles de acceso.

Cómo guardar una copia desidentificada en SlideScope

  1. Abre el portaobjetos en SlideScope en Windows o Mac.
  2. Elige File › Save a Safe Copy… y selecciona dónde guardarla.
  3. SlideScope escribe una copia sin las fotos de la etiqueta y de vista general ni los campos identificativos guardados en el archivo, con un nombre nuevo y con los datos de imagen idénticos byte a byte. Después comprueba la copia de forma independiente; si la comprobación falla, la copia se elimina y nada se da por seguro.
  4. Revisa la copia en busca de cualquier cosa dentro del área escaneada, como texto manuscrito en el vidrio, que ninguna herramienta puede detectar.

File › Remove Identifying Details from Exports también evita que el nombre de archivo original aparezca en las imágenes exportadas, y los enlaces para compartir pueden usar la misma copia limpia. Las copias seguras se incluyen con una suscripción.

Lista de comprobación antes de compartir un portaobjetos

  1. Trabaja sobre una copia, nunca sobre el original.
  2. Elimina la imagen de la etiqueta y la foto de vista general.
  3. Elimina los metadatos identificativos: código de barras, texto de la etiqueta, fechas, datos del escáner y del usuario.
  4. Cambia el nombre del archivo para que no incluya un número de caso.
  5. Revisa si hay texto escrito en la propia área escaneada.
  6. Confirma qué te permiten compartir tu institución y la aprobación del comité de ética.

Preguntas sobre la desidentificación

¿Eliminar la imagen de la etiqueta hace anónimo un portaobjetos?

No por sí solo. La foto de vista general (macro) a menudo también muestra la etiqueta, el nombre de archivo puede incluir el número de caso y los metadatos del archivo pueden contener un código de barras, el texto de la etiqueta, fechas, el número de serie del escáner y nombres de usuario. El texto que quede dentro del área escaneada forma parte de la imagen y permanece.

¿Puedo eliminar la etiqueta de un portaobjetos MRXS o VSI?

Algunas herramientas admiten MRXS (wsi-anon elimina el nivel del código de barras del portaobjetos), pero estos formatos de varios archivos son más difíciles de limpiar con seguridad. SlideScope se niega a declarar segura una copia MRXS, SCN, VMS/VMU o VSI en lugar de suponerlo.

¿La desidentificación cambia los píxeles de la imagen?

No debería. La copia segura de SlideScope deja los datos de imagen idénticos byte a byte (no se vuelve a codificar nada), de modo que las anotaciones y las mediciones siguen coincidiendo, y verifica la copia antes de declararla segura.

¿Basta con la desidentificación para compartir portaobjetos de pacientes?

Es un paso. Qué puedes compartir, y con quién, lo determinan tu institución, la aprobación del comité de ética y las normas de protección de datos; consúltalo con ellos. Esta página es una guía práctica, no asesoramiento jurídico.

¿SlideScope es gratuito?

SlideScope es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita (todas las herramientas); para tus propias imágenes necesitas una suscripción desde $35/mes.

Explora gratis la biblioteca de muestras integrada, con todas las herramientas. Para abrir tus propias imágenes necesitas una suscripción: $35/mes, que se cobra al suscribirte (PayPal o tarjeta), y puedes cancelar cuando quieras desde tu cuenta. También hay facturación anual por $349.99/año, lo que equivale a unos dos meses gratis.

Comparte portaobjetos sin la etiqueta

Pruébalo gratis con las muestras integradas y, con una suscripción, guarda copias seguras de tus propios portaobjetos. ¿Ya lo tienes claro? Suscribirse ahora.

Descargar SlideScope