Desidentificación

Cómo eliminar etiquetas y datos del paciente de las imágenes de láminas

Una imagen de lámina completa contiene más que el tejido: una foto de la etiqueta de la lámina, una foto de vista general que a menudo también muestra la etiqueta, un nombre de archivo que puede contener el número de caso, y metadatos como códigos de barras, fechas y detalles del escáner. Antes de compartir una lámina, elimina todo eso sin tocar los píxeles que quieres compartir. Aquí tienes qué eliminar y las herramientas que lo hacen.

Etiqueta, vista general, nombre de archivo, metadatosPíxeles sin cambiosSe hace en tu computadora

Qué identifica un archivo de lámina

  • La imagen de la etiqueta: los escáneres guardan una foto de la etiqueta de la lámina, a menudo con un nombre, un número de caso o un código de barras.
  • La foto de vista general (macro): una imagen de toda la lámina de vidrio, que normalmente también muestra la etiqueta. En algunos archivos NDPI y Ventana, la etiqueta y la vista general son una sola imagen.
  • El nombre del archivo: a menudo es el número de caso o de acceso.
  • Los metadatos: códigos de barras decodificados, texto de la etiqueta leído por el escáner, fechas y horas de adquisición, el número de serie del escáner y nombres de usuario del sistema operativo.
  • La imagen en sí: una etiqueta o escritura a mano que quede dentro del área escaneada forma parte de los píxeles, y ninguna herramienta la elimina sin editar la imagen.

Fuente: el artículo de wsi-anon (PMC10185865); imágenes asociadas y propiedades de OpenSlide.

Herramientas que desidentifican láminas

HerramientaCostoFormatsQué hace
SlideScope “Save a Safe Copy”De pago; requiere una suscripciónSVS, NDPI, BIF, QPTIFF, AVS, OME-TIFF y TIFF en teselas, CZI, DICOM de un solo archivoElimina las fotos de la etiqueta y de la vista general y los campos identificables, descarta el nombre del archivo, deja los píxeles idénticos byte a byte y luego comprueba la copia; rechaza MRXS, SCN, VMS/VMU y VSI
svs-deidentifierGratuito (MIT)Aperio SVSQuita las imágenes de la etiqueta y macro; modo de copia o de modificación; aplicación de escritorio para Windows, Mac y Linux
wsi-anon (EMPAIA)Gratuito (MIT)MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIFBiblioteca en C con enlaces para Python y JavaScript; para pipelines
anonymize-slideGratuito (GPL-2)SVS (solo la etiqueta), NDPI (macro), MRXS (código de barras)Edita el archivo original directamente; Python 2; último cambio en 2015
Perfil de desidentificación DICOMEstándarDICOM WSIPerfil básico más la opción Clean Pixel Data para el texto incrustado en la imagen

Las herramientas que editan el original directamente no te dejan ninguna copia intacta si algo sale mal: trabaja sobre una copia y mantén el original bajo sus controles de acceso.

Cómo guardar una copia desidentificada en SlideScope

  1. Abre la lámina en SlideScope en Windows o Mac.
  2. Elige File › Save a Safe Copy… y selecciona dónde guardarla.
  3. SlideScope escribe una copia sin las fotos de la etiqueta y de la vista general ni los campos identificables guardados en el archivo, con un nombre nuevo, y deja los datos de la imagen idénticos byte a byte. Luego comprueba la copia de forma independiente; si la comprobación falla, la copia se elimina y nada se declara seguro.
  4. Revisa la copia en busca de cualquier cosa dentro del área escaneada, como escritura a mano sobre el vidrio, que ninguna herramienta puede ver.

File › Remove Identifying Details from Exports también evita que el nombre original del archivo aparezca en las imágenes exportadas, y los enlaces para compartir pueden usar la misma copia limpia. Las copias seguras vienen con una suscripción.

Lista de verificación antes de compartir una lámina

  1. Trabaja sobre una copia, nunca sobre el original.
  2. Elimina la imagen de la etiqueta y la foto de vista general.
  3. Elimina los metadatos identificables: código de barras, texto de la etiqueta, fechas y datos del escáner y del usuario.
  4. Cambia el nombre del archivo para que no lleve un número de caso.
  5. Revisa el área escaneada en sí en busca de escritura.
  6. Confirma qué te permiten compartir tu institución y la aprobación del comité de ética.

Preguntas sobre la desidentificación

¿Eliminar la imagen de la etiqueta hace anónima una lámina?

No por sí solo. La foto de vista general (macro) a menudo también muestra la etiqueta, el nombre del archivo puede llevar el número de caso, y los metadatos del archivo pueden contener un código de barras, el texto de la etiqueta, fechas, el número de serie del escáner y nombres de usuario. La escritura que quede dentro del área escaneada forma parte de la imagen y permanece.

¿Puedo eliminar la etiqueta de una lámina MRXS o VSI?

Algunas herramientas manejan MRXS (wsi-anon elimina el nivel del código de barras de la lámina), pero estos formatos de varios archivos son más difíciles de limpiar con seguridad. SlideScope se niega a declarar segura una copia MRXS, SCN, VMS/VMU o VSI antes que adivinar.

¿La desidentificación cambia los píxeles de la imagen?

No debería. La copia segura de SlideScope deja los datos de la imagen idénticos byte a byte (no se vuelve a codificar nada), así que las anotaciones y las mediciones siguen coincidiendo, y verifica la copia antes de declararla segura.

¿Basta con la desidentificación para compartir láminas de pacientes?

Es un paso. Lo que puedes compartir, y con quién, lo determinan tu institución, la aprobación del comité de ética y las normas de protección de datos; consúltalo con ellos. Esta página es una guía práctica, no asesoría legal.

¿SlideScope es gratuito?

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