切片檔案中哪些內容可識別身分
- 標籤影像:掃描器會儲存玻片標籤的照片,上面常有姓名、病例編號或條碼。
- 概覽(巨觀)照片:整片玻片的照片,通常也會拍到標籤。在部分 NDPI 與 Ventana 檔案中,標籤與概覽是同一張影像。
- 檔名:通常是病例編號或登錄號。
- 中繼資料:解碼後的條碼、掃描器讀取的標籤文字、擷取日期與時間、掃描器序號,以及作業系統使用者名稱。
- 影像本身:掃描區域內拍到的標籤或手寫字跡屬於像素的一部分,任何工具都無法在不編輯影像的情況下將其移除。
全玻片影像所包含的不只是組織:還有玻片標籤的照片、通常也會拍到標籤的概覽照片、可能含有病例編號的檔名,以及條碼、日期與掃描器詳細資料等中繼資料。分享切片前,請將這些全部移除,同時不更動您想分享的像素。以下說明需要移除的內容,以及能完成這項工作的工具。
| 工具 | 費用 | Formats | 用途 |
|---|---|---|---|
| SlideScope「Save a Safe Copy」 | 付費;需要訂閱 | SVS、NDPI、BIF、QPTIFF、AVS、OME-TIFF 與圖塊式 TIFF、CZI、單一檔案 DICOM | 移除標籤與概覽照片及可識別身分的欄位、捨棄原檔名、像素逐位元組保持不變,然後檢查副本;拒絕處理 MRXS、SCN、VMS/VMU、VSI |
| svs-deidentifier | 免費(MIT) | Aperio SVS | 移除標籤與巨觀影像;提供複製或修改模式;適用於 Windows、Mac 與 Linux 的桌面應用程式 |
| wsi-anon(EMPAIA) | 免費(MIT) | MRXS, NDPI, SVS/TIFF, iSyntax, BIF | C 函式庫,提供 Python 與 JavaScript 繫結;適用於處理流程 |
| anonymize-slide | 免費(GPL-2) | SVS(僅標籤)、NDPI(巨觀影像)、MRXS(條碼) | 直接修改原檔;Python 2;最後更新於 2015 年 |
| DICOM 去識別化設定檔 | 標準 | DICOM WSI | Basic Profile,加上處理燒入文字的 Clean Pixel Data 選項 |
直接修改原檔的工具,一旦出錯就不會留下未經更動的副本:請在副本上作業,並讓原始檔案維持在其存取控管之下。
File › Remove Identifying Details from Exports 也會讓匯出的影像不帶原始檔名,分享連結也可使用同一份乾淨的副本。安全副本功能需要訂閱。
單靠這一步並不夠。概覽(巨觀)照片通常也會拍到標籤,檔名可能含有病例編號,而檔案的中繼資料可能包含條碼、標籤文字、日期、掃描器序號與使用者名稱。掃描區域內拍到的字跡屬於影像的一部分,會被保留下來。
部分工具可處理 MRXS(wsi-anon 會移除玻片條碼層級),但這些多檔案格式較難安全地清理。SlideScope 不會用猜測的方式處理,而是拒絕將 MRXS、SCN、VMS/VMU 或 VSI 副本標示為安全。
不應該改變。SlideScope 的安全副本會讓影像資料逐位元組保持原樣(不會重新編碼),因此標註與量測仍能對齊,而且它會先驗證副本,才將其標示為安全。
這只是其中一個步驟。您可以分享哪些內容、可以與誰分享,取決於您的機構、倫理審查核准與資料保護規定;請向相關單位確認。本頁提供的是實務指引,而非法律建議。
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