Co otwiera
Przeciągnij, aby przesunąć widok, przewiń lub zsuń palce, aby powiększyć, kliknij dwukrotnie, aby przybliżyć; działają też klawisze + i −. Gdy plik zawiera rozmiar piksela, pasek skali dopasowuje się do powiększenia. Zapisz widok jako PNG zachowuje to, co widać na ekranie.
Dlaczego większość przeglądarek online pokazuje 16-bitowy TIFF jako czarny
Kamery mikroskopowe rejestrują 12, 14 lub 16 bitów na piksel, a ekran wyświetla 8. Przeglądarka, która przekłada 0–65 535 wprost na 0–255, ściska typowy obraz fluorescencyjny, którego sygnał mieści się między kilkuset a kilkoma tysiącami, w kilka najniższych poziomów szarości: wychodzi czerń. Ta przeglądarka ustawia zakres wyświetlania każdego kanału na podstawie 0,1 i 99,9 percentyla jego danych (ta sama idea co przycisk Auto w Fiji), a Ty możesz wpisać dokładne wartości minimum i maksimum albo przywrócić pełny zakres. Zmienia to tylko to, co widzisz, nigdy plik.
Czego nie otwiera
- SVS z JPEG 2000 (kompresja Aperio 33003/33005), JPEG XR i JPEG XL nie dają się zdekodować w przeglądarce internetowej bez WebAssembly, którego ta strona nie ładuje.
- Formaty nieoparte na TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR i DICOM wymagają czytnika desktopowego. NDPI przypomina TIFF, ale każdy poziom przechowuje jako jeden ogromny plik JPEG, zbyt duży dla karty przeglądarki.
- OME-TIFF z kilkoma seriami pokazuje pierwszą serię.
- Bez pomiarów, adnotacji i analizy: to tylko przeglądarka.
Do tych formatów, a także do mierzenia, adnotacji i liczenia komórek na własnych obrazach, SlideScope otwiera 34 formaty mikroskopów i skanerów preparatów na Windows i Macu. SlideScope, desktopowa aplikacja mikroskopowa tego samego zespołu, to płatna aplikacja z bezpłatną biblioteką przykładów (wszystkie narzędzia) i subskrypcją na własne obrazy. Bezpłatne alternatywy: Fiji (Bio-Formats) i QuPath.
Jak otwiera plik bez przesyłania go
Gdy wybierasz plik, przeglądarka internetowa przekazuje tej stronie uchwyt do niego na Twoim dysku. Strona odczytuje tylko potrzebne bajty: najpierw katalog TIFF, potem kafelki dla widocznej na ekranie części obrazu, i dekoduje je na stronie za pomocą otwartoźródłowego czytnika TIFF (geotiff). Nic nie jest wysyłane na serwer, więc nieopublikowane dane i preparaty z etykietami pacjentów zostają na Twoim komputerze, a wielogigabajtowe preparaty otwierają się w kilka sekund, bo nigdy nie są nigdzie kopiowane. Zamknij kartę, a plik zniknie ze strony.
Strona ładuje własne skrypty z slidescope.science oraz szanujący prywatność licznik odsłon witryny; żadne z nich nigdy nie widzi Twojego obrazu. Licencje open source: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Pytania
Jak obejrzeć plik TIFF online bez wysyłania go?
Otwórz go na tej stronie: przeglądarka odczytuje plik z Twojego dysku i rysuje go na stronie, a nic nie jest wysyłane na serwer. Większość innych przeglądarek TIFF online najpierw wysyła plik.
Dlaczego mój TIFF wygląda na czarny lub całkowicie biały?
Niemal zawsze jest to obraz 16-bitowy, którego wartości zajmują tylko niewielką część zakresu 0–65 535. Automatyczny kontrast rozciąga rzeczywisty zakres danych na ekran; aby obrazy były porównywalne, ustaw minimum i maksimum ręcznie.
Czy otwiera bardzo duże pliki TIFF?
Tak, jeśli plik jest kafelkowy i ma piramidę (obrazy całych preparatów, piramidalny OME-TIFF, BigTIFF): odczytywane są tylko kafelki widoczne na ekranie, więc preparaty o rozmiarze wielu gigabajtów otwierają się szybko. Duży obraz bez piramidy można oglądać, powiększając i przesuwając widok, ale nie da się go wyświetlić w całości.
Czy otwiera wielostronicowe pliki TIFF i stosy Z?
Tak. Strony, płaszczyzny Z i punkty czasowe mają suwaki; hiperstosy OME-TIFF i ImageJ są odczytywane jako kanały, Z i czas.
Czy działa na Macu lub iPhonie?
Działa w każdej aktualnej przeglądarce, w tym w Safari na macOS i iOS. Safari samo wyświetla proste pliki TIFF, ale nie 16-bitowe, wielokanałowe ani piramidalne.
Czy ta przeglądarka TIFF jest bezpłatna?
Tak, jest bezpłatne i nie wymaga konta. SlideScope, desktopowa aplikacja mikroskopowa tego samego zespołu, to płatna aplikacja z bezpłatną biblioteką przykładów (wszystkie narzędzia) i subskrypcją na własne obrazy.
Potrzebujesz więcej, niż potrafi przeglądarka internetowa?
SlideScope otwiera 34 formaty mikroskopów i skanerów preparatów na Windows i Macu, w tym CZI, ND2, LIF, MRXS i SVS z JPEG 2000, z pomiarami, adnotacjami, liczeniem komórek i eksportem do OME-TIFF w pełnej rozdzielczości. Wypróbuj wszystkie narzędzia bezpłatnie na wbudowanych przykładach; do otwierania własnych obrazów potrzebna jest subskrypcja. Już zdecydowane? Subskrybuj teraz.