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面向显微镜图像的在线 TIFF 查看器

从电脑中打开 TIFF 并正确显示:可调节对比度的 16 位和 32 位图像、多通道合成、Z 堆栈、时间序列和多页,以及可缩放浏览的十亿像素级金字塔 TIFF 和 SVS 切片。文件由您的浏览器读取,从不上传。

在线 TIFF 查看器

将 TIFF、OME-TIFF 或 SVS 文件拖放到此处

由您电脑上的浏览器读取。不上传任何内容。

可打开的内容

可打开详情
TIFF 和 BigTIFF8 位、16 位和 32 位整数及浮点,灰度、RGB 和调色板;条带或分块;多页
OME-TIFF来自 OME-XML 的通道、Z 轴和时间,通道名称和颜色、像素尺寸,以及 SubIFD 金字塔
ImageJ / Fiji TIFF超堆栈(通道、切片、帧)及 ImageJ 校准
Aperio SVSJPEG 压缩的切片,包括其金字塔、缩略图、标签图和宏观图,以及 MPP
金字塔 TIFF通用分块金字塔(例如由 vips 或 bfconvert 生成)
压缩无压缩、LZW、Deflate(Zip)、PackBits、JPEG、WebP

拖动可平移,滚动或双指捏合可缩放,双击可放大;也可使用 + 和 − 键。如果文件中包含像素尺寸,比例尺会随缩放变化。点击“将视图保存为 PNG”可保存屏幕上显示的内容。

为什么大多数在线查看器会把 16 位 TIFF 显示成全黑

显微镜相机每个像素记录 12、14 或 16 位,而屏幕只能显示 8 位。如果查看器把 0–65,535 直接映射到 0–255,一幅典型的荧光图像(信号通常位于几百到几千之间)就会被压缩到最底部的几个灰阶:一片漆黑。本查看器根据每个通道数据的第 0.1 和第 99.9 百分位数设置其显示范围(与 Fiji 的 Auto 按钮原理相同),您也可以输入精确的最小值和最大值,或重置为完整范围。这只会改变您看到的内容,绝不会改动文件。

无法打开的格式

  • JPEG 2000 SVS(Aperio 压缩 33003/33005)、JPEG XR 和 JPEG XL 在浏览器中需要 WebAssembly 才能解码,而本页面不加载 WebAssembly。
  • 非 TIFF 格式:CZI、ND2、LIF、MRXS、VSI、IMS、OIB/OIR 和 DICOM 需要桌面读取程序。NDPI 类似 TIFF,但每个层级都存储为一个巨大的 JPEG,对浏览器标签页来说过大。
  • 包含多个序列的 OME-TIFF 只显示第一个序列。
  • 不提供测量、标注或分析:它只是一个查看器。

对于这些格式,以及要在您自己的图像上测量、标注和计数细胞,SlideScope 可在 Windows 和 Mac 上打开 34 种显微镜和切片扫描仪格式。SlideScope 是同一团队开发的桌面显微镜应用,它是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具),打开您自己的图像需要订阅。免费替代方案:Fiji(Bio-Formats)和 QuPath。

它如何在不上传的情况下打开文件

当您选择文件时,浏览器会把磁盘上该文件的句柄交给本页面。页面只读取所需的字节:先读取 TIFF 目录,再读取屏幕上显示区域的图块,并在页面中用开源 TIFF 读取器(geotiff)解码。任何内容都不会发送到服务器,因此未发表的数据和带有患者标签的切片都留在您的电脑上;数 GB 的切片也能在几秒内打开,因为它们从不会被复制到任何地方。关闭标签页后,文件即从页面中消失。

页面从 slidescope.science 加载自身的脚本,以及本站注重隐私的页面浏览计数器;两者都不会接触您的图像。开源许可证:image-tools-vendor.LICENSE.txt。

常见问题

如何在不上传的情况下在线查看 TIFF 文件?

在本页面中打开即可:浏览器从您的磁盘读取文件并在页面中绘制,不会向服务器发送任何内容。其他大多数在线 TIFF 查看器都需要先上传文件。

为什么我的 TIFF 看起来全黑或全白?

这几乎总是因为它是一幅 16 位图像,而其数值只占用了 0–65,535 范围中的一小部分。自动对比度会把数据的实际范围拉伸到屏幕上;如需让多幅图像可以相互比较,请手动设置最小值和最大值。

它能打开非常大的 TIFF 文件吗?

可以,前提是文件经过分块并带有金字塔(全切片图像、金字塔 OME-TIFF、BigTIFF):只读取屏幕上显示的图块,因此数 GB 的切片也能快速打开。没有金字塔的大图像可以通过缩放和平移浏览,但无法完整显示。

它能打开多页 TIFF 和 Z 堆栈吗?

可以。页面、Z 平面和时间点都有对应的滑块;OME-TIFF 和 ImageJ 超堆栈会按通道、Z 和时间读取。

它能在 Mac 或 iPhone 上使用吗?

它可在任何最新版浏览器中运行,包括 macOS 和 iOS 上的 Safari。Safari 本身可以显示简单的 TIFF,但无法显示 16 位、多通道或金字塔 TIFF。

这个 TIFF 查看器免费吗?

是的,它免费且无需账户。SlideScope 是同一团队开发的桌面显微镜应用,它是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具),打开您自己的图像需要订阅。

需要浏览器做不到的功能?

SlideScope 可在 Windows 和 Mac 上打开 34 种显微镜和切片扫描仪格式,包括 CZI、ND2、LIF、MRXS 和 JPEG 2000 SVS,并提供测量、标注、细胞计数和全分辨率 OME-TIFF 导出。可在内置示例上免费试用所有工具;打开您自己的图像需要订阅。已经决定了?立即订阅。

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