Що він відкриває
Перетягуйте, щоб панорамувати, прокручуйте коліщатко або зводьте пальці, щоб масштабувати, двічі клацніть, щоб наблизити; клавіші + і − теж працюють. Якщо у файлі є розмір пікселя, масштабна лінійка змінюється разом із масштабом. Кнопка «Зберегти вигляд як PNG» зберігає те, що на екрані.
Чому більшість онлайн-переглядачів показують 16-бітний TIFF чорним
Камери мікроскопів записують 12, 14 або 16 біт на піксель, а екран показує 8. Переглядач, який напряму відображає 0–65,535 на 0–255, стискає типове флуоресцентне зображення, сигнал якого лежить між кількома сотнями й кількома тисячами, у кілька найнижчих рівнів сірого: виходить чорний. Цей переглядач задає діапазон відображення кожного каналу за 0.1-м і 99.9-м перцентилями його даних (та сама ідея, що й у кнопки Auto у Fiji), а ви можете ввести точні мінімальне й максимальне значення або повернути повний діапазон. Це змінює лише те, що ви бачите, але ніколи не файл.
Що він не відкриває
- SVS у JPEG 2000 (стиснення Aperio 33003/33005), JPEG XR і JPEG XL неможливо декодувати в браузері без WebAssembly, який ця сторінка не завантажує.
- Не на основі TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR і DICOM потребують настільної програми для читання. NDPI схожий на TIFF, але зберігає кожен рівень як один величезний JPEG, завеликий для вкладки браузера.
- OME-TIFF з кількома серіями показує першу серію.
- Жодних вимірювань, анотацій чи аналізу: це переглядач.
Для цих форматів, а також для вимірювання, анотування й підрахунку клітин на ваших власних зображеннях SlideScope відкриває 34 формати мікроскопів і слайд-сканерів у Windows і на Mac. SlideScope, настільна програма для мікроскопії від тієї самої команди, — платна програма з безкоштовною бібліотекою зразків (усі інструменти) і передплатою для ваших власних зображень. Безкоштовні альтернативи: Fiji (Bio-Formats) і QuPath.
Як він відкриває файл без завантаження на сервер
Коли ви вибираєте файл, браузер передає цій сторінці дескриптор файлу на вашому диску. Сторінка читає лише потрібні байти: спершу каталог TIFF, потім плитки для тієї частини зображення, що на екрані, і декодує їх на сторінці за допомогою TIFF-бібліотеки з відкритим кодом (geotiff). На сервер нічого не надсилається, тож неопубліковані дані та слайди з етикетками пацієнтів залишаються на вашому комп’ютері, а слайди розміром у кілька гігабайтів відкриваються за секунди, бо їх ніколи нікуди не копіюють. Закрийте вкладку — і файлу на сторінці більше немає.
Сторінка завантажує власні скрипти зі slidescope.science і лічильник переглядів сторінок сайту, що поважає конфіденційність; жоден із них ніколи не бачить вашого зображення. Ліцензії відкритого коду: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Запитання
Як переглянути файл TIFF онлайн, не завантажуючи його на сервер?
Відкрийте його на цій сторінці: браузер читає файл з вашого диска й малює його на сторінці, і на сервер нічого не надсилається. Більшість інших онлайн-переглядачів TIFF спершу завантажують файл на сервер.
Чому мій TIFF виглядає чорним або повністю білим?
Майже завжди це 16-бітне зображення, значення якого займають лише малу частину діапазону 0–65,535. Автоконтраст розтягує фактичний діапазон даних на екран; для порівнюваних зображень задавайте мінімум і максимум вручну.
Чи відкриває він дуже великі файли TIFF?
Так, якщо файл плитковий і має піраміду (повнослайдові зображення, пірамідальний OME-TIFF, BigTIFF): читаються лише плитки на екрані, тож слайди розміром у кілька гігабайтів відкриваються швидко. Велике зображення без піраміди можна досліджувати масштабуванням і панорамуванням, але не показати цілком.
Чи відкриває він багатосторінкові TIFF і Z-стеки?
Так. Для сторінок, площин Z і часових точок з’являються повзунки; OME-TIFF і гіперстеки ImageJ читаються як канали, Z і час.
Чи працює він на Mac або iPhone?
Він працює в будь-якому сучасному браузері, зокрема в Safari на macOS і iOS. Safari може сам показувати прості TIFF, але не 16-бітні, багатоканальні чи пірамідальні.
Чи цей переглядач TIFF безкоштовний?
Так, він безкоштовний і не потребує облікового запису. SlideScope, настільна програма для мікроскопії від тієї самої команди, — платна програма з безкоштовною бібліотекою зразків (усі інструменти) і передплатою для ваших власних зображень.
Потрібно більше, ніж може браузер?
SlideScope відкриває 34 формати мікроскопів і слайд-сканерів у Windows і на Mac, серед них CZI, ND2, LIF, MRXS і SVS у JPEG 2000, з вимірюваннями, анотаціями, підрахунком клітин і експортом в OME-TIFF у повній роздільній здатності. Спробуйте всі інструменти безкоштовно на вбудованих зразках; щоб відкривати власні зображення, потрібна передплата. Уже вирішили? Оформити передплату зараз.