Co otevře
Tažením posunete, kolečkem nebo sevřením prstů přiblížíte, dvojklikem přiblížíte; fungují i klávesy + a −. Pokud soubor obsahuje velikost pixelu, měřítko se přizpůsobuje přiblížení. Uložit pohled jako PNG uloží to, co je na obrazovce.
Proč většina online prohlížečů zobrazí 16bitový TIFF jako černý
Kamery mikroskopů zaznamenávají 12, 14 nebo 16 bitů na pixel, ale obrazovka zobrazí 8. Prohlížeč, který převede 0–65 535 přímo na 0–255, stlačí typický fluorescenční snímek, jehož signál leží mezi několika stovkami a několika tisíci, do několika nejtmavších úrovní šedi: výsledek je černý. Tento prohlížeč nastaví rozsah zobrazení každého kanálu podle 0,1. a 99,9. percentilu jeho dat (stejný princip jako tlačítko Auto ve Fiji) a vy můžete zadat přesné minimum a maximum nebo se vrátit k plnému rozsahu. Mění se tím jen to, co vidíte, nikdy soubor.
Co neotevře
- SVS s JPEG 2000 (komprese Aperio 33003/33005), JPEG XR a JPEG XL nelze v prohlížeči dekódovat bez WebAssembly, které tato stránka nenačítá.
- Formáty, které nejsou založené na TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR a DICOM potřebují desktopovou čtečku. NDPI se podobá TIFF, ale každou úroveň ukládá jako jeden obrovský JPEG, příliš velký pro kartu prohlížeče.
- OME-TIFF s více sériemi zobrazí první sérii.
- Žádná měření, anotace ani analýza: je to prohlížeč.
Pro tyto formáty a pro měření, anotace a počítání buněk na vlastních snímcích otevře SlideScope 34 formátů mikroskopů a skenerů preparátů ve Windows i na Macu. SlideScope, desktopová aplikace pro mikroskopii od stejného týmu, je placená aplikace s bezplatnou knihovnou ukázek (všechny nástroje) a předplatným pro vlastní snímky. Bezplatné alternativy: Fiji (Bio-Formats) a QuPath.
Jak otevře soubor bez nahrávání
Když vyberete soubor, prohlížeč předá této stránce odkaz na něj na vašem disku. Stránka čte jen bajty, které potřebuje: nejprve adresář TIFF, pak dlaždice pro část snímku, která je na obrazovce, a dekóduje je přímo na stránce pomocí open-source čtečky TIFF (geotiff). Na server se nic neposílá, takže nepublikovaná data i preparáty se štítky pacientů zůstávají ve vašem počítači a mnohagigabajtové preparáty se otevřou během několika sekund, protože se nikam nekopírují. Zavřete kartu a soubor ze stránky zmizí.
Stránka načítá vlastní skripty ze slidescope.science a počítadlo zobrazení stránek webu, které respektuje soukromí; ani jedno váš snímek nikdy nevidí. Open-source licence: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Otázky
Jak zobrazit soubor TIFF online, aniž bych ho nahrával?
Otevřete ho na této stránce: webový prohlížeč načte soubor z vašeho disku a vykreslí ho na stránce, a na server se nic neposílá. Většina ostatních online prohlížečů TIFF soubor nejprve nahraje.
Proč můj TIFF vypadá černě nebo úplně bíle?
Téměř vždy jde o 16bitový snímek, jehož hodnoty využívají jen malou část rozsahu 0–65 535. Automatický kontrast roztáhne skutečný rozsah dat na obrazovku; pro srovnatelné snímky nastavte minimum a maximum ručně.
Dokáže otevřít velmi velké soubory TIFF?
Ano, pokud je soubor dlaždicový a má pyramidu (celoplošné snímky, pyramidový OME-TIFF, BigTIFF): čtou se jen dlaždice na obrazovce, takže se i preparáty o velikosti mnoha gigabajtů otevřou rychle. Velký snímek bez pyramidy lze prozkoumat přibližováním a posouváním, ale nelze ho zobrazit celý.
Dokáže otevřít vícestránkové TIFF a Z-stacky?
Ano. Stránky, roviny Z a časové body mají posuvníky; OME-TIFF a hyperstacky ImageJ se čtou jako kanály, Z a čas.
Funguje na Macu nebo na iPhonu?
Běží v každém aktuálním webovém prohlížeči včetně Safari v macOS a iOS. Safari samo zobrazí jednoduché TIFF, ale ne 16bitové, vícekanálové ani pyramidové.
Je tento prohlížeč TIFF zdarma?
Ano, je zdarma a nepotřebuje účet. SlideScope, desktopová aplikace pro mikroskopii od stejného týmu, je placená aplikace s bezplatnou knihovnou ukázek (všechny nástroje) a předplatným pro vlastní snímky.
Potřebujete víc, než zvládne prohlížeč?
SlideScope otevře 34 formátů mikroskopů a skenerů preparátů ve Windows i na Macu, mimo jiné CZI, ND2, LIF, MRXS a SVS s JPEG 2000, s měřením, anotacemi, počítáním buněk a exportem do OME-TIFF v plném rozlišení. Vyzkoušejte všechny nástroje zdarma na vestavěných ukázkách; pro otevírání vlastních snímků potřebujete předplatné. Už máte jasno? Předplaťte si ho.