Ferramenta gratuita

Visualizador de TIFF online para imagens de microscopia

Abra um TIFF do seu computador e veja-o direito: imagens de 16 e 32 bits com contraste ajustável, composições multicanal, pilhas Z, séries temporais e páginas, além de TIFFs piramidais de gigapixels e lâminas SVS em que você pode dar zoom. O seu navegador lê o arquivo; ele nunca é enviado.

Visualizador de TIFF online

Solte aqui um arquivo TIFF, OME-TIFF ou SVS

Lido pelo seu navegador, no seu computador. Nada é enviado.

O que ele abre

AbreDetalhes
TIFF e BigTIFFInteiro e ponto flutuante de 8, 16 e 32 bits, tons de cinza, RGB e paleta; em faixas ou em blocos; várias páginas
OME-TIFFCanais, Z e tempo a partir do OME-XML, nomes e cores dos canais, tamanho do pixel e pirâmides SubIFD
ImageJ / Fiji TIFFHiperpilhas (canais, cortes, quadros) e a calibração do ImageJ
Aperio SVSLâminas com compressão JPEG, com pirâmide, miniatura, etiqueta e macro, e o MPP
TIFF piramidalPirâmides genéricas em blocos (por exemplo, do vips ou do bfconvert)
CompressãoNenhuma, LZW, Deflate (Zip), PackBits, JPEG, WebP

Arraste para mover, role ou faça o gesto de pinça para dar zoom, clique duas vezes para aproximar; as teclas + e − também funcionam. Se o arquivo tiver um tamanho de pixel, uma barra de escala acompanha o zoom. Salvar visualização como PNG guarda o que está na tela.

Por que a maioria dos visualizadores online mostra um TIFF de 16 bits todo preto

As câmeras de microscópio gravam 12, 14 ou 16 bits por pixel, mas a tela mostra 8. Um visualizador que mapeia 0–65.535 diretamente para 0–255 espreme uma imagem típica de fluorescência, cujo sinal fica entre algumas centenas e alguns milhares, nos poucos níveis de cinza mais baixos: preto. Este visualizador define a faixa de exibição de cada canal a partir dos percentis 0,1 e 99,9 dos seus dados (a mesma ideia do botão Auto do Fiji), e você pode digitar valores exatos de mínimo e máximo ou voltar à faixa completa. Isso muda apenas o que você vê, nunca o arquivo.

O que ele não abre

  • SVS em JPEG 2000 (compressão Aperio 33003/33005), JPEG XR e JPEG XL não podem ser decodificados em um navegador sem WebAssembly, que esta página não carrega.
  • Não baseados em TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR e DICOM precisam de um leitor para desktop. O NDPI é parecido com TIFF, mas guarda cada nível como um único JPEG enorme, grande demais para uma aba do navegador.
  • OME-TIFF com várias séries mostra a primeira série.
  • Sem medições, anotações ou análise: é um visualizador.

Para esses formatos, e para medir, anotar e contar células nas suas próprias imagens, o SlideScope abre 34 formatos de microscópios e scanners de lâminas no Windows e no Mac. O SlideScope, o aplicativo de microscopia para desktop feito pela mesma equipe, é um aplicativo pago com uma biblioteca de amostras gratuita (todas as ferramentas) e uma assinatura para suas próprias imagens. Alternativas gratuitas: Fiji (Bio-Formats) e QuPath.

Como ele abre um arquivo sem enviá-lo

Quando você escolhe um arquivo, o navegador entrega a esta página um identificador para ele no seu disco. A página lê só os bytes de que precisa: primeiro o diretório do TIFF, depois os blocos da parte da imagem que está na tela, e os decodifica na própria página com um leitor de TIFF de código aberto (geotiff). Nada é enviado a um servidor, então dados não publicados e lâminas com etiquetas de pacientes ficam no seu computador, e lâminas de vários gigabytes abrem em segundos porque nunca são copiadas para lugar nenhum. Feche a aba e o arquivo sai da página.

A página carrega seus próprios scripts de slidescope.science e o contador de visualizações de página do site, que respeita a privacidade; nenhum deles vê sua imagem. Licenças de código aberto: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

Perguntas

Como posso ver um arquivo TIFF online sem fazer upload?

Abra-o nesta página: o navegador lê o arquivo do seu disco e o desenha na página, e nada é enviado para um servidor. A maioria dos outros visualizadores de TIFF online envia o arquivo primeiro.

Por que meu TIFF aparece preto ou totalmente branco?

Quase sempre é uma imagem de 16 bits cujos valores usam só uma pequena parte da faixa de 0 a 65.535. O Contraste automático estica a faixa real dos dados para a tela; defina o mínimo e o máximo à mão para ter imagens comparáveis.

Ele abre arquivos TIFF muito grandes?

Sim, se o arquivo for dividido em blocos e tiver uma pirâmide (imagens de lâminas inteiras, OME-TIFF piramidal, BigTIFF): só os blocos que estão na tela são lidos, então lâminas de vários gigabytes abrem rápido. Uma imagem grande sem pirâmide pode ser explorada com zoom e movimentação, mas não exibida inteira.

Ele abre TIFFs de várias páginas e pilhas Z?

Sim. Páginas, planos Z e pontos de tempo ganham controles deslizantes; OME-TIFF e hiperpilhas do ImageJ são lidos como canais, Z e tempo.

Funciona no Mac ou no iPhone?

Funciona em qualquer navegador atual, incluindo o Safari no macOS e no iOS. O Safari consegue mostrar TIFFs simples sozinho, mas não os de 16 bits, multicanal ou piramidais.

Este visualizador de TIFF é gratuito?

Sim, é gratuito e não exige conta. O SlideScope, o aplicativo de microscopia para desktop feito pela mesma equipe, é um aplicativo pago com uma biblioteca de amostras gratuita (todas as ferramentas) e uma assinatura para suas próprias imagens.

Precisa de mais do que um navegador consegue fazer?

O SlideScope abre 34 formatos de microscópios e scanners de lâminas no Windows e no Mac, entre eles CZI, ND2, LIF, MRXS e SVS em JPEG 2000, com medições, anotações, contagem de células e exportação para OME-TIFF em resolução total. Experimente todas as ferramentas de graça com as amostras incluídas; para abrir suas próprias imagens, é preciso uma assinatura. Já decidiu? Assine agora.

Baixar o SlideScope