Ferramenta gratuita

Visualizador TIFF online para imagens de microscopia

Abra um TIFF do seu computador e veja-o como deve ser: imagens de 16 e 32 bits com contraste ajustável, compósitos multicanal, pilhas Z, séries temporais e páginas, e lâminas TIFF piramidais e SVS de gigapíxeis onde pode fazer zoom. O ficheiro é lido pelo seu navegador; nunca é carregado.

Visualizador TIFF online

Largue aqui um ficheiro TIFF, OME-TIFF ou SVS

Lido pelo seu navegador, no seu computador. Nada é carregado.

O que abre

AbreDetalhes
TIFF e BigTIFFInteiros e vírgula flutuante de 8, 16 e 32 bits, tons de cinzento, RGB e paleta; em faixas ou em mosaicos; multipágina
OME-TIFFCanais, Z e tempo a partir do OME-XML, nomes e cores dos canais, tamanho de píxel e pirâmides SubIFD
ImageJ / Fiji TIFFHiperpilhas (canais, cortes, fotogramas) e a calibração ImageJ
Aperio SVSLâminas com compressão JPEG com a respetiva pirâmide, miniatura, etiqueta e macro, e o MPP
TIFF piramidalPirâmides em mosaico genéricas (por exemplo, do vips ou do bfconvert)
CompressãoNenhuma, LZW, Deflate (Zip), PackBits, JPEG, WebP

Arraste para deslocar, use a roda do rato ou o gesto de pinça para fazer zoom e faça duplo clique para aproximar; as teclas + e − também funcionam. Se o ficheiro tiver um tamanho de píxel, uma barra de escala acompanha o zoom. «Guardar vista como PNG» guarda o que está no ecrã.

Porque é que a maioria dos visualizadores online mostra um TIFF de 16 bits a preto

As câmaras de microscópio registam 12, 14 ou 16 bits por píxel, mas um ecrã mostra 8. Um visualizador que mapeia 0–65 535 diretamente para 0–255 comprime uma imagem de fluorescência típica, cujo sinal fica entre umas centenas e uns milhares, nos poucos níveis de cinzento mais baixos: preto. Este visualizador define o intervalo de apresentação de cada canal a partir dos percentis 0,1 e 99,9 dos seus dados (a mesma ideia do botão Auto do Fiji), e pode escrever valores exatos de mínimo e máximo ou repor o intervalo completo. Isso só muda o que vê, nunca o ficheiro.

O que não abre

  • SVS JPEG 2000 (compressão Aperio 33003/33005), JPEG XR e JPEG XL não podem ser descodificados num navegador sem WebAssembly, que esta página não carrega.
  • Não baseados em TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR e DICOM precisam de um leitor para computador. O NDPI é semelhante a TIFF, mas guarda cada nível como um único JPEG enorme, demasiado grande para um separador do navegador.
  • OME-TIFF com várias séries: mostra a primeira série.
  • Sem medições, anotações nem análise: é um visualizador.

Para esses formatos, e para medir, anotar e contar células nas suas próprias imagens, o SlideScope abre 34 formatos de microscópios e digitalizadores de lâminas no Windows e no Mac. O SlideScope, a aplicação de microscopia para computador da mesma equipa, é uma aplicação paga com uma biblioteca de amostras gratuita (todas as ferramentas) e uma subscrição para as suas próprias imagens. Alternativas gratuitas: Fiji (Bio-Formats) e QuPath.

Como abre um ficheiro sem o carregar

Quando escolhe um ficheiro, o navegador entrega a esta página um identificador desse ficheiro no seu disco. A página lê apenas os bytes de que precisa: primeiro o diretório TIFF, depois os mosaicos da parte da imagem que está no ecrã, e descodifica-os na página com um leitor de TIFF de código aberto (geotiff). Nada é enviado para um servidor, por isso os dados não publicados e as lâminas com etiquetas de doentes ficam no seu computador, e lâminas de vários gigabytes abrem em segundos porque nunca são copiadas para lado nenhum. Feche o separador e o ficheiro desaparece da página.

A página carrega os seus próprios scripts a partir de slidescope.science e o contador de visualizações de página do site, que respeita a privacidade; nenhum deles vê alguma vez a sua imagem. Licenças de código aberto: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

Perguntas

Como posso ver um ficheiro TIFF online sem o carregar?

Abra-o nesta página: o navegador lê o ficheiro do seu disco e desenha-o na página, e nada é enviado para um servidor. A maioria dos outros visualizadores TIFF online carrega primeiro o ficheiro.

Porque é que o meu TIFF aparece preto ou completamente branco?

Quase sempre é uma imagem de 16 bits cujos valores usam apenas uma pequena parte do intervalo 0–65 535. O «Contraste automático» estica o intervalo real dos dados para o ecrã; defina o mínimo e o máximo à mão para obter imagens comparáveis.

Consegue abrir ficheiros TIFF muito grandes?

Sim, se o ficheiro estiver em mosaicos e tiver uma pirâmide (imagens de lâmina inteira, OME-TIFF piramidal, BigTIFF): só são lidos os mosaicos que estão no ecrã, por isso lâminas de vários gigabytes abrem depressa. Uma imagem grande sem pirâmide pode ser explorada com zoom e deslocamento, mas não mostrada por inteiro.

Consegue abrir TIFF multipágina e pilhas Z?

Sim. As páginas, os planos Z e os pontos temporais têm cursores; os OME-TIFF e as hiperpilhas ImageJ são lidos como canais, Z e tempo.

Funciona num Mac ou num iPhone?

Funciona em qualquer navegador atual, incluindo o Safari no macOS e no iOS. O Safari consegue mostrar sozinho TIFF simples, mas não TIFF de 16 bits, multicanal ou piramidais.

Este visualizador TIFF é gratuito?

Sim, é gratuita e não precisa de conta. O SlideScope, a aplicação de microscopia para computador da mesma equipa, é uma aplicação paga com uma biblioteca de amostras gratuita (todas as ferramentas) e uma subscrição para as suas próprias imagens.

Precisa de mais do que um navegador consegue fazer?

O SlideScope abre 34 formatos de microscópios e digitalizadores de lâminas no Windows e no Mac, entre eles CZI, ND2, LIF, MRXS e SVS JPEG 2000, com medições, anotações, contagem de células e exportação OME-TIFF em resolução total. Experimente gratuitamente todas as ferramentas nas amostras incluídas; para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição. Já decidiu? Subscreva agora.

Transferir o SlideScope