Otevřete preparát Aperio SVS ze svého počítače a posouvejte a přibližujte celou pyramidu, prohlédněte si náhled, snímek štítku a makrosnímek a přečtěte si MPP, zvětšení skenu a další metadata preparátu. Načítají se jen dlaždice na obrazovce, takže se i preparáty o velikosti mnoha gigabajtů otevřou během několika sekund, a nic se nenahrává.
Přetáhněte sem preparát Aperio SVS
Čte ho váš prohlížeč ve vašem počítači. Nic se nenahrává.
Soubor SVS je TIFF s několika obrazy: sken v plném rozlišení (dlaždicový, obvykle s kompresí JPEG), náhled, dvě nebo tři úrovně se sníženým rozlišením, fotografie štítku preparátu a makrosnímek celého skla při malém zvětšení. Popis prvního obrazu obsahuje údaje o skenu, mimo jiné MPP (mikrometry na pixel, asi 0,25 u skenu 40× a 0,5 u 20×) a AppMag. Prohlížeč čte všechny: pyramida řídí přibližování, MPP měřítko a štítek a makrosnímek se otevírají tlačítky vedle obrazu.
Některé skenery Aperio komprimují preparáty pomocí JPEG 2000 (komprese TIFF 33003 nebo 33005). Prohlížeče neumí JPEG 2000 dekódovat bez WebAssembly, proto to tato stránka oznámí, místo aby zobrazila prázdný obraz. Otevřou je Aperio ImageScope (Windows), QuPath a SlideScope. Chcete-li soubor nejprve zkontrolovat, otevřete ho v prohlížeči metadat TIFF a podívejte se na položku Compression.
Snímek štítku je fotografie papírového štítku na skle a může zobrazovat čárový kód, číslo případu nebo jméno pacienta. Když si ho prohlížíte zde, zůstává ve vašem počítači; při sdílení souboru tomu tak není. Než preparát pošlete mimo své pracoviště, přečtěte si, jak odstranit štítky a údaje o pacientech.
Pro tyto formáty a pro měření, anotace a počítání buněk na vlastních snímcích otevře SlideScope 34 formátů mikroskopů a skenerů preparátů ve Windows i na Macu. SlideScope, desktopová aplikace pro mikroskopii od stejného týmu, je placená aplikace s bezplatnou knihovnou ukázek (všechny nástroje) a předplatným pro vlastní snímky. Bezplatné alternativy: Fiji (Bio-Formats) a QuPath.
Když vyberete soubor, prohlížeč předá této stránce odkaz na něj na vašem disku. Stránka čte jen bajty, které potřebuje: nejprve adresář TIFF, pak dlaždice pro část snímku, která je na obrazovce, a dekóduje je přímo na stránce pomocí open-source čtečky TIFF (geotiff). Na server se nic neposílá, takže nepublikovaná data i preparáty se štítky pacientů zůstávají ve vašem počítači a mnohagigabajtové preparáty se otevřou během několika sekund, protože se nikam nekopírují. Zavřete kartu a soubor ze stránky zmizí.
Stránka načítá vlastní skripty ze slidescope.science a počítadlo zobrazení stránek webu, které respektuje soukromí; ani jedno váš snímek nikdy nevidí. Open-source licence: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
Otevřete ho na této stránce: prohlížeč načte preparát z vašeho disku a zobrazí ho s přibližováním, náhledem, štítkem, makrosnímkem a údaji o skenu. Nic se nenahrává.
Pravděpodobně je komprimovaný pomocí JPEG 2000 (komprese 33003 nebo 33005), který prohlížeče dekódovat neumí. Otevřete ho místo toho v Aperio ImageScope, QuPath nebo SlideScope.
Jakoukoli velikost, kterou prohlížeč zvládne adresovat: načítají se jen dlaždice na obrazovce, takže se preparát o velikosti 3 GB otevře zhruba stejně rychle jako malý.
Ano, jako samostatný obraz. Mějte na paměti, že štítky mohou obsahovat údaje o pacientovi.
Ano, je zdarma a nepotřebuje účet. SlideScope, desktopová aplikace pro mikroskopii od stejného týmu, je placená aplikace s bezplatnou knihovnou ukázek (všechny nástroje) a předplatným pro vlastní snímky.
SlideScope otevře 34 formátů mikroskopů a skenerů preparátů ve Windows i na Macu, mimo jiné CZI, ND2, LIF, MRXS a SVS s JPEG 2000, s měřením, anotacemi, počítáním buněk a exportem do OME-TIFF v plném rozlišení. Vyzkoušejte všechny nástroje zdarma na vestavěných ukázkách; pro otevírání vlastních snímků potřebujete předplatné. Už máte jasno? Předplaťte si ho.