Prohlížeč metadat TIFF

Kde TIFF uchovává velikost pixelu

Prohlížeč uvede, které z těchto údajů našel. Pokud žádný není, nastavte měřítko před měřením sami (jak na to, vysvětluje kalkulačka velikosti pixelu).

Pole, podle kterých lze identifikovat pacienta nebo laboratoř

Soubory celoplošných snímků často nesou víc než jen pixely: fotografii štítku na skle (čárový kód, číslo případu, někdy jméno), makrosnímek celého preparátu, datum a čas skenování, sériové číslo skeneru, uživatelské jméno a původní název souboru. Nástroj vypíše ty, které najde v hlavních značkách. Než preparát nasdílíte mimo své pracoviště, odstraňte je: viz jak odstranit štítky a údaje o pacientech ze snímků preparátů.

Stejné informace z příkazového řádku

tiffinfo file.tif (libtiff) vypíše všechny adresáře; exiftool -a -G1 file.tif přidá značky výrobce; v Pythonu tifffile.TiffFile(path) zpřístupní .pages[i].tags, .ome_metadata a .imagej_metadata. U SVS vrátí openslide.OpenSlide(path).properties zpracovaná pole (viz čtení souborů SVS v Pythonu).

Jak otevře soubor bez nahrávání

Když vyberete soubor, prohlížeč předá této stránce odkaz na něj na vašem disku. Stránka čte jen bajty, které potřebuje: nejprve adresář TIFF, pak dlaždice pro část snímku, která je na obrazovce, a dekóduje je přímo na stránce pomocí open-source čtečky TIFF (geotiff). Na server se nic neposílá, takže nepublikovaná data i preparáty se štítky pacientů zůstávají ve vašem počítači a mnohagigabajtové preparáty se otevřou během několika sekund, protože se nikam nekopírují. Zavřete kartu a soubor ze stránky zmizí.

Stránka načítá vlastní skripty ze slidescope.science a počítadlo zobrazení stránek webu, které respektuje soukromí; ani jedno váš snímek nikdy nevidí. Open-source licence: image-tools-vendor.LICENSE.txt.

Otázky