مقارنة البرامج

برامج تحليل صور المجهر: مقارنة بين 18 أداة

الإجابة المختصرة: للتحليل العام المجاني، استخدم Fiji؛ ولعلم الأمراض بالشرائح الكاملة، QuPath؛ ولسلاسل المعالجة الدفعية، CellProfiler؛ وللتقطيع بالتعلم الآلي دون شيفرة، ilastik؛ ولـ Python والتعلم العميق، napari مع Cellpose أو StarDist. وتتصدّر الحزم التجارية مثل Imaris وZEISS arivis Pro وHALO وVisiopharm في مجموعات البيانات ثلاثية الأبعاد الكبيرة والقياس الكمي للشرائح الكاملة على نطاق واسع. كل معلومة أدناه مأخوذة من صفحات الشركة المصنّعة أو المشروع نفسه، وقد تم التحقق منها في 8 أكتوبر 2026.

اطّلع على المقارنة نزّل SlideScope

8 أدوات مجانية، و9 تجارية مصادرها صفحات الشركات المصنّعة تشمل تغييرات 2023-2026

أفضل أداة لكل مهمة

المهمة	الأداة	السعر والأنظمة
التحليل العام، مجانًا	Fiji (ImageJ)	مجاني ومفتوح المصدر؛ Windows وmacOS وLinux
علم الأمراض بالشرائح الكاملة، مجانًا	QuPath	مجاني ومفتوح المصدر؛ Windows وmacOS وLinux
سلاسل معالجة دفعية عبر صور كثيرة	CellProfiler	مجاني ومفتوح المصدر؛ Windows وmacOS وLinux
التقطيع بالتعلم الآلي دون شيفرة	ilastik	مجاني ومفتوح المصدر؛ Windows وmacOS وLinux
سير عمل Python والتعلم العميق	napari مع Cellpose أو StarDist	مجاني ومفتوح المصدر
العرض التفاعلي ثلاثي الأبعاد ورباعي الأبعاد	Imaris أو ZEISS arivis Pro	تجاري، بعرض سعر
القياس الكمي للأنسجة في الشرائح الكاملة على نطاق واسع	Indica Labs HALO أو Visiopharm	تجاري، بعرض سعر
إزالة الالتفاف (Deconvolution)	SVI Huygens	تجاري، بعرض سعر
عرض صيغ مختلطة وقياسها والعدّ فيها	SlideScope	مدفوع، مع مكتبة عينات مجانية؛ Windows وmacOS

برامج مجانية ومفتوحة المصدر لتحليل صور المجهر

كل هذه البرامج مجانية. يقرأ Fiji وQuPath الصيغ الاحتكارية مثل CZI وND2 وLIF وSVS عبر مكتبة Bio-Formats (ويستخدم QuPath أيضًا OpenSlide)؛ أما ilastik فيتوقع TIFF أو HDF5 أو OME-Zarr، لذا حوّل الملفات أولًا.

الأداة	الترخيص	الأنظمة	الأفضل لـ	أحدث إصدار
Fiji (ImageJ)	GPL (ImageJ2 بترخيص BSD-2)	Windows وmacOS وLinux (x86-64 وarm64)	المعالجة والقياس العامّان؛ آلاف الإضافات ووحدات الماكرو	2.18.0 (يونيو 2026)
QuPath	GPL	Windows، وmacOS (Intel وApple silicon)، وLinux	علم الأمراض بالشرائح الكاملة: التعليقات التوضيحية، واكتشاف الخلايا، والبرمجة النصية	0.7.0 (مارس 2026)
CellProfiler	BSD-3	Windows 10/11، وmacOS 13+، وLinux (Flatpak)	قياس عالي الإنتاجية قائم على سلاسل المعالجة عبر صور كثيرة	4.2.8 (سبتمبر 2024)
napari	BSD-3	حزمة Python أو مُثبّت مستقل	عرض متعدد الأبعاد وتعليقات توضيحية أصيلة في Python للعمل بالبرمجة النصية والتعلم العميق	0.9.2 (سبتمبر 2026)
ilastik	GPL	Windows 10+، وmacOS (Intel وApple silicon)، وLinux	تصنيف تفاعلي للبكسلات والأجسام بالتعلم الآلي، والتتبع	1.4.2 (مايو 2026)
Icy	GPLv3 / LGPL-3.0	Windows وmacOS وLinux (Java)	التصور ثلاثي الأبعاد، والتتبع، واكتشاف البقع عبر بروتوكولات رسومية	تتم صيانته بنشاط
Cellpose	BSD-3 (النماذج مدرّبة على بيانات بترخيص CC-BY-NC)	Windows, macOS, Linux	تقطيع عام للخلايا بالتعلم العميق	4.2.1.1 (يونيو 2026)
StarDist	BSD-3	Windows, macOS, Linux	اكتشاف الأنوية؛ إضافات لـ Fiji وQuPath وnapari وIcy	0.9.2 (ديسمبر 2025)

برامج تجارية لتحليل صور المجهر

لا تنشر أيٌّ من الشركات أدناه سعرًا؛ فكلها تبيع بعروض أسعار، وعادةً مع وحدات أو اشتراكات أو تراخيص مؤسسية، ومعظمها يقدّم فترة تجريبية. أضاف Imaris 11.1 قارئًا أصيلًا لملفات ZEISS CZI؛ ويقرأ arivis Pro أكثر من 30 صيغة منها CZI وND2 وLIF وVSI؛ ويقرأ Aivia أكثر من 45 صيغة منها LIF بشكل أصيل؛ ويقرأ HALO صيغ الشرائح الكاملة الرئيسية ومنها SVS وNDPI وMRXS وCZI وiSyntax.

الأداة	الشركة المصنّعة	الأنظمة	الأفضل لـ	أحدث إصدار
Imaris	Oxford Instruments Andor	Windows 10/11, macOS	عرض تفاعلي ثلاثي ورباعي الأبعاد، وأسطح، وتتبع؛ وImaris Viewer مجاني	11.1 (سبتمبر 2026)
ZEISS arivis Pro	ZEISS (سابقًا arivis Vision4D)	Windows فقط	مجموعات بيانات ثلاثية ورباعية الأبعاد كبيرة جدًا، وتقطيع بالذكاء الاصطناعي، وتتبّع الخلايا العصبية	4.6 (سبتمبر 2026)
Leica Aivia	Leica Microsystems	Windows 10/11 Pro؛ ونسخة ويب	تقطيع بالذكاء الاصطناعي دون شيفرة عبر الأمثلة، وتحليل متعدد الآبار	Aivia 16 (يونيو 2026)
HALO	Indica Labs	اسأل الشركة المصنّعة	تحليل كمي للأنسجة في الشرائح الكاملة، وتنميط ظاهري متعدد الإرسال	4.3
Visiopharm	Visiopharm	اسأل الشركة المصنّعة	علم الأمراض بالذكاء الاصطناعي، وتطبيقات بحثية وتشخيصية حاصلة على CE-IVD	2026.08.4 (أغسطس 2026)
NIS-Elements	Nikon	AR 7: Windows 11 Pro	الالتقاط والتحليل على أنظمة Nikon؛ وViewer مجاني لنظامي Windows وmacOS	AR 7.00.00 (سبتمبر 2026)
ZEISS ZEN	ZEISS	Windows	الالتقاط والتحليل على أنظمة ZEISS؛ وZEN lite مجاني	ZEN 3.14
cellSens	Evident (Olympus)	Windows 10/11 Pro	الالتقاط، والتقطيع بالتعلم العميق عبر TruAI، وإزالة الالتفاف	4.5
Huygens	Scientific Volume Imaging	راجع الشركة المصنّعة	إزالة الالتفاف والاستعادة، من ثنائي الأبعاد إلى رباعي الأبعاد	26.04

ما الذي تغيّر في 2023-2026

توقف MetaMorph. توقفت Molecular Devices عن تقديم حزمة MetaMorph، بما فيها MetaFluor وMetaVue، بعد 7 يوليو 2023، ولم تسمِّ بديلًا (Molecular Devices).
لم يصدر لـ CellProfiler إصدار مستقر منذ 4.2.8 في سبتمبر 2024. يوجد وسم تطوير للإصدار 5.0، لكن لا إصدار.
لم يعد Aperio ImageScope قيد التطوير النشط، وفقًا لـ Leica؛ لكنه يبقى عارضًا مجانيًا لنظام Windows (راجع ImageScope على Mac).
أصبح arivis Vision4D الآن ZEISS arivis Pro، ولا يزال يعمل على Windows فقط.
يقرأ Imaris 11.1 ملفات ZEISS CZI بشكل أصيل (سبتمبر 2026).
يتطلب NIS-Elements AR 7 نظام Windows 11 Pro ولا يتوافق مع Windows 10.
انتقل الإصدار الرئيسي من Fiji إلى Java 21 ويدعم إصدارات arm64.
نماذج Cellpose مدرّبة على بيانات بترخيص CC-BY-NC، وهذا مهم إذا استخدمتها تجاريًا، رغم أن الشيفرة مرخّصة بـ BSD.
لا يزال Leica Aivia قيد التطوير: صدر Aivia 16 في يونيو 2026.

كيف تختار

ابدأ من المهمة، لا من قائمة الميزات. يذهب معظم وقت التصوير إلى أربع مهام: النظر في الالتقاط والتحقق منه، والقياس والتسجيل، والقياس الكمي للأجسام، وبناء سلسلة معالجة مخصصة. تحتاج المهمتان الأوليان إلى عارض سريع؛ وتحتاج الأخيرة إلى منصة قابلة للبرمجة.

علم الأمراض بالشرائح الكاملة: QuPath أولًا؛ وHALO أو Visiopharm حين يحتاج المختبر إلى قياس كمي معتمد للأنسجة على نطاق واسع. الفحص متحد البؤر وثلاثي الأبعاد: Imaris أو arivis Pro إن سمحت الميزانية، وإلا فـ Fiji أو napari أو Icy، مع Huygens لإزالة الالتفاف. الفحوص عالية المحتوى: CellProfiler. التقطيع بالتعلم العميق: Cellpose أو StarDist، داخل napari أو Fiji أو QuPath، أو ilastik للتدريب التفاعلي. إدارة البيانات ومشاركتها مهمة منفصلة: يخزّن OMERO (المجاني) الصور ويقدّمها لكل ما سبق.

تحقّق من صيغة ملفك قبل الالتزام. دعم Bio-Formats لا يضمن فتح كل متغيرات الصيغة؛ ويحذّر توثيق QuPath نفسه من أن الصيغ المدرجة لن تُفتح دائمًا بشكل صحيح. وقد فتح اختبار الصيغ الخاص بنا 792 ملفًا حقيقيًا بـ 14 صيغة، وينشر كل حالة فشل.

أين يناسب SlideScope

SlideScope عارض مكتبي لنظامي Windows وMac يفتح CZI وND2 وLIF وSVS وNDPI وMRXS وDICOM وOME-TIFF مباشرة، ومنذ الإصدار 1.10.0 أيضًا VSI وOIB وOIR وLSM وZVI وLeica LOF وXLEF وDeltaVision وMetaMorph STK وND وOME-Zarr المحلي، ومنذ الإصدار 1.20.0 ICS/IDS وGatan DM3/DM4 وOlympus SIS، مع بيانات الالتقاط الوصفية التي يسجّلها كل ملف؛ ويقيس بالميكرومتر المعاير، ويحتفظ بالتعليقات التوضيحية، ويشغّل القياس الكمي المحلي: يقطّع الأنوية أو الخلايا أو الجسيمات على حاسوبك ويصدّر الأعداد والشكل والشدة بصيغ CSV وGeoJSON وTIFF للأقنعة، مع تشغيل دفعي على مجلد كامل. ولا يتضمن برمجة نصية ولا وحدات ماكرو ولا سلاسل معالجة مخصصة، لذا للتحليل المخصص احتفظ بـ Fiji أو CellProfiler أو QuPath أو napari واستخدم SlideScope قبلها. المقارنات: Fiji وImageJ، وQuPath وnapari، وCellProfiler.

أسئلة حول برامج تحليل صور المجهر

ما أفضل برنامج مجاني لتحليل صور المجهر؟

للتحليل العام، Fiji (ImageJ) هو الخيار المجاني المعتاد: يعمل على Windows وmacOS وLinux، ويفتح معظم صيغ المجاهر عبر Bio-Formats، ويضم آلاف الإضافات. ولصور علم الأمراض بالشرائح الكاملة، QuPath هو الخيار المجاني المعتاد؛ ولسلاسل المعالجة الدفعية عبر صور كثيرة، CellProfiler؛ وللتقطيع بالتعلم الآلي دون شيفرة، ilastik؛ ولسير عمل Python والتعلم العميق، napari مع Cellpose أو StarDist.

أيهما أفضل لصور الشرائح الكاملة: Fiji أم QuPath؟

QuPath. فهو مبني حول صور الشرائح الكاملة: يبثّ هرم الصورة تدريجيًا، وصُمّمت تعليقاته التوضيحية واكتشافه للخلايا وبرمجته النصية لشرائح بحجم الغيغابكسل. أما Fiji فهو صندوق الأدوات الأعم، لكنه غير مصمَّم لصور الشرائح الكاملة الكبيرة جدًا.

ما البرامج التي تفتح ملفات CZI وND2 وLIF؟

أدوات الشركات المصنّعة (ZEISS ZEN أو ZEN lite المجاني لملفات CZI، وNikon NIS-Elements أو NIS-Elements Viewer المجاني لملفات ND2، وLeica LAS X لملفات LIF)، وFiji وQuPath عبر Bio-Formats، والحزم التجارية مثل arivis Pro وImaris (يدعم CZI بشكل أصيل منذ 11.1) وAivia وHALO. ويفتح SlideScope الصيغ الثلاث مباشرة على Windows وMac. أما ilastik فلا يقرأها مباشرة؛ حوّلها إلى TIFF أو HDF5 أولًا.

ما أفضل برنامج لتحليل الصور متحدة البؤر وثلاثية الأبعاد؟

Imaris (من Oxford Instruments) وZEISS arivis Pro هما الخياران التجاريان الرئيسيان للعرض التفاعلي ثلاثي ورباعي الأبعاد والأسطح والتتبع؛ يعمل arivis Pro على Windows فقط، وImaris على Windows وmacOS. والخيارات المجانية هي Fiji مع إضافات ثلاثية الأبعاد، وnapari، وIcy. ولإزالة الالتفاف قبل التحليل، SVI Huygens هو الأداة التجارية المتخصصة.

هل يمكنني تقطيع الخلايا بالتعلم العميق دون برمجة؟

نعم. يدرّب ilastik مصنّفات البكسلات والأجسام تفاعليًا؛ ولـ Cellpose واجهة رسومية (تُثبَّت مع Python)؛ ويعمل StarDist كإضافة داخل Fiji وQuPath وnapari. ومن الخيارات التجارية Leica Aivia (التقطيع عبر الأمثلة) وEvident cellSens TruAI وarivis Pro. ويقطّع SlideScope الأنوية أو الخلايا أو الجسيمات على حاسوبك بوصفات مدمجة أو محفوظة، دون تدريب.

هل SlideScope برنامج لتحليل الصور؟

جزئيًا. SlideScope عارض مكتبي يقيس أيضًا بوحدات معايرة، ويحتفظ بالتعليقات التوضيحية، ويقطّع الأنوية أو الخلايا أو الجسيمات ويعدّها على حاسوبك، مع تشغيل دفعي على مجلد كامل وتصدير بصيغ CSV وGeoJSON والأقنعة. ولا يتضمن برمجة نصية ولا وحدات ماكرو ولا سلاسل معالجة مخصصة؛ ولهذه تبقى Fiji وCellProfiler وQuPath وnapari الأدوات المناسبة.

المصادر

الأنظمة والتراخيص وأرقام الإصدارات مأخوذة من موقع كل مشروع أو شركة مصنّعة وصفحات إصداراته، وقد تم التحقق منها في 8 أكتوبر 2026 وهي مرتبطة في الجداول أعلاه. وحيث لا تصرّح شركة مصنّعة بمعلومة علنًا (مثل أنظمة تشغيل HALO أو Visiopharm)، يذكر الجدول ذلك بدلًا من التخمين. للتصحيحات: support@slidescope.science.

هل تحتاج إلى فتح الملفات وقياسها أولًا؟

جرّب SlideScope على ملفات CZI أو ND2 أو LIF أو الشرائح الكاملة الخاصة بك. مكتبة العينات المدمجة مجانية مع جميع الأدوات؛ أما صورك الخاصة فتحتاج إلى اشتراك (PayPal أو بطاقة).

نزّل SlideScope