مصفوفة التوافق الحالية
المصفوفة مستمدة من آلية التوجيه الحالية في تطبيق SlideScope ومن سلوك القارئات. استخدمها مرجعًا للفرز الأولي، ثم اختبر ملفات تمثيلية من المجهر أو الماسح نفسه، وإصدار البرنامج نفسه، وإعدادات الضغط نفسها التي يستخدمها فريقك.
| عائلة الصيغة | الامتدادات المقبولة | سلوك القارئ | فحوصات مهمة |
|---|---|---|---|
| ZEISS CZI | .czi |
يوحّد أبعاد الزمن وZ والقناة وY وX؛ ويقرأ بيانات الالتقاط الوصفية والمعايرة المكانية عند توفرها. تصبح المشاهد التي تشترك في نوع البكسل والمحاور مشاهد منفصلة يمكن التنقل بينها، كل منها بحجمه الخاص، ويعرضها XY Overview معًا. يصدّر المشهد الظاهر على الشاشة، أو كل المشاهد، إلى OME-TIFF. | اختبر المشاهد، والفسيفساء، وتخطيطات الكتل الفرعية غير الشائعة، وعمليات الالتقاط الكبيرة جدًا. |
| Nikon ND2 | .nd2 |
يربط الزمن وZ والقنوات وحجم الصورة. تشكّل مواضع المنصة المتعددة محورًا منفصلًا للمواضع له أداة تحكم خاصة به، ويضعها XY Overview عند إحداثيات المنصة المسجلة. | تأكّد من تفسير المواضع والزمن، وتخطيط RGB، والبيانات الوصفية، والجيل الدقيق من NIS-Elements. |
| Aperio SVS | .svs |
يقرأ مستويات الهرم في الشرائح الكاملة القائمة على TIFF، ويختار مستوى عرض قابلًا للإدارة ضمن قيود الذاكرة. | تحقّق من مفككات ترميز JPEG وJPEG 2000، وسلامة الهرم، والبيانات الوصفية للماسح، ومستوى الدقة المطلوب. |
| TIFF وOME-TIFF | .tif, .tiff |
يستخدم المحاور المسمّاة حيثما توفرت، بما فيها الزمن وZ والقناة وY وX. ويتعرّف على البيانات الوصفية لـ OME-TIFF وImageJ والمقياس المكاني عند وجودها. ويمكن الوصول إلى كل صفحة في ملف TIFF عادي متعدد الصفحات. | TIFF حاوية مرنة. تحقّق من الضغط، وحجم BigTIFF، والأهرامات، والمحاور، والحفاظ على البيانات الوصفية. |
| شرائح ماسحات الشركات المصنّعة | .ndpi، .mrxs، .scn، .bif، .vms، .vmu، .svslide، .qptiff، .avs |
يقرأ هرم الصور الخاص بالماسح عبر محرك OpenSlide، ويحمّل المستوى المطابق للمنطقة الظاهرة على الشاشة. يستخدم شريط المقياس والقياسات والتعليقات التوضيحية معايرة الماسح بالميكرون عند كل مستوى تكبير. ومنذ 1.10.0، تُفتح شرائح NDPI المضغوطة بـ JPEG XR، وكذلك شرائح Leica SCN وVentana BIF التي لا يستطيع OpenSlide قراءتها. ومنذ 1.20.0، تظهر التعليقات التوضيحية المرسومة في NDP.view (ملف .ndpa بجوار ملف .ndpi) فوق الشريحة ويمكن نسخها إلى قياساتك. |
تخزّن MRXS وVMS وVMU بيانات البكسل في مجلد مرافق بجوار ملف الفهرس، لذا لا تُفتح إلا من التخزين المحلي وتُرفض للروابط البعيدة. وفي شرائح BIF التي لا يستطيع OpenSlide قراءتها، لا تُدمج حواف البلاطات بعد. تحقّق من سلامة الهرم والبيانات الوصفية للشركة المصنّعة على شرائح تمثيلية. |
| Hamamatsu NDPIS (منذ 1.10.0) | .ndpis |
يفتح مجموعات الفلورسنت من Hamamatsu بأسماء قنواتها وألوانها الحقيقية، مع قياسات بوحدة µm مستمدة من معايرة الماسح. | تحقّق من أسماء القنوات وألوانها والمعايرة مقارنةً ببرنامج الماسح على مجموعة تمثيلية. |
| Olympus/Evident VSI (منذ 1.10.0) | .vsi |
يفتح صور الشرائح الكاملة وصور الفلورسنت من cellSens، بما فيها الشرائح ذات مناطق المسح المتعددة. تُقاس كل منطقة مسح بحجم البكسل الخاص بها، وتعرض لوحة Details البيانات الوصفية المسجلة مثل العدسة الشيئية، وأسماء القنوات وألوانها الحقيقية، وتاريخ الالتقاط. | اختبر الشرائح متعددة المناطق ومسوحات الفلورسنت من إصدار cellSens الذي يستخدمه فريقك. |
| Olympus FluoView (منذ 1.10.0) | .oib، .oif، .oir |
يفتح ملفات FluoView البؤرية بأسماء القنوات وألوانها الحقيقية، والمستويات البؤرية بوحدة µm، والنقاط الزمنية بالثواني الفعلية. وتعرض لوحة Details الإعدادات المسجلة مثل العدسة الشيئية، والليزرات، والكواشف ومعاملات الكسب، والثقب (pinhole). | تحقّق من تفسير القنوات وZ والزمن مقارنةً بـ FluoView على عملية التقاط تمثيلية. |
| Zeiss ZVI وLSM (منذ 1.10.0) | .zvi, .lsm |
يفتح ملفات AxioVision ZVI وملفات LSM البؤرية من LSM 510 حتى LSM 980، بأسماء القنوات وألوانها الحقيقية والمستويات البؤرية بوحدة µm. وتعرض لوحة Details الإعدادات المسجلة مثل العدسة الشيئية، والتعريض، والليزرات، والكواشف، والثقب (pinhole). | اختبر ملفات من كل جيل من AxioVision أو ZEN يؤرشفه فريقك. |
| Leica LIF وLOF وXLEF | .lif، .lof، .xlef، .xlif، .xlcf |
يفتح ملفات LAS X؛ وتُفتح ملفات LOF ومشاريع XLEF مع أجزائها XLIF وXLCF منذ 1.10.0، كما تعمّق دعم LIF في الإصدار نفسه. تُفتح عمليات المسح بالبلاطات وعمليات الالتقاط متعددة المواضع كمواضع يمكنك التنقل بينها أو رؤيتها معًا في XY Overview، موضوعة بحسب إحداثيات المنصة المسجلة. | أبقِ الملفات التي يشير إليها مشروع XLEF معًا، وتحقّق من مواضع المنصة على مسح بالبلاطات تمثيلي. |
| DeltaVision (منذ 1.10.0) | .dv، .r3d |
يفتح ملفات DeltaVision، بما فيها صور D3D بعد إزالة الالتفاف (deconvolution)، مع القنوات، والمستويات البؤرية بوحدة µm، والنقاط الزمنية بالثواني. وتعرض لوحة Details الإعدادات المسجلة مثل العدسة الشيئية، والتعريض، والمرشحات. | قارن الملفات الخام والملفات بعد إزالة الالتفاف من عملية الالتقاط نفسها إذا كان كلاهما يُستخدم في المراحل اللاحقة. |
| MetaMorph (منذ 1.10.0) | .stk، .nd، وملفات MetaSeries .tif |
يفتح مكدسات STK، وملفات MetaSeries TIFF، ومجموعات الالتقاط متعدد الأبعاد .nd. تُفتح مجموعة .nd كصورة واحدة: تصبح أطوالها الموجية قنوات، ونقاطها الزمنية سلسلة زمنية، ويمكن التنقل بين مواضع المنصة فيها أو رؤيتها معًا في XY Overview. |
أبقِ ملفات TIFF أو STK التي تسردها مجموعة .nd بجوارها. |
| OME-Zarr (منذ 1.10.0) | مجلدات .zarr |
يفتح صور OME-NGFF 0.4 و0.5، بما فيها صفائح HCS بكل آبارها ومجالاتها، ومخرجات bioformats2raw مع بياناتها الوصفية OME-XML. ويمكن التنقل بين آبار الصفيحة أو رؤيتها معًا في XY Overview. | المجلدات المحلية فقط: لا يمكن فتح OME-Zarr من رابط https بعيد. |
| الصور اليومية (منذ 1.10.0) | .png، .jpg، .jpeg، .jpe، .jfif، .jp2، .j2k، .bmp، .gif، .webp |
يفتح صور PNG وJPEG وJPEG 2000 وBMP وGIF وWebP في العارض نفسه الذي يفتح ملفات المجهر. | تحقّق مما إذا كان الملف يسجّل معايرة قبل الاعتماد على القياسات بوحدة µm. |
| Philips iSyntax (منذ 1.20.0) | .isyntax |
يفتح مسوحات الشرائح الكاملة بصيغة Philips iSyntax مع هرمها، وحجم البكسل، والملصق، والصورة العامة (macro). يعرض SlideScope البكسلات بعد فك ترميزها: فلا تُطبَّق الحِدّة وتحسين التباين وملف الألوان الخاصة بـ Philips، وتذكر لوحة Details ذلك. | قارن شريحة تمثيلية بعارض Philips إذا كان المظهر الدقيق مهمًا. ويُرفض الملف التالف أو المبتور بدلًا من فتحه جزئيًا. |
| KFBio KFB (منذ 1.20.0) | .kfb |
يفتح مسوحات الشرائح الكاملة بالحقل الساطع من KFBio مع هرمها وحجم البكسل. وتُرسم البلاطة التالفة من المستوى التالي الأقل دقة، ويذكر SlideScope ذلك. | لا تُفتح شرائح الفلورسنت KFBF. وتظهر المناطق التي لم يصوّرها الماسح باللون الأبيض. |
| ICS/IDS (منذ 1.20.0) | .ics، .ids |
يفتح صور Image Cytometry Standard، مثل مخرجات SVI Huygens وDIPlib: أزواج .ics/.ids من الإصدار 1 والملفات المفردة من الإصدار 2، بما فيها البيانات المضغوطة بـ gzip، مع مقياسها ومحاورها. وتطابق البكسلات ما يقرؤه Bio-Formats، بما في ذلك اتجاهه لملفات Huygens. |
أبقِ ملف .ids بجوار ملف الترويسة .ics. ويُتعرَّف على ملف التقويم .ics فلا يُفتح كصورة. |
| Gatan DM3 وDM4 (منذ 1.20.0) | .dm3, .dm4 |
يفتح صور Gatan Digital Micrograph مع معايرتها والبيانات الوصفية للمجهر. ويُتنقَّل في صور أطياف EELS وEDS عبر الطاقة بشريط تمرير Energy، وتحصل أنماط الحيود وتحويلات FFT على شريط مقياس مقلوب بوحدة nm⁻¹ بدلًا من القياسات. | لا تُفتح الأطياف أحادية البعد ومجموعات بيانات 4D-STEM. |
| Olympus SIS (منذ 1.20.0) | .sis، وملفات .tif الموسومة بـ SIS |
يفتح صور Olympus analySIS مع حجم البكسل والبيانات الوصفية المسجلة. | .sis هو أيضًا امتداد لمثبّتات Symbian، لذا لا تُفتح إلا الملفات التي هي فعلًا صور TIFF. |
| DICOM القياسي | .dcm، .dicom |
يتعامل مع مجموعات البيانات القياسية أحادية الإطار ومتعددة الإطارات، فيربط الزمن وZ والقنوات والإطارات وبيانات وصفية مختارة. ويُقرأ DICOM للشرائح الكاملة المقسّم إلى بلاطات عبر مسار هرمي منفصل مع وصول أصلي إلى البلاطات. | تحقّق من صيغة النقل ومفككات الترميز، وفئة SOP، وسياسة إزالة الهوية، ومتطلبات الاستخدام البحثي. |