افتح ملفات ZEISS CZI في SlideScope على Windows أو macOS دون تحويلها مسبقًا. افحص القنوات وأبعاد الصورة المحفوظة في الملف. لا يرفع العرض المحلي الصورة إلى خادم.
قد يحتوي ملف CZI على عدة مشاهد: آبار صفيحة، أو مناطق بلاطات، أو مناطق مسح شريحة. يعرض SlideScope كل مشهد بمفرده أو جميع المشاهد معًا، ويصدّر إلى OME-TIFF المشهد الذي تعرضه أو جميع المشاهد. يستخدم الفيديو والخطوات أدناه ملف عينة عامًا يحتوي على مشهدين.
قد يحتوي ملف CZI على عدة مشاهد: آبار صفيحة، أو مناطق بلاطات، أو مناطق مسح. إليك كيف تعرض كلًا منها وتصدّرها بصيغة OME-TIFF.
ملف CZI بمشهدين، مفتوح مباشرة. دون تحويل. ينقلك عنصر التحكم Scene من مشهد إلى الذي يليه. المشهد 2 هو البئر D7. والمشهد 1 هو البئر D6. يضع XY Overview كل مشهد في الموضع الذي سُجّل فيه. تفصل بين هذين البئرين مسافة 9 mm.
ادمج القنوات في عرض واحد. أوقف قناة لترى ما تضيفه. كبّر العرض. يبقى شريط المقياس معايَرًا. تعرض Details حجم البكسل والقنوات وإعدادات الاقتناء.
للتصدير، اختر File ثم Export Current Image as TIFF. أثناء عرضك مشهدًا واحدًا، يُصدَّر ذلك المشهد فقط. قبل البدء، ترى حجم البكسل والقنوات والضغط التي ستُكتب. لتصدير جميع المشاهد، فعّل XY Overview أولًا. تدخل جميع المشاهد في ملف OME-TIFF واحد. كل مشهد صورة مستقلة داخله.
افتح النتيجة. المشهدان موجودان، كصورة 1 وصورة 2. انتقل حجم البكسل وأسماء القنوات كما هي.
يتيح لك الحساب المجاني فتح الصور المحلية وعرضها قبل أي فترة تجريبية. يتطلب التصدير فترة تجريبية مدتها 3 أيام أو اشتراكًا. يُصدَّر المسح الكبير المكوّن من بلاطات بدقة العرض العام، لا بالدقة الكاملة. إنه التطبيق نفسه على macOS وWindows. سُجّلت هذه اللقطات على Windows.
اختر File › Open File… (Ctrl+O على Windows، و⌘O على Mac) أو اسحب ملف .czi إلى النافذة. يظهر المشهد الأول فورًا. لا يُحوَّل أي شيء ولا يُرفع الملف.
يعرض الملف الذي يحتوي على عدة مشاهد عنصر التحكم Scene أسفل الصورة. استخدم − و+ أو اكتب رقمًا. يحتفظ كل مشهد بحجمه الخاص واسمه من الملف، مثل بئر (D6، D7) أو منطقة بلاطات.
انقر XY Overview بجوار عنصر التحكم Scene، أو اختر View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). يُرسم كل مشهد في الموضع الذي سُجّل فيه، بما في ذلك الفراغات. انقر مشهدًا لتحديده وانقر نقرًا مزدوجًا لفتحه. المشاهد المتباعدة، مثل آبار تفصل بينها 9 mm، تظهر في البداية كبلاطات صغيرة: كبّر العرض لرؤيتها.
في Display، فعّل Blend channels into one view للحصول على صورة مركّبة ملونة، أو أوقف قنوات منفردة. تعرض Details حجم البكسل والأبعاد والمشهد الحالي وحجمه. السطوع والتباين والألوان تغيّر ما تراه فقط، ولا تغيّر البكسلات المخزنة أبدًا.
اختر File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). حدّد مجلدًا واسمًا؛ يقترح SlideScope اسمًا ينتهي بـ .ome.tif.
عندما يكون مشهد واحد على الشاشة، يُصدَّر ذلك المشهد فقط، باسم مثل sample_scene-2.ome.tif. لتصدير جميع المشاهد، فعّل XY Overview أولًا: تدخل جميع المشاهد في ملف OME-TIFF واحد، كل منها صورة مستقلة بحجمها الخاص. قبل كتابة أي شيء، تعرض نافذة تأكيد الحجم وحجم البكسل والقنوات والضغط.
انقر Open Exported TIFF عند انتهاء التصدير. يعرض SlideScope كل مشهد مُصدَّر كصورة؛ تنقّل بينها باستخدام عنصر التحكم Image. قارئات OME-TIFF التي تدعم عدة صور في الملف، مثل Bio-Formats في Fiji، تسردها كسلاسل منفصلة.
Windows 10 أو 11، أو macOS 14 أو أحدث على Apple Silicon أو Intel. استكشف مكتبة العينات المدمجة مجانًا، مع جميع الأدوات. افتح صورك الخاصة مع تجربة مجانية لمدة 3 أيام. يتطلب التصدير الفترة التجريبية (3 أيام) أو اشتراكًا (25.00 US$ شهريًا بعد الفترة التجريبية).
يمكن التنقل بين المشاهد عندما تشترك في نوع البكسل وفي القنوات ومستويات Z والنقاط الزمنية نفسها. إذا لم تكن كذلك، يعرض SlideScope المشهد الأول ويذكر السبب في Details. إذا لم يكن هذا ما تتوقعه، فأرسل إلينا الملف.
تُؤخذ ألوان القنوات من الملف عندما يسجّلها. غيّرها في Display › Channel colour…؛ ويسجّل التصدير الألوان التي تضبطها.
يُصدَّر المسح الكبير المكوّن من بلاطات بدقة العرض العام، وتذكر نافذة التأكيد ذلك قبل كتابة أي شيء. يبقى المسح بالدقة الكاملة قابلًا للعرض في SlideScope.
العرض يعمل مع حساب مجاني. أما التصدير فيتطلب الفترة التجريبية المجانية أو اشتراكًا.
العينة في الفيديو ولقطات الشاشة: S2_3x3_CH2.czi من بيانات عينات czitools (Sebastian Rhode / ZEISS، GPL-3.0)، مشهدان من فسيفساء 3 × 3 مع DAPI وEGFP. لا توجد بيانات عملاء.
| الأداة | التكلفة | المنصات | الاستخدام الأمثل |
|---|---|---|---|
| ZEISS ZEN lite | مجاني (يتطلب ZEISS ID للتنزيل) | Windows | العارض الرسمي من الشركة المصنّعة، والأقرب إلى برنامج التقاط الصور |
| Fiji / ImageJ مع Bio-Formats | مجاني، مفتوح المصدر | Windows، macOS، Linux | التحليل باستخدام الإضافات ووحدات الماكرو؛ يُستورد كل مشهد كسلسلة مستقلة |
| QuPath | مجاني، مفتوح المصدر | Windows، macOS، Linux | مشاريع تحليل صور الشرائح الكاملة وكتابة السكربتات |
| SlideScope | عينات مجانية مع جميع الأدوات، وتجربة مجانية لمدة 3 أيام لصورك الخاصة، ثم اشتراك يبدأ من $25 شهريًا | Windows 10+، macOS 14+ (Apple silicon وIntel) | عرض ملفات CZI وقياسها والتعليق عليها إلى جانب CZI وND2 وSVS وNDPI وMRXS وDICOM وTIFF، مع بقاء الملفات على جهازك |
يمكنك فتح ملفات ZEISS CZI باستخدام ZEN lite، العارض المجاني من ZEISS لنظام Windows؛ أو باستخدام Fiji أو QuPath، وهما مجانيان ويقرآن ملفات CZI عبر Bio-Formats على Windows وMac وLinux؛ أو باستخدام SlideScope، وهو عارض لسطح المكتب لنظامي Windows وMac مع تجربة مجانية. على أجهزة Mac بمعالجات Apple silicon، لا يستطيع Bio-Formats قراءة ملفات CZI المضغوطة بتنسيق JPEG-XR. تستخدم الخطوات أدناه SlideScope.
المصدر: مقارنة برامج عرض صور الشرائح الكاملة (المنصات والأسعار، مع رابط إلى مصدر كل منها) (بالإنجليزية).
انظر أيضًا: ZEISS ZEN lite: من أين تنزّله، ومسألة Mac، والبدائل (بالإنجليزية).
تذكر وثائق QuPath أن Bio-Formats لا يدعم حاليًا ضغط JPEG-XR على Apple silicon، وكثير من ملفات CZI مضغوطة بتنسيق JPEG-XR. والحلول البديلة التي تقترحها هي تحويل الملف على جهاز كمبيوتر آخر أو التبديل إلى إصدار Intel من QuPath. لا يستخدم SlideScope مكتبة Bio-Formats لملفات CZI: فهو يقرأ CZI بمفكك ترميز JPEG XR مدمج خاص به في إصداري Windows وMac كليهما.
قيّم SlideScope عندما تحتاج إلى برنامج سطح مكتب واحد يفتح ملفات مجهرية من صيغ متعددة ويقيس الكائنات المعتادة على جهازك أنت. استخدم الأداة الأصلية عند الحاجة إلى التحكم بالمجهر أو معالجة قابلة للبرمجة أو مسارات تحليل مكتوبة برمجياً أو إدارة مؤسسية للصور.
Fiji/ImageJ وQuPath وnapari: المعالجة القابلة للتوسعة ووحدات الماكرو والإضافات والبرمجة والتقسيم وتحليل علم الأمراض وسير عمل Python العلمي.
OMERO: مستودعات الصور المركزية والصلاحيات والتعاون وإدارة البيانات المؤسسية.
نعم. ZEN lite (Windows) وFiji أو QuPath مع Bio-Formats مجانية. تنزيل SlideScope مجاني، ومكتبة العينات المدمجة مجانية مع جميع الأدوات، أما صورك الخاصة فتفتحها مع تجربة مجانية لمدة 3 أيام (يلزم PayPal أو بطاقة)؛ وبعد انتهاء التجربة يصبح اشتراكًا مدفوعًا.
استخدم macOS 14 أو أحدث. اختر تنزيل Apple Silicon أو Intel المناسب لجهاز Mac وانسخ الملف إلى التخزين المحلي قبل فتحه.
تأكد من اكتمال نسخ الملف. إذا استمر الخطأ، تواصل مع الدعم مع ذكر إصدار التطبيق وتنسيق الملف ورسالة الخطأ للمساعدة في فحص المشكلة.
للمختبرات البحثية ومرافق المجهر والمدرسين والطلاب وفرق مراجعة صور علم الأمراض.
اقرأ التوثيق الأصلي للتنسيق.
SlideScope منتج مستقل ولا يتبع Leica Biosystems أو ZEISS أو Nikon أو ImageJ أو Fiji أو QuPath أو napari أو OMERO. تُستخدم الأسماء للمقارنة الواقعية فقط.
استكشف الشرائح الكاملة وقنوات التألق الفلوري ومكدسات الصور في مساحة عمل واحدة تركز على مهامك، على Windows وmacOS.
لديك ملف لا يُفتح أو صيغة غير مدرجة في القائمة؟ الإبلاغ عن ملف أو صيغة