Experiments · mulai SlideScope 1.22.0

Bandingkan Perlakuan di Seluruh Eksperimen Mikroskopi

Susun satu folder citra menjadi perlakuan, sampel, dan replikat. Jalankan satu resep penghitungan atau skor IHC pada setiap citra, lalu bandingkan perlakuan dengan dot plot, rerata ± SD, dan uji statistik yang tepat, dengan n dihitung sebagai jumlah sampel, bukan citra atau sel. Citra pencilan dan replikat yang tidak sejalan masuk ke antrean tinjauan, dan setiap tabel, plot, dan paragraf Methods dapat diekspor untuk makalah Anda.

Unduh SlideScope Lihat paket

Perlakuan, sampel, dan replikat Satu resep untuk setiap citra n = sampel, bukan citra

Mengapa membandingkan perlakuan secara manual sering keliru

Pengaturan berbeda di setiap citra

Menghitung setiap citra secara terpisah membuka peluang perubahan kecil pada threshold atau region dari satu citra ke citra berikutnya, sehingga perbedaan antarperlakuan bisa berasal dari pengaturan, bukan dari biologinya.

n yang membengkak

Memperlakukan setiap citra, atau setiap sel, sebagai pengamatan independen membuat n jauh lebih besar daripada jumlah hewan atau kultur, dan nilai p tampak lebih meyakinkan daripada yang sebenarnya didukung eksperimen.

Pencilan yang tidak pernah diperiksa

Satu bidang yang tidak fokus atau lipatan pada jaringan dapat menggeser hasil seluruh sampel. Dalam lembar sebar berisi angka, tidak ada yang mengarahkan Anda kembali ke citra penyebabnya.

Cara kerja eksperimen di SlideScope

Buka folder di SlideScope. Folder terbuka sebagai dataset yang memuat setiap citra di dalamnya, dalam format apa pun yang dapat dibaca SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, OME-TIFF, LIF, dan lainnya.
Susun menjadi eksperimen. Beri setiap citra perlakuan, sampel, dan replikat, dengan mengimpor lembar sampel atau menerima saran dari nama berkas. Kecualikan citra dengan menyertakan alasan: citra itu tetap tercatat dan dapat dikembalikan. Eksperimen disimpan sebagai berkas kecil di samping citra Anda, sehingga ikut berpindah bersama foldernya.
Jalankan satu resep pada setiap citra (Plus). Pengaturan Quantify yang sama menghitung inti sel, sel, atau partikel dan memberi skor DAB pada setiap citra, sehingga setiap angka dihasilkan dengan cara yang sama.
Bandingkan perlakuan (Plus). Pilih satu pengukuran, lalu SlideScope memplot satu titik per sampel, dengan rerata dan SD setiap perlakuan, dan menjalankan uji yang sesuai.
Tinjau dan ekspor. Buka citra yang ditandai dari antrean tinjauan, koreksi kelas objek atau grade IHC-nya, lalu ekspor tabel citra, sampel, dan kelompok, plotnya, serta paragraf Methods.

Dataset yang disusun menjadi perlakuan vehicle dan obat, dengan sampel dan replikat untuk setiap citra serta tombol Run recipe dan Compare — Folder yang disusun sebagai eksperimen: 2 perlakuan, 6 sampel, 13 citra. Data contoh: potongan IHC BrdU dari EPFL (CC BY 4.0), dengan nama perlakuan dan sampel yang dibuat untuk demonstrasi.

Statistiknya, dan mengapa n adalah jumlah sampel

Citra dan sel dari hewan, pasien, atau kultur yang sama tidak independen. SlideScope terlebih dahulu merata-ratakan citra setiap sampel, lalu menjalankan uji pada satu nilai per sampel, sehingga n adalah jumlah replikat biologis yang benar-benar Anda miliki.

Perlakuan	Uji yang dijalankan SlideScope	Ditampilkan bersama
Dua	Uji t Welch (tanpa asumsi varians sama) dan Mann-Whitney U (berbasis peringkat)	Dot plot setiap sampel, rerata ± SD, n per perlakuan
Tiga atau lebih	ANOVA satu arah dan Kruskal-Wallis H (berbasis peringkat)	Plot dan tabel yang sama untuk setiap perlakuan

Anda dapat membandingkan nilai apa pun yang dihasilkan resep untuk setiap citra: jumlah objek, kepadatan per mm², persen positif, H-score, skor Allred, rerata luas objek, atau rerata intensitas per kanal.

Dot plot persen inti sel positif per sampel untuk vehicle dan obat, n = 3 masing-masing, dengan hasil uji t Welch dan Mann-Whitney serta peringatan pencilan — Compare di SlideScope 1.22: satu titik per sampel, rerata dan SD setiap perlakuan, kedua uji, dan peringatan tentang citra yang jauh menyimpang dari citra lain dalam sampelnya. Data contoh, seperti di atas.

Pemeriksaan sebelum Anda memercayai sebuah perbedaan

Citra pencilan: citra yang jauh menyimpang dari citra lain dalam sampelnya (robust z di atas 3,5) ditandai dan masuk ke antrean tinjauan.
Replikat yang tidak sejalan: perlakuan yang sampel-sampelnya sangat bervariasi (koefisien variasi di atas 0,5) ditandai.
Sampel terlalu sedikit: perlakuan dengan kurang dari tiga sampel ditandai, karena tidak ada uji yang dapat menyimpulkan banyak darinya.
Kualitas citra: hasil dengan objek terlalu sedikit, piksel terpotong (clipped), atau slide berkualitas buruk ditandai oleh pemeriksaan yang sama dengan yang digunakan Quantify pada satu citra.
Koreksi tercatat: objek yang Anda klasifikasikan ulang atau grade-nya Anda ubah, serta citra yang Anda kecualikan dengan alasan, dituliskan ke dalam teks Methods yang diekspor.

Yang tidak dilakukannya

Fitur ini tidak menjalankan uji post-hoc berpasangan setelah ANOVA, model campuran, atau perhitungan power. Ekspor tabel sampel ke Prism, R, atau Python untuk keperluan tersebut.
Fitur ini membandingkan nilai yang dihasilkan satu resep; fitur ini tidak memilihkan resep atau pengukurannya untuk Anda.
Ask Your Slide menjawab pertanyaan tentang citra yang sedang terbuka. Fitur ini belum menjawab pertanyaan tentang seluruh eksperimen.
Fitur ini untuk riset. Ini bukan sistem diagnostik, dan perbedaan yang signifikan secara statistik bukanlah temuan klinis.

Pertanyaan tentang analisis eksperimen

Bagaimana cara membandingkan kelompok perlakuan pada citra mikroskopi?

Buka folder di SlideScope dan susun citranya menjadi eksperimen: perlakuan, sampel, dan replikat, dari lembar sampel atau dari saran berdasarkan nama berkas. Dengan SlideScope Plus, jalankan satu resep Quantify pada setiap citra, lalu pilih Compare: SlideScope merata-ratakan citra setiap sampel, memplot satu titik per sampel dengan rerata dan SD setiap perlakuan, dan menjalankan uji t Welch dan Mann-Whitney untuk dua perlakuan, atau ANOVA dan Kruskal-Wallis untuk lebih dari dua.

Mengapa n adalah jumlah sampel, bukan jumlah citra atau sel?

Citra dan sel dari hewan, pasien, atau kultur yang sama tidak independen, sehingga menghitungnya sebagai pengamatan terpisah akan membengkakkan n dan membuat perbedaan tampak lebih pasti daripada kenyataannya. SlideScope terlebih dahulu merata-ratakan citra setiap sampel dan menjalankan uji pada satu nilai per sampel.

Pengukuran apa saja yang dapat saya bandingkan?

Nilai apa pun yang dihasilkan resep Quantify untuk setiap citra: jumlah objek, kepadatan per mm², persen positif, H-score, skor Allred, rerata luas objek, dan rerata intensitas per kanal.

Apakah analisis eksperimen termasuk dalam setiap paket?

Menyusun citra menjadi eksperimen termasuk dalam setiap paket. Menjalankan satu resep di seluruh eksperimen, membandingkan perlakuan, dan meninjau hasil proses tersebut memerlukan SlideScope Plus. Quantify sendiri, pada satu citra atau satu folder, tersedia di setiap paket.

Apakah SlideScope menggantikan paket perangkat lunak statistik?

Tidak. SlideScope menjalankan uji standar dua kelompok dan multikelompok pada satu nilai per sampel dan melaporkannya bersama data yang mendasarinya. SlideScope tidak menjalankan uji post-hoc berpasangan setelah ANOVA, model campuran, atau perhitungan power; ekspor tabel sampel ke Prism, R, atau Python untuk keperluan tersebut.

Jawaban cepat

Paling cocok untuk: kelompok riset yang membandingkan perlakuan, genotipe, atau titik waktu pada banyak citra potongan jaringan terwarnai, kultur, atau organoid, dan ingin setiap citra dihitung dengan cara yang sama serta n dilaporkan dengan benar.

Keunggulan utama: satu resep untuk setiap citra, sampel sebagai unit statistik, pemeriksaan pencilan dan replikat dengan antrean tinjauan, serta ekspor lengkap dengan paragraf Methods.

Keterbatasan penting: hanya uji standar dua kelompok dan multikelompok; tanpa statistik post-hoc atau model campuran.

Terakhir ditinjau: 11 November 2026.

Hitung seluruh eksperimen dengan cara yang sama

Unduh SlideScope, coba Quantify pada pustaka sampel gratis, lalu jalankan eksperimen Anda dengan SlideScope Plus.

Unduh SlideScope