Hitung Sel dan Beri Skor IHC dengan Bertanya kepada Slide Anda
Ketik pertanyaan tentang citra yang sedang Anda buka, misalnya “Berapa persen inti sel yang Ki67-positif di region ini?” Asisten AI merencanakan langkah-langkahnya, dan SlideScope menjalankan alat penghitungan, skor IHC, dan pengukurannya sendiri di komputer Anda. Setiap angka dalam jawaban berasal dari salah satu alat tersebut, lengkap dengan bukti untuk memeriksanya dan tombol yang menjalankan ulang langkah-langkahnya tanpa AI. Hanya untuk penggunaan riset.
Setiap angka berasal dari alat lokalMode No images: citra tetap di komputer AndaBukti, jalankan ulang, dan ekspor
Cara kerja Ask Your Slide
Buka citra di SlideScope pada Windows atau macOS: whole slide, tumpukan konfokal, citra fluoresens, atau format lain yang dapat dibuka SlideScope.
Bertanyalah dengan bahasa sehari-hari. Gambar sebuah region atau perbesar ke bidang yang dimaksud terlebih dahulu jika pertanyaannya tentang satu area. Jawaban dapat diberikan dalam salah satu dari 14 bahasa.
AI merencanakan; alat lokal yang bekerja. Asisten memilih langkah-langkahnya (menghitung inti sel, memberi skor DAB, mengukur region, menemukan hotspot), dan SlideScope menjalankan setiap langkah di komputer Anda. Anda melihat setiap tindakan pada citra, dan setiap tindakan dapat dibatalkan.
Baca jawaban beserta buktinya. Jawaban merujuk tampilan persis yang digunakannya sebagai [R1], [R2], dan seterusnya: klik salah satunya untuk kembali ke tampilan tersebut. Evidence mencantumkan setiap langkah dengan luas areanya dalam piksel, plane, parameter, dan hasilnya, dan jawaban menunjukkan apa saja yang dikirim.
Periksa, jalankan ulang, dan ekspor. Re-run without AI menghitung ulang langkah-langkah yang sama secara lokal dan memeriksa bahwa angkanya identik. Ekspor jawaban, catatan analisis, dan paragraf Methods, atau buat gambar dengan skala batang.
Tonton demo 62 detik yang direkam di SlideScope 1.23 pada citra sampel publik (IHC BrdU dari EPFL, CC BY 4.0; DAPI/GFP dari czitools). Tanpa suara.
Pertanyaan yang dapat Anda ajukan, dan alat yang menjawabnya
Ask Your Slide bekerja dengan alat SlideScope sendiri: penghitungan inti sel, sel, atau partikel (segmentasi deep learning InstanSeg atau metode klasik), skor IHC untuk DAB, statistik region, pengukuran terkalibrasi, statistik saturasi kanal, pencari hotspot, garis batas region, catatan, dan kontrol tampilan. Beberapa contoh:
Anda bertanya
Alat yang dijalankan SlideScope
Yang Anda dapatkan
“Berapa persen inti sel yang Ki67-positif di region ini?”
Hitung inti sel (InstanSeg), lalu skor IHC untuk DAB
Persen positif beserta jumlah inti sel yang dihitung, dan garis batas pada citra
“Berikan H-score dan skor Allred untuk area yang saya tandai.”
Hitung inti sel, skor IHC dengan definisi yang kompatibel dengan QuPath
H-score, skor Allred, dan persen positif untuk region tersebut
“Temukan tiga area terpadat dan beri skor Ki67 di masing-masing.”
Pencari hotspot, garis batas region, hitung dan beri skor per region
Tiga hotspot bergaris batas dengan kepadatan per mm², z-score, dan persen Ki67 untuk masing-masing
“Berapa banyak sel di bidang ini, dan seberapa besar ukurannya?”
Hitung sel (InstanSeg atau klasik)
Jumlah dan luas objek, dapat diekspor sebagai CSV dan GeoJSON
“Bandingkan kepadatan DAPI di kedua region ini.”
Statistik region dan jumlah inti sel untuk setiap region
Luas, jumlah, dan kepadatan per mm² berdampingan
“Kanal mana yang paling terang di sini, dan apakah ada yang tersaturasi?”
Statistik region, statistik saturasi kanal
Rerata intensitas per kanal dan fraksi tersaturasi masing-masing
“Bawa saya ke area GFP yang paling terang.”
Pencari hotspot pada kanal GFP, lalu pindahkan tampilan
Tampilan diperbesar ke area tersebut, dengan region diberi garis batas
“Berapa luas region ini dalam µm², dan berapa bagiannya yang DAB-positif?”
Pengukuran terkalibrasi, statistik region
Luas dalam µm² dan persen area DAB-positif
“Pindah ke Z-plane 12 dan hitung inti selnya.”
Pindahkan tampilan (Z), hitung inti sel
Jumlah pada plane tersebut, dengan plane dicatat dalam bukti
“Tambahkan catatan berisi angka-angka ini.”
Tambahkan catatan
Catatan pada slide yang tetap melekat pada citra
Saat ini Ask Your Slide menjawab pertanyaan tentang citra yang sedang terbuka. Untuk membandingkan perlakuan di banyak citra, gunakan Experiments di SlideScope Plus: satu resep penghitungan pada setiap citra, dibandingkan dengan uji statistik yang tepat. Bertanya tentang seluruh eksperimen direncanakan untuk masa mendatang.
Setiap angka berasal dari sebuah alat
Model AI umum tidak dibuat untuk menghitung objek dengan melihat gambar (Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024), sehingga Ask Your Slide tidak pernah membiarkan model menaksir sebuah angka. Asisten hanya memutuskan alat mana yang dijalankan; setiap hitungan, skor, luas, dan intensitas dalam jawaban dihitung oleh SlideScope di komputer Anda, dan Anda dapat memeriksa masing-masing:
Rujukan ke tampilan. Setiap pernyataan menunjuk ke tampilan asalnya ([R1], [R2]). Klik rujukan itu dan SlideScope kembali ke posisi, perbesaran, dan plane yang persis sama.
Bukti (Evidence). Setiap langkah, dengan luas area yang dianalisis dalam piksel, plane, parameter yang digunakan, dan hasilnya.
Re-run without AI. Menghitung ulang langkah-langkah yang tercatat secara lokal, tanpa melibatkan AI, dan memeriksa bahwa angkanya keluar identik.
Apa yang dikirim. Jawaban menunjukkan dengan tepat apa yang keluar dari komputer Anda untuk pertanyaan tersebut.
Terlihat dan dapat dibatalkan. Garis batas, catatan, dan perubahan tampilan muncul pada citra saat terjadi, dan setiap perubahan dapat dibatalkan.
Jawaban nyata Ask Your Slide di SlideScope 1.23 untuk pertanyaan “Berapa % inti sel yang DAB-positif di sini?” (15,4%) pada potongan IHC BrdU dari duodenum tikus (EPFL, CC BY 4.0). Inti sel diberi garis batas menurut grade DAB-nya, jawaban merujuk tampilan yang digunakannya sebagai [R1], dan bukti menunjukkan langkah lokal yang menghasilkan setiap angka, dengan Re-run without AI, Export, dan Make figure.
Privat sejak dirancang: apa persisnya yang dikirim
Analisis berjalan di komputer Anda. Perencanaan langkah dan penulisan jawaban dilakukan oleh model AI cloud, dan sebuah sakelar di panel Ask Your Slide, Send view images, menentukan apakah model itu pernah melihat gambar.
Send view images
Yang dikirim ke AI cloud
Yang tidak pernah keluar dari komputer Anda
Nonaktif (“No images”)
Pertanyaan Anda, detail teknis terbatas (format, dimensi, kanal, ukuran piksel), dan angka yang dihitung oleh alat lokal
Citra dan berkasnya
Aktif
Sama seperti di atas, ditambah tampilan yang dilihat AI, masing-masing ditampilkan di layar Anda terlebih dahulu, dalam bentuk terkompresi
Berkas dan setiap bagian citra yang tidak dilihat AI
Pertanyaan dan citra Anda tidak digunakan untuk melatih model AI. Pemindaian medis seperti CT dan MRI ditolak. Penyedia AI dan ketentuan lengkapnya ada di pemberitahuan privasi, dan halaman penanganan data menjelaskan apa saja yang disimpan bagian lain SlideScope di komputer Anda.
Ekspor untuk buku catatan lab, gambar, dan Methods Anda
answer.md: jawaban beserta rujukannya, siap ditempel ke buku catatan lab.
analysis_record.json: catatan lengkap langkah, parameter, dan hasil, yaitu catatan yang sama yang digunakan Re-run without AI.
Teks Methods: paragraf yang menjelaskan apa yang diukur dan bagaimana caranya, untuk disesuaikan bagi naskah.
Keluaran Quantify: tabel objek sebagai CSV, garis batas sebagai GeoJSON (dapat dibuka di QuPath), mask, dan citra beranotasi.
Make figure: gambar dari tampilan dengan skala batang terkalibrasi.
Daftar periksa pelaporan dari komunitas QUAREP-LiMi meminta penulis melaporkan alur kerja analisis citra dan detail gambar seperti skala batang (Schmied et al., Nature Methods 2023). Catatan analisis dan teks Methods memberi Anda parameter yang perlu dilaporkan.
Seberapa akurat skor Ki67 dan IHC otomatis?
Memberi skor Ki67 secara visual sulit direproduksi, dan itulah alasan utama untuk membiarkan sebuah alat yang menghitung:
Ketika International Ki67 in Breast Cancer Working Group mengirimkan 30 kasus kanker payudara yang sama kepada 23 ahli patologi di 12 negara, kesepakatan (ICC) mencapai 0,87 dengan metode penghitungan global dan 0,83 dengan skor hot-spot, yang tidak memenuhi kriteria keberhasilan studi tersebut. Para pembaca tidak selalu memilih hot-spot yang sama pada satu slide (Leung et al., Histopathology 2019).
Enam ahli patologi payudara subspesialis yang memberi skor pada 57 slide Ki-67 hanya mencapai kesepakatan sedang pada cut-off 20% (koefisien 0,44 dan 0,48 dalam dua putaran), dan para penulis menyimpulkan bahwa analisis citra digital diperlukan untuk memperbaikinya (Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024).
Analisis citra digital lebih konsisten: empat algoritma QuPath yang dibangun secara independen oleh empat ahli patologi, mengikuti pedoman kelompok kerja tersebut, sepakat dengan algoritma referensi pada ICC 0,938 untuk 157 kanker payudara ER-positif (Boyaci et al., Biomolecules 2021).
Studi-studi ini menggambarkan skor Ki67 manual dan otomatis secara umum; studi tersebut tidak menguji SlideScope. Skor IHC SlideScope mengikuti definisi QuPath (cut-off densitas optik DAB 0,2, 0,4, dan 0,6 untuk 1+, 2+, dan 3+), dan kuantifikasi lokalnya telah diperiksa terhadap QuPath 0.7.0 pada slide yang sama. Pencari hotspot adalah perhitungan kepadatan objek dengan z-score, bukan penilaian subjektif, sehingga region dan pengaturan yang sama menghasilkan hotspot yang sama.
Cara memeriksa ulang sebuah jawaban
Lihat garis batas pada citra: inti sel yang terlewat, inti bertetangga yang menyatu, dan debris yang terwarnai langsung terlihat.
Klik [R1] untuk kembali ke tampilan yang persis sama, perbesar, lalu hitung satu bidang kecil secara manual dan bandingkan dengan angka yang dilaporkan.
Buka Evidence dan pastikan plane, luas region, dan parameternya sesuai dengan yang Anda maksud.
Periksa saturasi sebelum memercayai intensitas: tanyakan kanal mana yang tersaturasi di region yang sama.
Tekan Re-run without AI dan simpan catatan analisis bersama data Anda.
Ask Your Slide, chatbot umum, skrip, atau copilot enterprise
Ask Your Slide
Mengunggah citra ke chatbot umum
Menulis skrip QuPath atau Fiji
Copilot patologi enterprise
Asal angka-angkanya
Alat lokal SlideScope, dengan parameter ditampilkan
Model itu sendiri, atau kode yang ditulisnya selama percakapan
Skrip Anda, dijalankan oleh QuPath atau Fiji
Model milik vendor di platform vendor
Ke mana citra dikirim
Tetap di komputer Anda dalam mode No images; jika tidak, tampilan terkompresi yang Anda lihat terlebih dahulu
Diunggah ke server chatbot
Tetap di komputer Anda
Disimpan di platform vendor
Memeriksa dan mengulang hasil
Bukti per langkah; Re-run without AI memeriksa bahwa angkanya identik
Bertanya lagi bisa memberikan jawaban yang berbeda
Dapat diulang jika Anda menyimpan skrip dan versinya
Bergantung pada platformnya
Penyiapan
Pasang SlideScope lalu bertanya
Tidak ada, tetapi Anda harus terlebih dahulu mengekspor gambar yang dapat dibaca chatbot
Mempelajari API skrip dan men-debug kode, termasuk kode yang ditulis chatbot untuk Anda
Kontrak institusi dan proses deployment
Format whole slide dan mikroskop
CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, DICOM, dan sekitar 39 format
Biasanya hanya format gambar umum
Luas, melalui Bio-Formats dan OpenSlide
Format yang dapat diterima platform tersebut
Paling cocok untuk
Hitungan standar, skor IHC, dan angka per region tanpa kode, dengan catatan yang dapat ditunjukkan
Ask Your Slide bekerja pada citra yang dapat dibuka SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, whole slide image DICOM, dan total sekitar 39 format, mulai dari whole slide brightfield hingga fluoresens multikanal dengan Z, waktu, dan scene. Daftar lengkapnya ada di halaman kompatibilitas berkas. Jawaban tersedia dalam 14 bahasa, dan antarmuka aplikasi dalam 10 bahasa.
Siapa yang mendapatkan Ask Your Slide
Ask Your Slide merupakan bagian dari SlideScope mulai versi 1.23.0 di Windows dan macOS. Fitur ini termasuk dalam paket SlideScope berbayar, dalam batas penggunaan AI yang wajar; paket Plus memiliki batas lebih tinggi. Membandingkan perlakuan di seluruh eksperimen saat ini tersedia di SlideScope Plus, melalui Experiments; bertanya tentang seluruh eksperimen direncanakan untuk masa mendatang. Dengan akun SlideScope gratis, Anda dapat mencoba Ask Your Slide pada slide sampel gratis, tiga pertanyaan per hari; bertanya tentang citra Anda sendiri memerlukan langganan. Harga terkini ada di halaman paket.
Pertanyaan tentang Ask Your Slide
Bisakah ChatGPT menghitung sel pada citra mikroskopi?
Tidak secara andal jika dibiarkan sendiri. Chatbot umum menjawab berdasarkan gambar yang Anda unggah, atau dari kode yang ditulisnya dalam percakapan itu, sehingga metodenya dapat berubah dari satu percakapan ke percakapan berikutnya, dan tangkapan layar tidak membawa ukuran piksel. Sebuah presentasi lokakarya tahun 2024 tentang chatbot untuk analisis citra mencatat bahwa model bahasa tidak dibuat untuk menghitung objek pada citra. Ask Your Slide bekerja secara berbeda: AI hanya merencanakan langkah-langkahnya, alat penghitungan SlideScope sendiri menghasilkan setiap angka di komputer Anda, dan Re-run without AI menghitungnya ulang.
Apakah citra saya dikirim ke cloud?
Tidak, jika Send view images dimatikan (No images): citra tidak pernah keluar dari komputer Anda, dan hanya pertanyaan Anda, detail teknis terbatas (format, dimensi, kanal, ukuran piksel), dan angka hasil perhitungan yang dikirim ke AI cloud. Jika sakelar dinyalakan, tampilan yang dilihat AI juga dikirim dalam bentuk terkompresi, dan masing-masing ditampilkan di layar Anda terlebih dahulu. Data Anda tidak digunakan untuk melatih model AI.
Apakah Ask Your Slide alat diagnosis?
Bukan. Ask Your Slide hanya untuk penggunaan riset dan bukan diagnosis medis. Fitur ini menolak pemindaian medis seperti CT dan MRI, dan jawabannya melaporkan pengukuran, bukan diagnosis atau grade.
Seberapa akurat skor Ki67 otomatis dibandingkan skor manual?
Skor Ki67 manual bervariasi antarpembaca: dalam sebuah studi internasional, 23 ahli patologi mencapai ICC 0,87 dengan skor global dan 0,83 dengan skor hot-spot. Analisis citra digital lebih konsisten: empat algoritma QuPath yang dibangun secara independen sepakat dengan referensi pada ICC 0,938. Hitungan otomatis tetap perlu diperiksa, jadi lihat garis batasnya, bandingkan satu bidang kecil dengan hitungan manual, dan simpan catatan buktinya.
Apakah Ask Your Slide aplikasi skor Ki67 gratis?
Bukan. Ask Your Slide termasuk dalam paket SlideScope berbayar, dalam batas penggunaan AI yang wajar, dengan batas lebih tinggi di Plus. Dengan akun gratis, Anda dapat mengajukan tiga pertanyaan per hari tentang slide sampel bawaan, yang juga dilengkapi setiap alat lokal, dan harga terkini ada di halaman paket.
Bisakah saya menjalankan ulang atau mengekspor hasilnya?
Bisa. Re-run without AI menghitung ulang langkah-langkah yang tercatat di komputer Anda dan memeriksa bahwa angkanya identik. Export menyimpan answer.md, analysis_record.json, dan paragraf Methods, ditambah CSV objek, garis batas GeoJSON, mask, dan citra beranotasi, sedangkan Make figure menambahkan skala batang.
Pada format berkas apa saja fitur ini bekerja?
Format yang dapat dibuka SlideScope: CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, OME-TIFF, whole slide image DICOM, dan total sekitar 39 format. Pemindaian medis seperti CT dan MRI ditolak.
Apa bedanya dengan QuPath atau ImageJ?
QuPath dan ImageJ gratis, dapat diprogram dengan skrip, dan merupakan alat yang tepat untuk pipeline khusus dan classifier terlatih. Ask Your Slide ditujukan untuk pertanyaan standar (hitungan, persen positif, H-score, Allred, statistik region, hotspot) tanpa menulis skrip, langsung di penampil tempat citra sudah terbuka. Skor IHC-nya menggunakan definisi yang kompatibel dengan QuPath, dan garis batas GeoJSON-nya dapat dibuka di QuPath.
Apakah Ask Your Slide berfungsi secara offline?
Bertanya memerlukan koneksi internet, karena AI cloud yang merencanakan langkah-langkah dan menulis jawabannya. Penghitungan, pemberian skor, dan pengukurannya sendiri berjalan di komputer Anda.
Bisakah saya bertanya tentang seluruh eksperimen?
Belum dengan bertanya: Ask Your Slide menjawab pertanyaan tentang citra yang sedang terbuka. Untuk membandingkan perlakuan di banyak citra saat ini, gunakan Experiments di SlideScope Plus, yang menjalankan satu resep penghitungan pada setiap citra dan membandingkan perlakuan dengan uji statistik yang tepat. Mengajukan pertanyaan tentang seluruh eksperimen direncanakan untuk Plus di masa mendatang.
Paling cocok untuk: peneliti, fasilitas inti, dan mahasiswa yang memerlukan hitungan standar, skor Ki67 atau IHC, dan pengukuran region dari citra mikroskopi dan slide tanpa menulis skrip, dengan catatan yang dapat ditunjukkan.
Keunggulan utama: setiap angka berasal dari alat lokal, rujukan kembali ke tampilan yang persis, Re-run without AI, mode No images, ekspor untuk buku catatan lab dan Methods, sekitar 39 format, dan jawaban dalam 14 bahasa.
Keterbatasan penting: hanya untuk penggunaan riset, bukan diagnosis; fitur ini menjawab tentang citra yang sedang terbuka, dan bertanya memerlukan koneksi internet.
Terakhir ditinjau: 6 November 2026.
Bertanyalah kepada slide Anda sendiri
Unduh SlideScope, jelajahi pustaka sampel gratis, lalu berlangganan (PayPal atau kartu, ditagih saat Anda berlangganan, batalkan kapan saja dari akun Anda) untuk menggunakan Ask Your Slide pada citra Anda sendiri mulai versi 1.23.0.