為什麼手動比較處理組容易出錯
每張影像的設定不同
逐張分開計數時，閾值或區域很容易在影像之間出現細微差異，於是處理組之間的差異可能來自設定，而不是生物學本身。
虛增的 n
將每張影像、甚至每個細胞都視為獨立觀測值，會讓 n 遠大於動物或培養物的實際數量，p 值看起來也會比實驗所能支持的更有說服力。
沒人檢查過的離群值
一個失焦的視野或一處組織皺褶，就可能讓整個樣本的數值偏移。在滿是數字的試算表中，沒有任何線索能帶您回到造成問題的那張影像。
實驗功能 · SlideScope 1.22.0 起提供
在整個顯微影像實驗中比較不同處理
將一個資料夾中的影像依處理組、樣本與重複整理好。對每張影像執行同一個計數或 IHC 評分配方，再以點圖、平均值 ± SD 與適當的統計檢定比較各處理組，n 以樣本計算，而非影像或細胞。離群影像與不一致的重複會進入審閱佇列，每份表格、圖表與方法段落都能匯出用於論文。
處理組、樣本與重複
每張影像使用同一個配方
n = 樣本數，而非影像數
在 SlideScope 中如何進行實驗分析
- 在 SlideScope 中開啟資料夾。它會以資料集的形式開啟，包含其中的每張影像，只要是 SlideScope 能讀取的格式皆可：CZI、ND2、SVS、NDPI、OME-TIFF、LIF 等。
- 將其整理為實驗。為每張影像指定處理組、樣本與重複，可以匯入樣本表，也可以接受依檔名產生的建議。排除影像時需註明原因：它會保留在紀錄中，之後也能重新納入。實驗是放在影像旁的一個小檔案，因此會隨資料夾一起移動。
- 對每張影像執行同一個配方（Plus）。相同的 Quantify 設定會在每張影像上計數細胞核、細胞或顆粒並進行 DAB 評分，因此每個數字都以相同方式產生。
- 比較處理組（Plus）。選擇一項量測值，SlideScope 會為每個樣本繪製一個點，標出每個處理組的平均值與 SD，並執行相應的檢定。
- 審閱與匯出。從審閱佇列開啟任何被標記的影像，修正物件的類別或 IHC 分級，再匯出影像、樣本與組別表格、圖表以及方法段落。
統計方法，以及 n 為何是樣本數
來自同一隻動物、同一位病人或同一份培養物的影像與細胞並不互相獨立。SlideScope 會先將每個樣本的影像取平均，再以每個樣本一個數值進行檢定，因此 n 就是您實際擁有的生物重複數。
| 處理組數 | SlideScope 執行的檢定 | 同時呈現 |
|---|---|---|
| 兩組 | Welch t 檢定（不假設變異數相等）與 Mann-Whitney U 檢定（以等級為基礎） | 每個樣本的點圖、平均值 ± SD、各處理組的 n |
| 三組以上 | 單因子變異數分析（ANOVA）與 Kruskal-Wallis H 檢定（以等級為基礎） | 每個處理組都有同樣的圖與表 |
您可以比較配方為每張影像產生的任何數值：物件數、每 mm² 密度、陽性百分比、H-score、Allred 分數、平均物件面積，或各通道的平均強度。
採信差異之前的檢查
- 離群影像：與同一樣本中其他影像相差甚遠的影像（穩健 z 值大於 3.5）會被標記，並進入審閱佇列。
- 不一致的重複：樣本之間差異很大（變異係數大於 0.5）的處理組會被標記。
- 樣本太少：樣本少於三個的處理組會被標記，因為任何檢定都無法據此說明太多。
- 影像品質：物件太少、像素截斷或玻片品質不佳的結果，會由 Quantify 用於單張影像的同一套檢查標記出來。
- 修正都有紀錄：您重新分類或重新分級的物件，以及註明原因後排除的影像，都會寫進匯出的方法說明。
它不做什麼
- 它不會在 ANOVA 之後執行兩兩比較的事後檢定，也不做混合模型或檢定力分析。如需這些分析，請將樣本表匯出至 Prism、R 或 Python。
- 它比較的是同一個配方產生的數值；它不會替您選擇配方或量測項目。
- Ask Your Slide 回答關於目前開啟影像的問題，目前還無法回答關於整個實驗的問題。
- 它僅供研究使用，並非診斷系統；統計上的顯著差異也不等於臨床發現。
關於實驗分析的常見問題
如何比較顯微影像中的不同處理組？
在 SlideScope 中開啟資料夾，並將其中的影像整理為實驗：處理組、樣本與重複，可透過樣本表或依檔名產生的建議完成。使用 SlideScope Plus，對每張影像執行同一個 Quantify 配方，再選擇「比較」：SlideScope 會將每個樣本的影像取平均，為每個樣本繪製一個點，標出各處理組的平均值與 SD；兩個處理組時執行 Welch t 檢定與 Mann-Whitney 檢定，更多處理組時執行 ANOVA 與 Kruskal-Wallis 檢定。
為什麼 n 是樣本數，而不是影像數或細胞數？
來自同一隻動物、同一位病人或同一份培養物的影像與細胞並不互相獨立，把它們當成獨立觀測值會使 n 虛增，讓差異看起來比實際更確定。SlideScope 會先將每個樣本的影像取平均，再以每個樣本一個數值進行檢定。
我可以比較哪些量測值？
Quantify 配方為每張影像產生的任何數值：物件數、每 mm² 密度、陽性百分比、H-score、Allred 分數、平均物件面積與各通道平均強度。
所有方案都包含實驗分析嗎？
所有方案都能將影像整理為實驗。對整個實驗執行同一個配方、比較處理組與審閱執行結果，則需要 SlideScope Plus。Quantify 本身（不論用於單張影像或資料夾）在所有方案中都能使用。
SlideScope 能取代統計軟體嗎？
不能。它以每個樣本一個數值執行標準的兩組與多組檢定，並連同背後的資料一起呈現結果。它不會在 ANOVA 之後執行兩兩比較的事後檢定，也不做混合模型或檢定力分析；如需這些分析，請將樣本表匯出至 Prism、R 或 Python。
快速解答
最適合：需要在大量染色切片、培養物或類器官影像中比較不同處理、基因型或時間點，並希望每張影像都以相同方式計數、n 正確呈報的研究團隊。
主要優勢：每張影像使用同一個配方、以樣本作為統計單位、搭配審閱佇列的離群值與重複檢查，以及附方法段落的匯出。
重要限制：僅提供標準的兩組與多組檢定；不提供事後檢定或混合模型統計。
最後審閱：2026 年 11 月 11 日。
以相同方式計數整個實驗
下載 SlideScope，在免費範例庫上試用 Quantify，再以 SlideScope Plus 執行您的實驗。