为什么手动比较处理组容易出错
每张图像的设置不同
逐张单独计数时，阈值或区域很容易在图像之间发生细微变化，于是处理组之间的差异可能来自设置，而不是生物学本身。
被夸大的 n
把每张图像甚至每个细胞都当作独立观测，会让 n 远大于动物或培养物的实际数量，p 值看起来也会比实验所能支持的更有说服力。
无人查看的离群值
一个失焦视野或一处组织褶皱就可能让整个样本的数值偏移。在一张满是数字的电子表格里，没有任何线索能把您引回导致问题的那张图像。
实验功能 · SlideScope 1.22.0 起提供
在整个显微镜实验中比较不同处理
将一个文件夹中的图像按处理组、样本和重复整理好。对每张图像运行同一个计数或 IHC 评分配方，然后用点图、均值 ± SD 和合适的统计检验比较各处理组，其中 n 按样本计，而不是按图像或细胞计。离群图像和不一致的重复会进入审阅队列，所有表格、图表和方法段落都可以导出用于论文。
处理组、样本和重复
每张图像使用同一个配方
n = 样本数，而非图像数
在 SlideScope 中如何进行实验分析
- 在 SlideScope 中打开文件夹。它会以数据集的形式打开，包含其中的每张图像，只要是 SlideScope 能读取的格式均可：CZI、ND2、SVS、NDPI、OME-TIFF、LIF 等。
- 将其整理为实验。为每张图像指定处理组、样本和重复，可以导入样本表，也可以接受根据文件名给出的建议。排除某张图像时需注明原因：它会保留在记录中，之后也可以恢复。实验是图像旁边的一个小文件，因此会随文件夹一起移动。
- 对每张图像运行同一个配方（Plus）。相同的 Quantify 设置会在每张图像上计数细胞核、细胞或颗粒并进行 DAB 评分，因此每个数字都是以相同方式得出的。
- 比较处理组（Plus）。选择一项测量值，SlideScope 会为每个样本绘制一个点，标出每个处理组的均值和 SD，并运行相应的检验。
- 审阅和导出。从审阅队列打开任意一张被标记的图像，修正对象的类别或 IHC 分级，然后导出图像、样本和组别表格、图表以及方法段落。
统计方法，以及为什么 n 是样本数
来自同一动物、患者或培养物的图像和细胞并不相互独立。SlideScope 会先对每个样本的图像取平均，再以每个样本一个数值进行检验，因此 n 就是您实际拥有的生物学重复数量。
| 处理组数 | SlideScope 运行的检验 | 同时显示 |
|---|---|---|
| 两个 | Welch t 检验（不假设方差相等）和 Mann-Whitney U 检验（基于秩次） | 每个样本的点图、均值 ± SD、每个处理组的 n |
| 三个或更多 | 单因素方差分析（ANOVA）和 Kruskal-Wallis H 检验（基于秩次） | 每个处理组都有同样的图和表 |
您可以比较配方为每张图像得出的任何数值：对象计数、每 mm² 密度、阳性百分比、H-score、Allred 评分、平均对象面积或各通道的平均强度。
在相信差异之前要做的检查
- 离群图像：与同一样本中其他图像相差甚远的图像（稳健 z 值大于 3.5）会被标记并进入审阅队列。
- 不一致的重复：样本之间差异很大（变异系数大于 0.5）的处理组会被标记。
- 样本过少：样本少于三个的处理组会被标记，因为任何检验都无法据此得出有意义的结论。
- 图像质量：对象过少、像素被截断或切片质量较差的结果，会被 Quantify 在单张图像上使用的同一套检查标记出来。
- 修正均有记录：您重新分类或重新分级的对象，以及注明原因后排除的图像，都会写入导出的方法文本。
它不能做什么
- 它不会在 ANOVA 之后进行两两事后检验，也不做混合模型或功效分析。如需这些分析，请将样本表导出到 Prism、R 或 Python。
- 它比较的是同一个配方得出的数值；它不会替您选择配方或测量指标。
- Ask Your Slide 回答关于当前打开图像的问题，目前还不能回答关于整个实验的问题。
- 它面向科研用途，不是诊断系统；统计学上的显著差异也不等于临床发现。
关于实验分析的常见问题
如何比较显微镜图像中的不同处理组？
在 SlideScope 中打开文件夹，并将其中的图像整理为实验：处理组、样本和重复，可通过样本表或根据文件名给出的建议完成。使用 SlideScope Plus，对每张图像运行同一个 Quantify 配方，然后选择“比较”：SlideScope 会对每个样本的图像取平均，为每个样本绘制一个点，标出每个处理组的均值和 SD；两个处理组时运行 Welch t 检验和 Mann-Whitney 检验，更多处理组时运行 ANOVA 和 Kruskal-Wallis 检验。
为什么 n 是样本数，而不是图像数或细胞数？
来自同一动物、患者或培养物的图像和细胞并不相互独立，把它们当作独立观测会夸大 n，使差异看起来比实际更确定。SlideScope 会先对每个样本的图像取平均，再以每个样本一个数值进行检验。
我可以比较哪些测量值？
Quantify 配方为每张图像得出的任何数值：对象计数、每 mm² 密度、阳性百分比、H-score、Allred 评分、平均对象面积和各通道平均强度。
所有方案都包含实验分析吗？
所有方案都可以将图像整理为实验。在整个实验上运行同一个配方、比较处理组以及审阅运行结果需要 SlideScope Plus。Quantify 本身（无论用于单张图像还是文件夹）在所有方案中均可使用。
SlideScope 能取代统计软件吗？
不能。它以每个样本一个数值运行标准的两组和多组检验，并连同背后的数据一起报告结果。它不进行 ANOVA 之后的两两事后检验、混合模型或功效分析；如需这些分析，请将样本表导出到 Prism、R 或 Python。
快速解答
最适合：需要在大量染色切片、培养物或类器官图像中比较不同处理、基因型或时间点，并希望每张图像都以相同方式计数、n 报告正确的研究团队。
主要优势：每张图像使用同一个配方，以样本作为统计单位，带审阅队列的离群值和重复检查，以及附方法段落的导出。
重要限制：仅提供标准的两组和多组检验；不提供事后检验或混合模型统计。
最后审阅：2026 年 11 月 11 日。
以同样的方式计数整个实验
下载 SlideScope，在免费示例库上试用 Quantify，并使用 SlideScope Plus 运行您的实验。