Experiments · ตั้งแต่ SlideScope 1.22.0

เปรียบเทียบทรีตเมนต์ทั่วทั้งการทดลองด้วยกล้องจุลทรรศน์

จัดภาพในโฟลเดอร์เป็นทรีตเมนต์ ตัวอย่าง และรีพลิเคต รันสูตรการนับหรือการให้คะแนน IHC เดียวกันกับทุกภาพ แล้วเปรียบเทียบทรีตเมนต์ด้วยกราฟจุด (dot plot) ค่าเฉลี่ย ± SD และการทดสอบทางสถิติที่เหมาะสม โดยนับ n เป็นจำนวนตัวอย่าง ไม่ใช่จำนวนภาพหรือเซลล์ ภาพที่เป็นค่าผิดปกติและรีพลิเคตที่ไม่สอดคล้องกันจะเข้าสู่คิวตรวจทาน และทุกตาราง กราฟ และย่อหน้า Methods ส่งออกไปใช้ในบทความของคุณได้

ดาวน์โหลด SlideScope ดูแผน

ทรีตเมนต์ ตัวอย่าง และรีพลิเคต สูตรเดียวกันกับทุกภาพ n = ตัวอย่าง ไม่ใช่ภาพ

ทำไมการเปรียบเทียบทรีตเมนต์ด้วยมือจึงผิดพลาดได้ง่าย

การตั้งค่าที่ต่างกันในแต่ละภาพ

การนับแต่ละภาพแยกกันเปิดโอกาสให้ค่าขีดแบ่งหรือบริเวณเปลี่ยนไปเล็กน้อยจากภาพหนึ่งไปอีกภาพ และความแตกต่างระหว่างทรีตเมนต์อาจมาจากการตั้งค่าแทนที่จะมาจากชีววิทยา

n ที่สูงเกินจริง

การถือว่าทุกภาพหรือทุกเซลล์เป็นการสังเกตที่เป็นอิสระต่อกัน ทำให้ n มากกว่าจำนวนสัตว์ทดลองหรือชุดเพาะเลี้ยงไปมาก และค่า p ดูน่าเชื่อถือเกินกว่าที่การทดลองรองรับ

ค่าผิดปกติที่ไม่มีใครตรวจดู

ขอบเขตภาพที่หลุดโฟกัสเพียงภาพเดียวหรือรอยพับของเนื้อเยื่อ อาจทำให้ค่าของทั้งตัวอย่างเปลี่ยนไป และในสเปรดชีตที่มีแต่ตัวเลข ไม่มีอะไรชี้กลับไปยังภาพที่เป็นต้นเหตุ

การทดลองใน SlideScope ทำงานอย่างไร

เปิดโฟลเดอร์ใน SlideScope โฟลเดอร์จะเปิดเป็นชุดข้อมูลของทุกภาพข้างใน ในทุกรูปแบบที่ SlideScope อ่านได้: CZI, ND2, SVS, NDPI, OME-TIFF, LIF และอื่น ๆ
จัดเป็นการทดลอง กำหนดทรีตเมนต์ ตัวอย่าง และรีพลิเคตให้แต่ละภาพ โดยนำเข้าแผ่นข้อมูลตัวอย่าง (sample sheet) หรือยอมรับคำแนะนำจากชื่อไฟล์ คัดภาพออกได้พร้อมระบุเหตุผล โดยภาพนั้นยังคงอยู่ในบันทึกและนำกลับมาได้ การทดลองเป็นไฟล์ขนาดเล็กที่อยู่ข้างภาพของคุณ จึงย้ายไปพร้อมกับโฟลเดอร์
รันสูตรเดียวกันกับทุกภาพ (Plus) การตั้งค่า Quantify ชุดเดียวกันจะนับนิวเคลียส เซลล์ หรืออนุภาค และให้คะแนน DAB ในแต่ละภาพ ทุกตัวเลขจึงได้มาด้วยวิธีเดียวกัน
เปรียบเทียบทรีตเมนต์ (Plus) เลือกค่าการวัด แล้ว SlideScope จะพล็อตหนึ่งจุดต่อหนึ่งตัวอย่าง พร้อมค่าเฉลี่ยและ SD ของแต่ละทรีตเมนต์ และรันการทดสอบที่เหมาะสม
ตรวจทานและส่งออก เปิดภาพที่ถูกตั้งธงจากคิวตรวจทาน แก้ไขคลาสหรือเกรด IHC ของวัตถุ แล้วส่งออกตารางระดับภาพ ตัวอย่าง และกลุ่ม กราฟ และย่อหน้า Methods

ชุดข้อมูลที่จัดเป็นทรีตเมนต์ vehicle และยา พร้อมตัวอย่างและรีพลิเคตของแต่ละภาพ และปุ่ม Run recipe และ Compare — โฟลเดอร์ที่จัดเป็นการทดลอง: 2 ทรีตเมนต์ 6 ตัวอย่าง 13 ภาพ ข้อมูลสาธิต: ภาพครอป EPFL BrdU IHC (CC BY 4.0) โดยชื่อทรีตเมนต์และตัวอย่างตั้งขึ้นเพื่อการสาธิต

สถิติ และทำไม n จึงเป็นจำนวนตัวอย่าง

ภาพและเซลล์จากสัตว์ ผู้ป่วย หรือชุดเพาะเลี้ยงเดียวกันไม่ได้เป็นอิสระต่อกัน SlideScope จะเฉลี่ยภาพของแต่ละตัวอย่างก่อน แล้วรันการทดสอบกับค่าเดียวต่อหนึ่งตัวอย่าง n จึงเป็นจำนวนรีพลิเคตทางชีวภาพที่คุณมีจริง

ทรีตเมนต์	การทดสอบที่ SlideScope รัน	แสดงพร้อม
สอง	Welch's t-test (ไม่สมมติว่าความแปรปรวนเท่ากัน) และ Mann-Whitney U (อิงลำดับ)	กราฟจุดของทุกตัวอย่าง ค่าเฉลี่ย ± SD และ n ต่อทรีตเมนต์
สามขึ้นไป	One-way ANOVA และ Kruskal-Wallis H (อิงลำดับ)	กราฟและตารางแบบเดียวกันสำหรับทุกทรีตเมนต์

คุณเปรียบเทียบค่าใดก็ได้ที่สูตรสร้างขึ้นสำหรับทุกภาพ: จำนวนวัตถุ ความหนาแน่นต่อ mm² เปอร์เซ็นต์ที่ให้ผลบวก H-score, Allred score พื้นที่เฉลี่ยของวัตถุ หรือความเข้มเฉลี่ยของแต่ละช่องสัญญาณ

กราฟจุดของเปอร์เซ็นต์นิวเคลียสที่ให้ผลบวกต่อตัวอย่างสำหรับ vehicle และยา n = 3 ต่อกลุ่ม พร้อมผล Welch's t-test และ Mann-Whitney และคำเตือนค่าผิดปกติ — Compare ใน SlideScope 1.22: หนึ่งจุดต่อหนึ่งตัวอย่าง ค่าเฉลี่ยและ SD ของแต่ละทรีตเมนต์ ผลการทดสอบทั้งสองแบบ และคำเตือนเกี่ยวกับภาพที่ห่างจากภาพอื่นในตัวอย่างเดียวกันมาก ข้อมูลสาธิตเดียวกับข้างต้น

การตรวจสอบก่อนเชื่อความแตกต่าง

ภาพที่เป็นค่าผิดปกติ: ภาพที่ห่างจากภาพอื่นในตัวอย่างเดียวกันมาก (robust z สูงกว่า 3.5) จะถูกตั้งธงและเข้าสู่คิวตรวจทาน
รีพลิเคตที่ไม่สอดคล้องกัน: ทรีตเมนต์ที่ตัวอย่างแปรผันมาก (สัมประสิทธิ์ความแปรผันสูงกว่า 0.5) จะถูกตั้งธง
ตัวอย่างน้อยเกินไป: ทรีตเมนต์ที่มีตัวอย่างน้อยกว่าสามตัวอย่างจะถูกตั้งธง เพราะไม่มีการทดสอบใดบอกอะไรได้มากนัก
คุณภาพของภาพ: ผลลัพธ์ที่มีวัตถุน้อยเกินไป มีพิกเซลที่ถูกตัด (clipped) หรือมาจากสไลด์คุณภาพต่ำ จะถูกตั้งธงด้วยการตรวจสอบแบบเดียวกับที่ Quantify ใช้กับภาพเดียว
การแก้ไขถูกบันทึกไว้: วัตถุที่คุณจำแนกคลาสหรือให้เกรดใหม่ และภาพที่คุณคัดออกพร้อมเหตุผล จะถูกเขียนลงในข้อความ Methods ที่ส่งออก

สิ่งที่ไม่ได้ทำ

ไม่รันการทดสอบ post-hoc แบบจับคู่หลัง ANOVA, mixed model หรือการคำนวณกำลังการทดสอบ (power) ให้ส่งออกตารางตัวอย่างไปยัง Prism, R หรือ Python สำหรับงานเหล่านั้น
เปรียบเทียบค่าที่สูตรหนึ่งสร้างขึ้น แต่ไม่ได้เลือกสูตรหรือค่าการวัดให้คุณ
Ask Your Slide ตอบคำถามเกี่ยวกับภาพที่เปิดอยู่ ยังไม่ตอบคำถามเกี่ยวกับการทดลองทั้งชุด
มีไว้สำหรับงานวิจัย ไม่ใช่ระบบวินิจฉัย และความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติไม่ใช่ผลทางคลินิก

คำถามเกี่ยวกับการวิเคราะห์การทดลอง

จะเปรียบเทียบกลุ่มทรีตเมนต์ในภาพกล้องจุลทรรศน์ได้อย่างไร?

เปิดโฟลเดอร์ใน SlideScope และจัดภาพเป็นการทดลอง: ทรีตเมนต์ ตัวอย่าง และรีพลิเคต จากแผ่นข้อมูลตัวอย่างหรือจากคำแนะนำตามชื่อไฟล์ ด้วย SlideScope Plus ให้รันสูตร Quantify เดียวกันกับทุกภาพ แล้วเลือก Compare: SlideScope จะเฉลี่ยภาพของแต่ละตัวอย่าง พล็อตหนึ่งจุดต่อหนึ่งตัวอย่างพร้อมค่าเฉลี่ยและ SD ของแต่ละทรีตเมนต์ และรัน Welch's t-test และ Mann-Whitney สำหรับสองทรีตเมนต์ หรือ ANOVA และ Kruskal-Wallis เมื่อมีมากกว่านั้น

ทำไม n จึงเป็นจำนวนตัวอย่าง ไม่ใช่จำนวนภาพหรือเซลล์?

ภาพและเซลล์จากสัตว์ ผู้ป่วย หรือชุดเพาะเลี้ยงเดียวกันไม่ได้เป็นอิสระต่อกัน การนับเป็นการสังเกตแยกกันจึงทำให้ n สูงเกินจริง และทำให้ความแตกต่างดูแน่นอนกว่าความเป็นจริง SlideScope จะเฉลี่ยภาพของแต่ละตัวอย่างก่อน แล้วรันการทดสอบกับค่าเดียวต่อหนึ่งตัวอย่าง

เปรียบเทียบค่าการวัดใดได้บ้าง?

ค่าใดก็ได้ที่สูตร Quantify สร้างขึ้นสำหรับทุกภาพ: จำนวนวัตถุ ความหนาแน่นต่อ mm² เปอร์เซ็นต์ที่ให้ผลบวก H-score, Allred score พื้นที่เฉลี่ยของวัตถุ และความเข้มเฉลี่ยของแต่ละช่องสัญญาณ

การวิเคราะห์การทดลองรวมอยู่ในทุกแผนหรือไม่?

การจัดภาพเป็นการทดลองรวมอยู่ในทุกแผน ส่วนการรันสูตรเดียวกันทั่วทั้งการทดลอง การเปรียบเทียบทรีตเมนต์ และการตรวจทานผลลัพธ์ของการรันต้องใช้ SlideScope Plus ตัว Quantify เองไม่ว่าจะใช้กับภาพเดียวหรือทั้งโฟลเดอร์มีในทุกแผน

SlideScope ใช้แทนโปรแกรมสถิติได้หรือไม่?

ไม่ได้ SlideScope รันการทดสอบมาตรฐานสำหรับสองกลุ่มและหลายกลุ่มกับค่าเดียวต่อหนึ่งตัวอย่าง และรายงานผลพร้อมข้อมูลเบื้องหลัง แต่ไม่รันการทดสอบ post-hoc แบบจับคู่หลัง ANOVA, mixed model หรือการคำนวณกำลังการทดสอบ ให้ส่งออกตารางตัวอย่างไปยัง Prism, R หรือ Python สำหรับงานเหล่านั้น

คำตอบด่วน

เหมาะที่สุดสำหรับ: กลุ่มวิจัยที่เปรียบเทียบทรีตเมนต์ จีโนไทป์ หรือจุดเวลา จากภาพจำนวนมากของส่วนตัดที่ย้อมสี ชุดเพาะเลี้ยง หรือออร์แกนอยด์ และต้องการให้ทุกภาพถูกนับด้วยวิธีเดียวกันและรายงาน n อย่างถูกต้อง

จุดแข็งหลัก: สูตรเดียวกันกับทุกภาพ ใช้ตัวอย่างเป็นหน่วยทางสถิติ การตรวจค่าผิดปกติและรีพลิเคตพร้อมคิวตรวจทาน และการส่งออกพร้อมย่อหน้า Methods

ข้อจำกัดสำคัญ: มีเฉพาะการทดสอบมาตรฐานสำหรับสองกลุ่มและหลายกลุ่ม ไม่มีสถิติ post-hoc หรือ mixed model

ตรวจทานล่าสุด: 11 พฤศจิกายน 2026

นับทั้งการทดลองด้วยวิธีเดียวกัน

ดาวน์โหลด SlideScope ลองใช้ Quantify กับคลังภาพตัวอย่างฟรี และรันการทดลองของคุณด้วย SlideScope Plus

ดาวน์โหลด SlideScope

หน้าที่เกี่ยวข้อง

นับเซลล์ในภาพกล้องจุลทรรศน์ภาพเดียว
Ask Your Slide: นับและให้คะแนน IHC ด้วยการถาม
เปรียบเทียบซอฟต์แวร์วิเคราะห์ภาพจากกล้องจุลทรรศน์
แชร์สไลด์พร้อมโน้ตและการวัดของคุณ
SlideScope สำหรับห้องปฏิบัติการ
แผนและราคา