Figure
Aggiungere una barra di scala a un’immagine al microscopio
Apri un PNG o un JPEG, inserisci la dimensione del pixel o misura una distanza nota sull’immagine e scaricala con una barra di scala pulita e delle dimensioni corrette. Lo strumento funziona interamente in questa pagina: la tua immagine non viene mai caricata. Più sotto: il calcolatore della lunghezza della barra di scala e il calcolo da lezione di biologia della "dimensione reale a partire da una barra di scala".
Come aggiungere una barra di scala corretta
- Ricava la dimensione del pixel. L’ideale è dai metadati del file originale (Fiji: Image › Properties; la maggior parte dei formati per microscopia la registra). Altrimenti calcolala da fotocamera e obiettivo con il calcolatore della dimensione del pixel, oppure misura un micrometro oggetto.
- Usa l’immagine a piena risoluzione. Se hai ridimensionato o ritagliato e riscalato l’immagine, la dimensione del pixel è cambiata dello stesso fattore. Un ridimensionamento di 2× raddoppia i µm per pixel.
- Scegli una lunghezza tonda (1, 2, 5, 10, 20, 50, 100 µm…) pari a circa il 10–20 % della larghezza dell’immagine, così si legge a colpo d’occhio senza coprire il campione.
- Mettila in un angolo libero con un colore che contrasti con lo sfondo, e indica la lunghezza sulla barra o nella legenda.
Lo strumento qui sopra segue queste regole: se lasci vuota la lunghezza, sceglie un valore tondo vicino a un quinto della larghezza. La maggior parte dei browser non apre i file TIFF; salva prima un PNG (Fiji: File › Save As › PNG).
Formule della barra di scala
lunghezza della barra (px) = lunghezza della barra (µm) ÷ dimensione del pixel (µm/px) · dimensione reale = lunghezza dell’oggetto ÷ lunghezza della barra × valore della barra
Esempio svolto (figura): 0,25 µm per pixel, una barra di 50 µm: 50 ÷ 0,25 = 200 pixel.
Esempio svolto (domanda di biologia): su una micrografia stampata la cellula misura 36 mm con un righello e la barra di scala da 10 µm misura 20 mm. Dimensione reale = 36 ÷ 20 × 10 = 18 µm. Poiché entrambe le lunghezze sono misurate con lo stesso righello, la loro unità si semplifica; solo il valore della barra determina l’unità del risultato. L’ingrandimento di quella stampa è 20 mm ÷ 10 µm = 20.000 µm ÷ 10 µm = ×2000.
Barre di scala in Fiji e in SlideScope
Fiji / ImageJ: imposta o verifica la scala (Analyze › Set Scale), poi Analyze › Tools › Scale Bar…, scegli larghezza, posizione e colore e spunta Overlay per lasciare intatti i pixel.
SlideScope: il visualizzatore legge la dimensione del pixel da CZI, ND2, SVS, LIF, OME-TIFF e dagli altri formati supportati e mostra una barra di scala che segue lo zoom. File › Make Figure… impagina pannelli con lettere e barre di scala e scrive un paragrafo per i Metodi a partire dai metadati del file; per salvare la figura serve un abbonamento. Se un file non ha una dimensione del pixel, View › Set Pixel Size… permette di aggiungerla.
Domande
Come aggiungo una barra di scala a un’immagine al microscopio?
Ti serve la dimensione del pixel dell’immagine (µm per pixel). Dividi per questa la lunghezza della barra che vuoi per ottenere la lunghezza della barra in pixel, poi disegnala, oppure usa lo strumento di questa pagina, Analyze › Tools › Scale Bar di Fiji o il software del tuo microscopio.
Come calcolo la dimensione reale di un campione da una barra di scala?
Misura l’oggetto e la barra di scala con un righello, dividi la lunghezza dell’oggetto per la lunghezza della barra e moltiplica per il valore della barra: 36 mm ÷ 20 mm × 10 µm = 18 µm.
La mia immagine viene caricata?
No. L’immagine viene letta dal browser e disegnata su un canvas in questa pagina; nulla viene inviato a un server. Chiudendo la scheda viene eliminata.
Quanto deve essere lunga una barra di scala?
Un numero tondo (1, 2, 5 × una potenza di dieci) che copra circa il 10–20 % della larghezza dell’immagine. Le barre molto corte sono difficili da leggere; quelle molto lunghe coprono il campione.
Posso aggiungere una barra di scala a un TIFF?
La maggior parte dei browser non visualizza i file TIFF, quindi salva prima l’immagine come PNG. Strumenti desktop come Fiji o SlideScope aprono direttamente il TIFF e ne leggono la calibrazione.
Questo strumento è gratuito?
Sì. Funziona nel tuo browser e non invia nulla da nessuna parte. SlideScope, l’app desktop per microscopia creata dallo stesso team, è un’app a pagamento con una libreria di campioni gratuita (tutti gli strumenti) e un abbonamento per le tue immagini.
Fonti
I risultati sono teorici o aritmetici; confrontali con la documentazione del tuo strumento prima di farvi affidamento per attività cliniche o regolamentate.
Misura sulle tue immagini reali
SlideScope apre 34 formati di microscopi e scanner per vetrini, tra cui CZI, ND2, SVS e LIF, con la loro calibrazione, così lunghezze, aree, conteggi di cellule e barre di scala risultano in µm senza dover impostare nulla. Prova gratis tutti gli strumenti sui campioni inclusi; per aprire le tue immagini serve un abbonamento. Hai già deciso? Abbonati ora.