Şekiller
Mikroskop görüntüsüne ölçek çubuğu ekleme
Bir PNG veya JPEG açın, piksel boyutunu girin ya da resim üzerinde bilinen bir mesafeyi ölçün ve görüntüyü temiz, doğru boyutlu bir ölçek çubuğuyla indirin. Araç tamamen bu sayfada çalışır: görüntünüz hiçbir zaman yüklenmez. Altında: ölçek çubuğu uzunluğu hesaplayıcısı ve biyoloji derslerindeki "ölçek çubuğundan gerçek boyut" hesabı.
Doğru bir ölçek çubuğu nasıl eklenir?
- Piksel boyutunu edinin. En iyisi: orijinal dosyanın meta verilerinden (Fiji: Image › Properties; mikroskop biçimlerinin çoğu bunu kaydeder). Aksi hâlde kamera ve objektiften piksel boyutu hesaplayıcısıyla hesaplayın veya bir sahne mikrometresi ölçün.
- Tam çözünürlüklü görüntüyü kullanın. Resmi yeniden boyutlandırdıysanız ya da kırpıp yeniden ölçeklendirdiyseniz piksel boyutu da aynı oranda değişmiştir. 2× küçültme, piksel başına µm değerini iki katına çıkarır.
- Görüntü genişliğinin yaklaşık %10–20’si kadar yuvarlak bir uzunluk seçin (1, 2, 5, 10, 20, 50, 100 µm…); böylece numuneyi örtmeden bir bakışta okunur.
- Çubuğu, arka planla kontrast oluşturan bir renkte sakin bir köşeye yerleştirin ve uzunluğu çubuğun üzerinde veya şekil açıklamasında belirtin.
Yukarıdaki araç bu kurallara uyar: uzunluğu boş bırakırsanız genişliğin beşte biri civarında yuvarlak bir değer seçer. TIFF dosyaları çoğu tarayıcıda açılamaz; önce PNG olarak kaydedin (Fiji: File › Save As › PNG).
Ölçek çubuğu formülleri
çubuk uzunluğu (px) = çubuk uzunluğu (µm) ÷ piksel boyutu (µm/px) · gerçek boyut = nesne uzunluğu ÷ çubuk uzunluğu × çubuk değeri
Çözümlü örnek (şekil): piksel başına 0,25 µm, 50 µm’lik bir çubuk: 50 ÷ 0,25 = 200 piksel.
Çözümlü örnek (biyoloji sorusu): basılı bir mikrografta hücre cetvelle 36 mm, 10 µm’lik ölçek çubuğu ise 20 mm ölçülüyor. Gerçek boyut = 36 ÷ 20 × 10 = 18 µm. İki uzunluk da aynı cetvelle ölçüldüğü için birimleri birbirini götürür; sonucun birimini yalnızca çubuğun değeri belirler. Bu baskının büyütmesi 20 mm ÷ 10 µm = 20.000 µm ÷ 10 µm = ×2000’dir.
Fiji’de ve SlideScope’ta ölçek çubukları
Fiji / ImageJ: ölçeği ayarlayın veya kontrol edin (Analyze › Set Scale), ardından Analyze › Tools › Scale Bar… komutunu açın, genişliği, konumu ve rengi seçin ve pikselleri olduğu gibi korumak için Overlay’i işaretleyin.
SlideScope: görüntüleyici, piksel boyutunu CZI, ND2, SVS, LIF, OME-TIFF ve desteklenen diğer biçimlerden okur ve yakınlaştırmayı izleyen bir ölçek çubuğu gösterir. File › Make Figure…, panelleri harflerle ve ölçek çubuklarıyla düzenler ve dosyanın meta verilerinden bir Yöntemler paragrafı yazar; şekli kaydetmek için abonelik gerekir. Bir dosyada piksel boyutu yoksa View › Set Pixel Size… ile eklenebilir.
Sorular
Mikroskop görüntüsüne ölçek çubuğu nasıl eklenir?
Görüntünün piksel boyutu (piksel başına µm) gerekir. Piksel cinsinden çubuk uzunluğunu bulmak için istediğiniz çubuk uzunluğunu buna bölün, ardından çubuğu çizin; ya da bu sayfadaki aracı, Fiji’nin Analyze › Tools › Scale Bar komutunu veya mikroskop yazılımınızı kullanın.
Bir numunenin gerçek boyutu ölçek çubuğundan nasıl hesaplanır?
Nesneyi ve ölçek çubuğunu cetvelle ölçün, nesne uzunluğunu çubuk uzunluğuna bölün ve çubuğun değeriyle çarpın: 36 mm ÷ 20 mm × 10 µm = 18 µm.
Görüntüm yükleniyor mu?
Hayır. Görüntü tarayıcınız tarafından okunur ve bu sayfadaki bir tuvale çizilir; hiçbir şey bir sunucuya gönderilmez. Sekmeyi kapattığınızda görüntü silinir.
Ölçek çubuğu ne uzunlukta olmalı?
Görüntü genişliğinin kabaca %10–20’sini kaplayan yuvarlak bir sayı (1, 2, 5 × on’un bir kuvveti). Çok kısa çubuklar zor okunur; çok uzun olanlar numuneyi örter.
TIFF’e ölçek çubuğu ekleyebilir miyim?
Çoğu tarayıcı TIFF dosyalarını gösteremez; bu nedenle görüntüyü önce PNG olarak kaydedin. Fiji veya SlideScope gibi masaüstü araçlar TIFF’i doğrudan açar ve kalibrasyonunu okur.
Bu araç ücretsiz mi?
Evet. Tarayıcınızda çalışır ve hiçbir yere bir şey göndermez. Aynı ekibin geliştirdiği masaüstü mikroskopi uygulaması SlideScope ise ücretsiz bir örnek kitaplığı (tüm araçlarla) ve kendi görüntüleriniz için abonelik sunan ücretli bir uygulamadır.
Kaynaklar
Sonuçlar kuramsal veya aritmetiktir; klinik ya da düzenlemeye tabi çalışmalarda bunlara güvenmeden önce cihazınızın belgeleriyle karşılaştırın.
Gerçek görüntüleriniz üzerinde ölçün
SlideScope, aralarında CZI, ND2, SVS ve LIF’in de bulunduğu 34 mikroskop ve slayt tarayıcı biçimini kendi kalibrasyonlarıyla açar; böylece uzunluklar, alanlar, hücre sayıları ve ölçek çubukları hiçbir ayar yapmadan µm cinsinden elde edilir. Tüm araçları yerleşik örneklerde ücretsiz deneyin; kendi görüntülerinizi açmak için abonelik gerekir. Kararınızı verdiniz mi? Hemen abone olun.