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TIFF 元数据查看器

列出 TIFF 中每幅图像的全部标签,读取 OME-XML、ImageJ 或 Aperio SVS 描述,检查文件记录的像素尺寸,并在分享之前找出可能识别患者或实验室身份的字段。文件由您的浏览器读取,从不上传。

TIFF 元数据查看器

将 TIFF、OME-TIFF 或 SVS 文件拖放到此处

由您电脑上的浏览器读取。不上传任何内容。

TIFF 将像素尺寸保存在哪里

文件像素尺寸所在位置
OME-TIFFOME-XML(位于 ImageDescription 中)Pixels 元素上的 PhysicalSizeX 和 PhysicalSizeXUnit
Aperio SVS第一幅图像 ImageDescription 中的 MPP = 0.4990(每像素 µm 数)
ImageJ / Fiji TIFFImageDescription 中的 unit=micron,每单位像素数记录在 XResolution 中
普通 TIFFXResolution 及 ResolutionUnit(2 = 英寸,3 = 厘米);相机软件常写入 72 或 300 dpi,这是打印设置,而非校准值

查看器会报告它找到了其中哪一种。如果都没有,请在测量之前自行设置比例(像素尺寸计算器介绍了具体方法)。

可能识别患者或实验室身份的字段

全切片文件包含的往往不只是像素:玻片标签的照片(条形码、病例号,有时还有姓名)、整张切片的宏观图、扫描日期和时间、扫描仪序列号、用户名以及原始文件名。本工具会列出它在主要标签中找到的此类信息。在将切片分享到您所在机构之外之前,请先移除这些信息:参见如何从切片图像中移除标签和患者数据。

通过命令行获取相同信息

tiffinfo file.tif(libtiff)会打印每个目录;exiftool -a -G1 file.tif 还会显示厂商标签;在 Python 中,tifffile.TiffFile(path) 提供 .pages[i].tags、.ome_metadata 和 .imagej_metadata。对于 SVS,openslide.OpenSlide(path).properties 会给出解析后的字段(参见在 Python 中读取 SVS 文件)。

它如何在不上传的情况下打开文件

当您选择文件时,浏览器会把磁盘上该文件的句柄交给本页面。页面只读取所需的字节:先读取 TIFF 目录,再读取屏幕上显示区域的图块,并在页面中用开源 TIFF 读取器(geotiff)解码。任何内容都不会发送到服务器,因此未发表的数据和带有患者标签的切片都留在您的电脑上;数 GB 的切片也能在几秒内打开,因为它们从不会被复制到任何地方。关闭标签页后,文件即从页面中消失。

页面从 slidescope.science 加载自身的脚本,以及本站注重隐私的页面浏览计数器;两者都不会接触您的图像。开源许可证:image-tools-vendor.LICENSE.txt。

常见问题

如何查看 TIFF 文件的元数据?

在本页面中打开它即可列出每幅图像的全部标签,也可以使用 tiffinfo、exiftool 或 Python 中的 tifffile。大部分显微镜元数据(OME-XML、ImageJ 或 Aperio 字段)都保存在 ImageDescription 标签中。

如何查找 TIFF 的像素尺寸?

查找 OME-XML 中的 PhysicalSizeX、Aperio 描述中的 MPP,或 ImageJ 的 unit 及 XResolution。单纯的 72 或 300 dpi 分辨率是打印设置,而非显微镜校准值。

可以导出标签吗?

可以:点击“将所有标签下载为 JSON”可保存文件中最多 200 幅图像的标签,较长的数组会被截短。

我的文件会被上传吗?

不会。浏览器在您的电脑上读取文件;不会向任何地方发送任何内容。

这个工具免费吗?

是的,它免费且无需账户。SlideScope 是同一团队开发的桌面显微镜应用,它是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具),打开您自己的图像需要订阅。

需要浏览器做不到的功能?

SlideScope 可在 Windows 和 Mac 上打开 34 种显微镜和切片扫描仪格式,包括 CZI、ND2、LIF、MRXS 和 JPEG 2000 SVS,并提供测量、标注、细胞计数和全分辨率 OME-TIFF 导出。可在内置示例上免费试用所有工具;打开您自己的图像需要订阅。已经决定了?立即订阅。

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