SVS 文件里有什么
SVS 文件是一个包含多幅图像的 TIFF:全分辨率扫描图像(分块存储,通常为 JPEG 压缩)、一张缩略图、两到三个降低分辨率的层级、一张切片标签照片,以及一张整块玻片的低倍宏观图像。第一幅图像的描述中保存着扫描详情,包括 MPP(每像素微米数,40× 扫描约为 0.25,20× 约为 0.5)和 AppMag。查看器会读取所有这些内容:金字塔用于缩放,MPP 用于比例尺,标签和宏观图像可通过图像旁的按钮打开。
将 Aperio SVS 切片拖放到此处
由您电脑上的浏览器读取。不上传任何内容。
SVS 文件是一个包含多幅图像的 TIFF:全分辨率扫描图像(分块存储,通常为 JPEG 压缩)、一张缩略图、两到三个降低分辨率的层级、一张切片标签照片,以及一张整块玻片的低倍宏观图像。第一幅图像的描述中保存着扫描详情,包括 MPP(每像素微米数,40× 扫描约为 0.25,20× 约为 0.5)和 AppMag。查看器会读取所有这些内容:金字塔用于缩放,MPP 用于比例尺,标签和宏观图像可通过图像旁的按钮打开。
部分 Aperio 扫描仪使用 JPEG 2000 压缩切片(TIFF 压缩代码 33003 或 33005)。浏览器在没有 WebAssembly 的情况下无法解码 JPEG 2000,因此本页面会明确提示,而不是显示一张空白图像。Aperio ImageScope(Windows)、QuPath 和 SlideScope 可以打开这类文件。如需事先检查文件,请在 TIFF 元数据查看器中打开它,并查看 Compression 一项。
标签图像是玻片上纸质标签的照片,可能显示条形码、病例号或患者姓名。在这里查看时,它始终保留在您的电脑上;但分享文件时则不然。将切片发送到本机构以外之前,请参阅如何移除标签和患者数据。
对于这些格式,以及要在您自己的图像上测量、标注和计数细胞,SlideScope 可在 Windows 和 Mac 上打开 34 种显微镜和切片扫描仪格式。SlideScope 是同一团队开发的桌面显微镜应用,它是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具),打开您自己的图像需要订阅。免费替代方案:Fiji(Bio-Formats)和 QuPath。
当您选择文件时,浏览器会把磁盘上该文件的句柄交给本页面。页面只读取所需的字节:先读取 TIFF 目录,再读取屏幕上显示区域的图块,并在页面中用开源 TIFF 读取器(geotiff)解码。任何内容都不会发送到服务器,因此未发表的数据和带有患者标签的切片都留在您的电脑上;数 GB 的切片也能在几秒内打开,因为它们从不会被复制到任何地方。关闭标签页后,文件即从页面中消失。
页面从 slidescope.science 加载自身的脚本,以及本站注重隐私的页面浏览计数器;两者都不会接触您的图像。开源许可证:image-tools-vendor.LICENSE.txt。
在本页面中打开即可:浏览器从您的磁盘读取切片,并显示缩放视图、缩略图、标签和宏观图像以及扫描详情。不会上传任何内容。
它很可能采用了 JPEG 2000 压缩(压缩代码 33003 或 33005),浏览器无法解码。请改用 Aperio ImageScope、QuPath 或 SlideScope 打开。
只要浏览器能够寻址,任何大小都可以:只读取屏幕上显示的图块,因此 3 GB 的切片打开速度与小文件大致相同。
会,作为一幅单独的图像显示。请注意,标签可能包含患者信息。
是的,它免费且无需账户。SlideScope 是同一团队开发的桌面显微镜应用,它是一款付费应用,附带免费示例库(包含所有工具),打开您自己的图像需要订阅。
SlideScope 可在 Windows 和 Mac 上打开 34 种显微镜和切片扫描仪格式,包括 CZI、ND2、LIF、MRXS 和 JPEG 2000 SVS,并提供测量、标注、细胞计数和全分辨率 OME-TIFF 导出。可在内置示例上免费试用所有工具;打开您自己的图像需要订阅。已经决定了?立即订阅。