ImageJ में कोशिकाएँ कैसे गिनें?
इमेज को Fiji में खोलें, केवल न्यूक्लियर या कोशिका चैनल रखें, हल्का स्मूद करें (Process › Filters › Gaussian Blur), थ्रेशोल्ड लगाएँ (Image › Adjust › Threshold, फिर Apply), Process › Binary › Watershed से सटे ऑब्जेक्ट अलग करें, और आकार-सीमा तथा Summarize पर टिक के साथ Analyze › Analyze Particles चलाएँ। सारांश वाली पंक्ति ही गणना है।
क्या ImageJ अपने-आप कोशिकाएँ गिन सकता है?
हाँ, साफ़ बैकग्राउंड पर अच्छी तरह अलग-अलग ऑब्जेक्ट के लिए: थ्रेशोल्डिंग और Analyze Particles उन्हें अपने-आप गिन लेते हैं, और एक मैक्रो इसे पूरे फ़ोल्डर पर दोहराता है। घने या सटे न्यूक्लियाई के लिए watershed चरण या StarDist या Cellpose जैसा डीप-लर्निंग मॉडल चाहिए।
IHC या फ़्लोरेसेंस इमेज में पॉज़िटिव कोशिकाएँ कैसे गिनें?
पहले हर न्यूक्लियस का पता लगाएँ, फिर हर एक को मार्कर चैनल या स्टेन की तीव्रता के आधार पर वर्गीकृत करें। QuPath ब्राइटफ़ील्ड DAB इमेज पर Positive cell detection से यह करता है; SlideScope एक या दो मार्कर चैनलों के आधार पर ऑब्जेक्ट को मार्कर-पॉज़िटिव के रूप में वर्गीकृत करता है।
क्या मैं बिना कोडिंग के कोशिकाएँ गिन सकता/सकती हूँ?
हाँ। Fiji, QuPath और CellProfiler सभी मेनू के ज़रिए काम करते हैं, और SlideScope बिना स्क्रिप्ट या प्लगइन के एक पैनल से न्यूक्लियाई और कोशिकाएँ गिनता है। कोड की ज़रूरत केवल कस्टम पाइपलाइन के लिए होती है।
क्या SlideScope मुफ़्त है?
SlideScope एक पेड ऐप है जिसके साथ मुफ़्त सैंपल लाइब्रेरी (हर टूल के साथ) मिलती है; आपकी अपनी इमेज के लिए $35/माह से सदस्यता ज़रूरी है।
बिल्ट-इन सैंपल लाइब्रेरी को हर टूल के साथ मुफ़्त में आज़माएँ। अपनी इमेज खोलने के लिए सदस्यता ज़रूरी है: $35/माह, जिसका शुल्क सब्सक्राइब करते ही लिया जाता है (PayPal या कार्ड), और आप अपने खाते से कभी भी रद्द कर सकते हैं। वार्षिक बिलिंग $349.99/वर्ष पर उपलब्ध है, जो लगभग दो महीने मुफ़्त के बराबर पड़ती है।
क्या गिनने के लिए SlideScope मेरी इमेज अपलोड करता है?
नहीं। सेगमेंटेशन और माप आपके अपने कंप्यूटर पर चलते हैं। केवल मॉडल वेट्स डाउनलोड होते हैं, जिन्हें SlideScope लोड करने से पहले उनके SHA-256 डाइजेस्ट से जाँचता है।