Ask Your Slide · SlideScope 1.23.0 起提供

向玻片提問,就能計數細胞並完成 IHC 評分

針對目前開啟的影像輸入一個問題,例如「這個區域中 Ki67 陽性的細胞核佔百分之多少?」AI 助理負責規劃步驟,SlideScope 則在您的電腦上執行自己的計數、IHC 評分與量測工具。回答中的每個數字都來自其中某個工具,附有可供查核的依據,還有一個不經 AI 重新執行這些步驟的按鈕。僅供研究使用。

每個數字都來自本機工具 「不含影像」模式:影像始終留在您的電腦上 依據、重新計算與匯出

Ask Your Slide 如何運作

  1. 在 Windows 或 macOS 版 SlideScope 中開啟影像:全玻片影像、共軛焦影像堆疊、螢光影像,或 SlideScope 支援的其他任一格式。
  2. 用日常語言提問。如果問題只與某個區域有關,請先圈選該區域或縮放至相應視野。回答提供 14 種語言。
  3. AI 負責規劃,本機工具負責執行。助理會挑選步驟(計數細胞核、DAB 評分、量測區域、尋找熱點),SlideScope 則在您的電腦上逐一執行。每個動作都會顯示在影像上,也都可以復原。
  4. 閱讀回答及其依據。回答會以 [R1]、[R2] 等標示所使用的確切畫面:點選即可跳回該畫面。「依據」列出每個步驟的像素面積、平面、參數與結果,回答也會顯示傳送了哪些內容。
  5. 查核、重新計算與匯出。「不使用 AI 重新計算」會在本機重新執行相同步驟,並檢查數字是否完全相同。您可以匯出回答、分析紀錄與一段方法說明,或製作附比例尺的圖版。

觀看一段 62 秒的示範影片,以 SlideScope 1.23 錄製,使用公開範例影像(EPFL BrdU IHC,CC BY 4.0;czitools DAPI/GFP)。無聲音。

您可以提出的問題,以及回答這些問題的工具

Ask Your Slide 使用 SlideScope 自己的工具:細胞核、細胞或顆粒計數(InstanSeg 深度學習分割或傳統方法)、DAB 的 IHC 評分、區域統計、校正量測、通道飽和統計、熱點搜尋、區域輪廓、筆記與畫面控制。以下是幾個例子:

您的提問SlideScope 執行的工具您會得到什麼
「這個區域中 Ki67 陽性的細胞核佔百分之多少?」計數細胞核(InstanSeg),再進行 DAB 的 IHC 評分陽性百分比與計數的細胞核數量,並在影像上顯示輪廓
「給我圈選區域的 H-score 與 Allred 分數。」計數細胞核,以與 QuPath 相容的定義進行 IHC 評分該區域的 H-score、Allred 分數與陽性百分比
「找出細胞最密集的三個區域,並分別評估 Ki67。」熱點搜尋、圈出區域、逐區計數與評分三個已圈出的熱點,各自附每 mm² 密度、z 分數與 Ki67 百分比
「這個視野裡有多少個細胞?它們有多大?」計數細胞(InstanSeg 或傳統方法)計數結果與物件面積,可匯出為 CSV 與 GeoJSON
「比較這兩個區域的 DAPI 密度。」每個區域的區域統計與細胞核計數面積、計數與每 mm² 密度並列比較
「這裡哪個通道最亮?有沒有飽和?」區域統計、通道飽和統計各通道的平均強度,以及各自的飽和比例
「帶我到 GFP 最亮的區域。」在 GFP 通道上搜尋熱點,再移動畫面畫面縮放到該區域,並圈出該區域
「這個區域的面積是多少 µm²?其中 DAB 陽性的部分佔多少?」校正量測、區域統計以 µm² 表示的面積,以及 DAB 陽性面積百分比
「切換到第 12 個 Z 平面並計數細胞核。」移動畫面(Z)、計數細胞核該平面的計數結果,所用平面會記錄在依據中
「用這些數字新增一則筆記。」新增筆記一則隨影像保存的玻片筆記

目前 Ask Your Slide 只回答關於目前開啟影像的問題。若要在多張影像之間比較不同處理,請使用 SlideScope Plus 的實驗功能:以同一個計數配方處理每張影像,再以適當的統計檢定進行比較。針對整個實驗提問的功能預計稍後推出。

每個數字都來自工具

通用 AI 模型並不是為了靠看圖來計數物件而設計的(Haase, ChatGPT for Image Analysis, 2024),因此 Ask Your Slide 從不讓模型估計數字。助理只決定要執行哪些工具;回答中的每個計數、分數、面積與強度,都由 SlideScope 在您的電腦上計算,而且每一項您都能查核:

  • 指向畫面的引用。每項陳述都會指向其來源畫面([R1]、[R2])。點選後,SlideScope 會回到完全相同的位置、縮放倍率與平面。
  • 依據。每個步驟都列出所分析區域的像素面積、平面、使用的參數與結果。
  • 不使用 AI 重新計算。在本機重新計算已記錄的步驟,全程不涉及 AI,並檢查數字是否完全相同。
  • 傳送了什麼。回答會明確顯示這個問題有哪些內容離開了您的電腦。
  • 看得見,也能復原。輪廓、筆記與畫面變化會即時顯示在影像上,而且每一項都可以復原。
SlideScope 中 Ask Your Slide 對一張 DAB 染色切片的回答:577 個細胞核中 15.4% 為 DAB 陽性,H-score 20.1,Allred 4,每平方毫米 910 個陽性細胞核,並附 [R1] 引用;已評分的細胞核在影像上描出輪廓,依據中列出本機 Quantify 步驟,並提供「不使用 AI 重新計算」、「匯出」與「製作圖版」連結。
SlideScope 1.23 中 Ask Your Slide 的真實回答,問題是「這裡 DAB 陽性的細胞核佔百分之多少?」(15.4%),影像為小鼠十二指腸的 BrdU IHC 切片(EPFL,CC BY 4.0)。細胞核依 DAB 分級描出輪廓,回答以 [R1] 引用所使用的畫面,依據則列出產生每個數字的本機步驟,並提供「不使用 AI 重新計算」、「匯出」與「製作圖版」。

從設計上保護隱私:究竟傳送了什麼

分析在您的電腦上執行。規劃步驟與撰寫回答由雲端 AI 模型完成,而 Ask Your Slide 面板中的傳送畫面影像開關,決定它是否會看到任何圖片。

傳送畫面影像傳送給雲端 AI 的內容絕不會離開您電腦的內容
關閉(「不含影像」)您的問題、有限的技術資訊(格式、尺寸、通道、像素尺寸),以及本機工具計算出的數字影像與檔案
開啟同上,另加 AI 查看的畫面;每個畫面都會先在您的螢幕上顯示,並經過壓縮檔案,以及影像中 AI 未查看的所有部分

您的問題與影像不會用於訓練 AI 模型。CT、MRI 等醫學影像會被拒絕。AI 供應商與完整條款請見隱私權聲明,資料處理頁面則說明 SlideScope 其他部分會在您的電腦上保留哪些內容。

可用於實驗記錄、圖版與方法段落的匯出

  • answer.md:附引用的回答,可直接貼進實驗記錄本。
  • analysis_record.json:步驟、參數與結果的完整紀錄,也就是「不使用 AI 重新計算」所使用的同一份紀錄。
  • 方法說明:一段描述量測內容與量測方式的文字,可修改後用於稿件。
  • Quantify 輸出:CSV 格式的物件表、GeoJSON 格式的輪廓(可在 QuPath 中開啟)、遮罩與加註影像。
  • 製作圖版:以該畫面製作附校正比例尺的圖版。

QUAREP-LiMi 社群制定的報告檢核表,要求作者報告影像分析流程,以及比例尺等圖版細節(Schmied et al., Nature Methods 2023)。分析紀錄與方法說明會提供您需要報告的參數。

自動化 Ki67 與 IHC 評分有多準確?

以肉眼評估 Ki67 很難重現,這正是交給工具計數的主要原因:

  • 國際乳癌 Ki67 工作小組將同樣的 30 例乳癌送交 12 個國家的 23 位病理醫師評估,全域計數法的一致性(ICC)為 0.87,熱點評分法為 0.83,後者未達到該研究的成功標準。判讀者在同一張玻片上選出的熱點也不一定相同(Leung et al., Histopathology 2019)。
  • 六位乳房病理次專科醫師評估 57 張 Ki-67 玻片,在 20% 切點下僅達中等一致性(兩輪的係數分別為 0.44 與 0.48),作者認為需要借助數位影像分析來改善(Ai et al., Breast Cancer Research and Treatment 2024)。
  • 數位影像分析的一致性較高:四位病理醫師依照該工作小組的指引,各自獨立建立的四種 QuPath 演算法,在 157 例 ER 陽性乳癌上與參考演算法的一致性達到 ICC 0.938(Boyaci et al., Biomolecules 2021)。

這些研究描述的是一般的人工與自動化 Ki67 評分,並未測試 SlideScope。SlideScope 的 IHC 評分遵循 QuPath 的定義(DAB 光密度切點 0.2、0.4 與 0.6 分別對應 1+、2+ 與 3+),其本機定量結果已在相同玻片上與 QuPath 0.7.0 對照驗證。熱點搜尋是以物件密度與 z 分數進行的計算,而非主觀判斷,因此相同的區域與設定一定會得到相同的熱點。

如何抽查一個回答

  1. 查看影像上的輪廓:漏抓的細胞核、黏連的相鄰細胞核以及染色碎屑,一眼就能看出。
  2. 點選 [R1] 回到完全相同的畫面,放大後以人工計數一小塊視野,與報告的數字對照。
  3. 開啟「依據」,確認平面、區域面積與參數都符合您的原意。
  4. 在採信強度數值之前先檢查飽和:針對同一區域詢問哪些通道已飽和。
  5. 按下「不使用 AI 重新計算」,並將分析紀錄與您的資料一起保存。

Ask Your Slide、通用聊天機器人、撰寫腳本,還是企業級 AI 助理

Ask Your Slide將影像上傳到通用聊天機器人撰寫 QuPath 或 Fiji 腳本企業級病理 AI 助理
數字從何而來SlideScope 的本機工具,並顯示所用參數模型本身,或它在對話中撰寫的程式碼您的腳本,由 QuPath 或 Fiji 執行廠商在其平台上的模型
影像去向在「不含影像」模式下留在您的電腦上;否則只傳送您先看過的壓縮畫面上傳到聊天機器人的伺服器留在您的電腦上存放在廠商的平台上
查核與重現結果每個步驟都有依據;「不使用 AI 重新計算」會檢查數字是否完全相同再問一次可能得到不同的答案只要保留腳本與版本即可重現視平台而定
設定安裝 SlideScope 就能提問不需設定,但要先匯出聊天機器人能讀取的影像學習腳本 API 並除錯程式碼,包括聊天機器人替您寫的程式碼機構合約與部署
全玻片與顯微鏡格式CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM 等約 39 種格式通常只支援常見影像格式範圍廣泛,透過 Bio-Formats 與 OpenSlide平台可匯入的格式
最適合免寫程式碼即可取得標準計數、IHC 分數與區域數值,並有紀錄可供出示快速描述一張圖片自訂分析流程與訓練式分類器大型臨床研究計畫

QuPath 與 Fiji 是免費的,仍是自訂或腳本化分析的合適選擇;請參閱如何在 ImageJ、QuPath 或 CellProfiler 中計數細胞。如果想以文字描述畫面而非量測,請使用 AI Analysis。

格式與語言

Ask Your Slide 適用於 SlideScope 能開啟的影像:CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM 全玻片影像等,共約 39 種格式,涵蓋明視野全玻片到含 Z 軸、時間序列與多場景的多通道螢光影像。完整清單請見檔案相容性頁面。回答提供 14 種語言,應用程式介面提供 10 種語言。

誰可以使用 Ask Your Slide

從 1.23.0 版起,Ask Your Slide 成為 Windows 與 macOS 版 SlideScope 的一部分。它包含在 SlideScope 付費方案中,但有合理使用的 AI 限制;Plus 方案的限制較高。目前,在整個實驗中比較不同處理可透過 SlideScope Plus 的實驗功能完成;針對整個實驗提問的功能預計稍後推出。使用免費 SlideScope 帳戶,您可以在免費範例玻片上試用 Ask Your Slide,每天三個問題;針對您自己的影像提問則需要訂閱。最新價格請見方案頁面。

關於 Ask Your Slide 的常見問題

ChatGPT 能計數顯微影像中的細胞嗎?

單靠它本身並不可靠。通用聊天機器人是根據您上傳的圖片,或它在該次對話中撰寫的程式碼來回答,因此方法可能每次對話都不同,而且螢幕截圖不含像素尺寸。2024 年一場關於以聊天機器人進行影像分析的研討會演講指出,語言模型並不是為了計數影像中的物件而設計的。Ask Your Slide 的運作方式不同:AI 只負責規劃步驟,每個數字都由 SlideScope 自己的計數工具在您的電腦上產生,「不使用 AI 重新計算」還會重新計算這些數字。

我的影像會被傳送到雲端嗎?

關閉「傳送畫面影像」(不含影像)時不會:影像絕不會離開您的電腦,只有您的問題、有限的技術資訊(格式、尺寸、通道、像素尺寸)與計算出的數字會傳送給雲端 AI。開啟此開關後,AI 查看的畫面也會以壓縮形式傳送,而且每個畫面都會先在您的螢幕上顯示。您的資料不會用於訓練 AI 模型。

Ask Your Slide 是診斷工具嗎?

不是。Ask Your Slide 僅供研究使用,並非醫療診斷。它會拒絕處理 CT、MRI 等醫學影像,回答中提供的是量測結果,而非診斷或分級。

與人工評分相比,自動化 Ki67 評分有多準確?

人工 Ki67 評分會因判讀者而異:在一項國際研究中,23 位病理醫師以全域評分的 ICC 為 0.87,以熱點評分則為 0.83。數位影像分析的一致性較高:四種獨立建立的 QuPath 演算法與參考演算法的一致性達到 ICC 0.938。自動計數仍需查核,因此請檢查輪廓、將一小塊視野與人工計數比較,並保留依據紀錄。

Ask Your Slide 是免費的 Ki67 評分 App 嗎?

不是。Ask Your Slide 包含在 SlideScope 付費方案中,但有合理使用的 AI 限制,Plus 的限制較高。使用免費帳戶,您每天可以針對內建範例玻片提出三個問題,這些範例玻片也能使用所有本機工具;最新價格請見方案頁面。

我可以重新計算或匯出結果嗎?

可以。「不使用 AI 重新計算」會在您的電腦上重新計算已記錄的步驟,並檢查數字是否完全相同。「匯出」會儲存 answer.md、analysis_record.json 與一段方法說明,以及物件 CSV、GeoJSON 輪廓、遮罩與加註影像;「製作圖版」則會加上比例尺。

它支援哪些檔案格式?

SlideScope 能開啟的格式:CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、OME-TIFF、DICOM 全玻片影像等,共約 39 種格式。CT、MRI 等醫學影像會被拒絕。

它和 QuPath 或 ImageJ 有什麼不同?

QuPath 與 ImageJ 免費、可撰寫腳本,是自訂分析流程與訓練式分類器的合適工具。Ask Your Slide 則用於標準問題(計數、陽性百分比、H-score、Allred、區域統計、熱點),不必撰寫腳本,而且就在已開啟影像的檢視器中完成。其 IHC 評分採用與 QuPath 相容的定義,GeoJSON 輪廓也能在 QuPath 中開啟。

Ask Your Slide 可以離線使用嗎?

提問需要網路連線,因為步驟規劃與回答撰寫由雲端 AI 完成。計數、評分與量測本身則都在您的電腦上執行。

我可以針對整個實驗提問嗎?

目前還無法透過提問完成:Ask Your Slide 只回答關於目前開啟影像的問題。如果現在就想在多張影像之間比較不同處理,請使用 SlideScope Plus 的實驗功能,它會以同一個計數配方處理每張影像,並以適當的統計檢定比較各處理組。針對整個實驗提問的功能預計稍後在 Plus 中推出。

資料來源

快速解答

最適合:需要從顯微影像與玻片影像取得標準計數、Ki67 或 IHC 分數及區域量測、不想撰寫腳本,並希望有紀錄可供出示的研究人員、核心設施與學生。

主要優勢:每個數字都來自本機工具、引用可跳回確切畫面、「不使用 AI 重新計算」、「不含影像」模式、可用於實驗記錄與方法段落的匯出、約 39 種格式,以及 14 種回答語言。

重要限制:僅供研究使用,並非診斷;只回答關於目前開啟影像的問題,且提問需要網路連線。

最後審閱:2026 年 11 月 6 日。

向您自己的玻片提問

下載 SlideScope,探索免費範例庫,然後訂閱(PayPal 或信用卡,訂閱時即收費,可隨時在帳戶中取消),即可從 1.23.0 版起在您自己的影像上使用 Ask Your Slide。

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