كيف يخزّن OME-TIFF القنوات وZ والزمن
يخزّن ملف OME-TIFF كل مستوى ثنائي الأبعاد كصورة TIFF واحدة، ويصفها في OME-XML داخل وصف الصورة الأولى: تحدد SizeC وSizeZ وSizeT وترتيب أبعاد DimensionOrder مثل XYZCT أيّ مستوى هو أيّ، وتحمل عناصر Channel الأسماء والألوان، ويحمل PhysicalSizeX حجم البكسل. ومنذ OME-TIFF 6، تحتفظ الصور الكبيرة بدقاتها المخفّضة في SubIFDs. يقرأ العارض كل ذلك، فيُفتح تسجيل زمني ثلاثي القنوات كثلاث قنوات ملوّنة مع شريط تمرير للزمن، لا ككومة من الصفحات.
ما الذي يفتحه
ما لا يفتحه
- ملفات SVS بضغط JPEG 2000 (ضغط Aperio 33003/33005)، وJPEG XR وJPEG XL لا يمكن فك ترميزها في المتصفح دون WebAssembly، وهذه الصفحة لا تحمّله.
- ليست مبنية على TIFF: تحتاج CZI وND2 وLIF وMRXS وVSI وIMS وOIB/OIR وDICOM إلى قارئ مكتبي. أما NDPI فشبيهة بـ TIFF لكنها تخزّن كل مستوى كصورة JPEG ضخمة واحدة، أكبر من أن تتسع لها علامة تبويب في المتصفح.
- ملفات OME-TIFF التي تحتوي على عدة سلاسل تُعرض منها السلسلة الأولى.
- لا قياسات ولا تعليقات توضيحية ولا تحليل: إنه عارض فقط.
لتلك الصيغ، وللقياس وإضافة التعليقات التوضيحية وعدّ الخلايا على صورك الخاصة، يفتح SlideScope 34 صيغة من صيغ المجاهر وماسحات الشرائح على Windows وMac. SlideScope، تطبيق المجهر المكتبي من الفريق نفسه، تطبيق مدفوع مع مكتبة عينات مجانية (بكل الأدوات) واشتراك لصورك الخاصة. بدائل مجانية: Fiji (Bio-Formats) وQuPath.
كيف يفتح ملفًا دون رفعه
عندما تختار ملفًا، يمنح المتصفح هذه الصفحة مقبضًا يشير إليه على قرصك. تقرأ الصفحة البايتات التي تحتاجها فقط: دليل TIFF أولًا، ثم البلاطات الخاصة بجزء الصورة الظاهر على الشاشة، وتفك ترميزها داخل الصفحة بقارئ TIFF مفتوح المصدر (geotiff). لا يُرسل أي شيء إلى خادم، لذا تبقى البيانات غير المنشورة والشرائح التي تحمل ملصقات المرضى على حاسوبك، وتُفتح الشرائح التي يبلغ حجمها عدة غيغابايت في ثوانٍ لأنها لا تُنسخ إلى أي مكان. أغلق علامة التبويب ويختفي الملف من الصفحة.
تحمّل الصفحة نصوصها البرمجية من slidescope.science إضافةً إلى عدّاد مشاهدات الصفحات الذي يحترم الخصوصية في الموقع؛ ولا يرى أيٌّ منهما صورتك أبدًا. تراخيص المصادر المفتوحة: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
أسئلة
كيف أفتح ملف OME-TIFF؟
في المتصفح، افتحه في هذه الصفحة. وعلى سطح المكتب، تقرأ Fiji (Bio-Formats) وQuPath وnapari وSlideScope جميعها ملفات OME-TIFF.
لماذا تظهر قنواتي بألوان مختلفة؟
يستخدم العارض الألوان الموجودة في OME-XML؛ والقنوات التي لا لون لها تأخذ الأحمر والأخضر والأزرق وهكذا. غيّر أي لون من مربع اللون بجوار القناة.
هل يقرأ أهرامات OME-TIFF؟
نعم، تُستخدم الدقات المخفّضة المخزنة في SubIFDs (في OME-TIFF 6 والأحدث، وفي ملفات التصدير من bfconvert وQuPath وvips) للتكبير.
ماذا لو كان الملف يحتوي على عدة سلاسل؟
يعرض العارض السلسلة الأولى ويذكر عدد السلاسل الموجودة. ولعرض البقية تحتاج إلى عارض مكتبي.
هل عارض OME-TIFF هذا مجاني؟
نعم، إنها مجانية ولا تحتاج إلى حساب. أما SlideScope، تطبيق المجهر المكتبي من الفريق نفسه، فهو تطبيق مدفوع مع مكتبة عينات مجانية (بكل الأدوات) واشتراك لصورك الخاصة.
تحتاج إلى أكثر مما يستطيعه المتصفح؟
يفتح SlideScope 34 صيغة من صيغ المجاهر وماسحات الشرائح على Windows وMac، منها CZI وND2 وLIF وMRXS وSVS بضغط JPEG 2000، مع القياس والتعليقات التوضيحية وعدّ الخلايا والتصدير إلى OME-TIFF بالدقة الكاملة. جرّب كل الأدوات مجانًا على العينات المدمجة؛ أما فتح صورك الخاصة فيتطلب اشتراكًا. هل حسمت قرارك؟ اشترك الآن.
نزّل SlideScope