פתחו קובץ OME-TIFF וקבלו את הממדים שלו נכון: ערוצים עם השמות והצבעים שלהם, מישורי Z ונקודות זמן מתוך ה-OME-XML, ניגודיות לכל ערוץ בנתונים של 16 ביט, ופירמידות SubIFD שאפשר להתקרב לתוכן. הדפדפן שלכם קורא את הקובץ; הוא אף פעם לא מועלה.
גררו לכאן קובץ OME-TIFF
נקרא על ידי הדפדפן שלכם, במחשב שלכם. שום דבר לא מועלה.
OME-TIFF שומר כל מישור דו-ממדי כתמונת TIFF אחת ומתאר אותם ב-OME-XML בתוך התיאור של התמונה הראשונה: SizeC, SizeZ, SizeT ו-DimensionOrder כמו XYZCT אומרים איזה מישור הוא איזה, רכיבי Channel נושאים שמות וצבעים, ו-PhysicalSizeX את גודל הפיקסל. מאז OME-TIFF 6, תמונות גדולות שומרות את הרזולוציות המופחתות שלהן ב-SubIFDs. המציג קורא את כל זה, כך שסדרת time-lapse עם 3 ערוצים נפתחת כשלושה ערוצים צבועים עם מחוון זמן ולא כערימה של עמודים.
| פותח | פרטים |
|---|---|
| TIFF ו-BigTIFF | מספרים שלמים ונקודה צפה של 8, 16 ו-32 ביט, גווני אפור, RGB ופלטה; ברצועות או באריחים; מרובה עמודים |
| OME-TIFF | ערוצים, Z וזמן מתוך ה-OME-XML, שמות וצבעים של ערוצים, גודל פיקסל ופירמידות SubIFD |
| ImageJ / Fiji TIFF | Hyperstacks (ערוצים, חתכים, פריימים) והכיול של ImageJ |
| Aperio SVS | שקופיות בדחיסת JPEG עם הפירמידה, התמונה הממוזערת, התווית והמאקרו שלהן, וה-MPP |
| TIFF פירמידלי | פירמידות כלליות באריחים (למשל מ-vips או מ-bfconvert) |
| דחיסה | ללא, LZW, Deflate (Zip), PackBits, JPEG, WebP |
לפורמטים האלה, ולמדידה, הוספת הערות וספירת תאים בתמונות שלכם, SlideScope פותח 34 פורמטים של מיקרוסקופים וסורקי שקופיות ב-Windows וב-Mac. SlideScope, אפליקציית המיקרוסקופיה למחשב של אותו צוות, היא אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית (כל הכלים) ומנוי לתמונות שלכם. חלופות חינמיות: Fiji (Bio-Formats) ו-QuPath.
כשאתם בוחרים קובץ, הדפדפן מעביר לדף הזה גישה אליו בדיסק שלכם. הדף קורא רק את הבתים שהוא צריך: קודם את ספריית ה-TIFF, ואז את האריחים של החלק בתמונה שמופיע על המסך, ומפענח אותם בתוך הדף בעזרת קורא TIFF בקוד פתוח (geotiff). שום דבר לא נשלח לשרת, כך שנתונים שלא פורסמו ושקופיות עם תוויות מטופלים נשארים במחשב שלכם, ושקופיות של כמה ג'יגה-בייט נפתחות בתוך שניות כי הן אף פעם לא מועתקות לשום מקום. סגרו את הלשונית והקובץ נעלם מהדף.
הדף טוען את הסקריפטים שלו מ-slidescope.science ואת מונה צפיות הדף של האתר, שמכבד את הפרטיות; אף אחד מהם לא רואה את התמונה שלכם. רישיונות קוד פתוח: image-tools-vendor.LICENSE.txt.
בדפדפן, פתחו אותו בדף הזה. במחשב, Fiji (Bio-Formats), QuPath, napari ו-SlideScope קוראים כולם OME-TIFF.
המציג משתמש בצבעים שב-OME-XML; ערוצים בלי צבע מקבלים אדום, ירוק, כחול וכן הלאה. אפשר לשנות כל צבע בתיבת הצבע שליד הערוץ.
כן, רזולוציות מופחתות שנשמרו ב-SubIFDs (OME-TIFF 6 ואילך, וייצואים מ-bfconvert, QuPath ו-vips) משמשות לזום.
המציג מציג את הסדרה הראשונה ואומר כמה סדרות יש. לאחרות נדרש מציג למחשב.
כן, הוא חינמי ולא דורש חשבון. SlideScope, אפליקציית המיקרוסקופיה למחשב של אותו צוות, היא אפליקציה בתשלום עם ספריית דוגמאות חינמית (כל הכלים) ומנוי לתמונות שלכם.
SlideScope פותח 34 פורמטים של מיקרוסקופים וסורקי שקופיות ב-Windows וב-Mac, ביניהם CZI, ND2, LIF, MRXS ו-SVS בדחיסת JPEG 2000, עם מדידה, הערות, ספירת תאים וייצוא OME-TIFF ברזולוציה מלאה. נסו כל כלי בחינם על הדוגמאות המובנות; כדי לפתוח את התמונות שלכם נדרש מנוי. כבר החלטתם? הירשמו למנוי עכשיו.